seq1 = pF1KE0589.tfa, 1386 bp
seq2 = pF1KE0589/gi568815581f_74267506.tfa (gi568815581f:74267506_74472597), 205092 bp

>pF1KE0589 1386
>gi568815581f:74267506_74472597 (Chr17)

1-243  (100001-100243)   100% ->
244-358  (101963-102077)   100% ->
359-517  (103016-103174)   100% ->
518-1386  (104224-105092)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGTATTATGATGTTGCCCATGGAGCAAAAGATCCAGTGGGTCCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGTATTATGATGTTGCCCATGGAGCAAAAGATCCAGTGGGTCCCCAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTCCCTGCAGGACATCACTGCTGTCCTGGGTACAGAAGCATATACTGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TTCCCTGCAGGACATCACTGCTGTCCTGGGTACAGAAGCATATACTGAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AAGACAAATCAATGGTGTCCCATGCACAGAAAAGCCAGCATTCTTGTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AAGACAAATCAATGGTGTCCCATGCACAGAAAAGCCAGCATTCTTGTCTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AGCCATTCCAGGTGGCTGAGGTCTCCACAGGTCACAGGGGGAAGCTGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AGCCATTCCAGGTGGCTGAGGTCTCCACAGGTCACAGGGGGAAGCTGGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCTCCGAATAAGGCCATCCAAGGACTCCAGCAGTTTCCGCCAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 100201 CCTCCGAATAAGGCCATCCAAGGACTCCAGCAGTTTCCGCCAGGTG...C

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    244   GCTCAGTGTCTGCGTAAGGATCCTGGGGCAAACAACCACTTGGAGAGC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101961 AGGCTCAGTGTCTGCGTAAGGATCCTGGGGCAAACAACCACTTGGAGAGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CAAGGGGTGAGAGGTACAGCTGGCGATGCTGACAGGGAGCTGCGGGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102011 CAAGGGGTGAGAGGTACAGCTGGCGATGCTGACAGGGAGCTGCGGGGACC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CTCAGAAAAAGCCACAG         CTGGCCAGCCACGAGTGACCCTGC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 102061 CTCAGAAAAAGCCACAGGTG...TAGCTGGCCAGCCACGAGTGACCCTGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TGCCCACGCCCCACGTCAGCGGGCTGAGCCAGGAGTTTGAAAGCCACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103040 TGCCCACGCCCCACGTCAGCGGGCTGAGCCAGGAGTTTGAAAGCCACTGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CCAGAGATCGCAGAGAGGTCCCCGTGTGTGGCTGGCGTCATCCCTGTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103090 CCAGAGATCGCAGAGAGGTCCCCGTGTGTGGCTGGCGTCATCCCTGTCAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CTACTACAGTGTCCTGCTGGGCTTGGGGCTGCCTG         TCAGCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 103140 CTACTACAGTGTCCTGCTGGGCTTGGGGCTGCCTGGTG...CAGTCAGCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TCCTGACCGCAGTGGCCCTGGCGCGCCTTGCCACCAGGACCAGGAGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104230 TCCTGACCGCAGTGGCCCTGGCGCGCCTTGCCACCAGGACCAGGAGGCCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 TCCTACTACTACCTTCTGGCGCTCACAGCCTCGGATATCATCATCCAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104280 TCCTACTACTACCTTCTGGCGCTCACAGCCTCGGATATCATCATCCAGGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GGTCATCGTGTTCGCGGGCTTCCTCCTGCAGGGAGCAGTGCTGGCCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104330 GGTCATCGTGTTCGCGGGCTTCCTCCTGCAGGGAGCAGTGCTGGCCCGCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 AGGTGCCCCAGGCTGTGGTGCGCACGGCCAACATCCTGGAGTTTGCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104380 AGGTGCCCCAGGCTGTGGTGCGCACGGCCAACATCCTGGAGTTTGCTGCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 AACCACGCCTCAGTCTGGATCGCCATCCTGCTCACGGTTGACCGCTACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104430 AACCACGCCTCAGTCTGGATCGCCATCCTGCTCACGGTTGACCGCTACAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 TGCCCTGTGCCACCCCCTGCACCATCGGGCCGCCTCGTCCCCAGGCCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104480 TGCCCTGTGCCACCCCCTGCACCATCGGGCCGCCTCGTCCCCAGGCCGGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 CCCGCCGGGCCATTGCTGCTGTCCTGAGTGCTGCCCTGTTGACCGGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104530 CCCGCCGGGCCATTGCTGCTGTCCTGAGTGCTGCCCTGTTGACCGGCATC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 CCCTTCTACTGGTGGCTGGACATGTGGAGAGACACCGACTCACCCAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104580 CCCTTCTACTGGTGGCTGGACATGTGGAGAGACACCGACTCACCCAGAAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 ACTGGACGAGGTCCTCAAGTGGGCTCACTGTCTCACTGTCTATTTCATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104630 ACTGGACGAGGTCCTCAAGTGGGCTCACTGTCTCACTGTCTATTTCATCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 CTTGTGGCGTGTTCCTGGTCACCAACTCGGCCATCATCCACCGGCTACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104680 CTTGTGGCGTGTTCCTGGTCACCAACTCGGCCATCATCCACCGGCTACGG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 AGGAGGGGCCGGAGTGGGCTGCAGCCCCGGGTGGGCAAGAGCACAGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104730 AGGAGGGGCCGGAGTGGGCTGCAGCCCCGGGTGGGCAAGAGCACAGCCAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 CCTCCTGGGCATCACCACACTGTTCACCCTCCTGTGGGCGCCCCGGGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104780 CCTCCTGGGCATCACCACACTGTTCACCCTCCTGTGGGCGCCCCGGGTCT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 TCGTCATGCTCTACCACATGTACGTGGCCCCTGTCCACCGGGACTGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104830 TCGTCATGCTCTACCACATGTACGTGGCCCCTGTCCACCGGGACTGGAGG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 GTCCACCTGGCCTTGGATGTGGCCAATATGGTGGCCATGCTCCACACGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104880 GTCCACCTGGCCTTGGATGTGGCCAATATGGTGGCCATGCTCCACACGGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1224 AGCCAACTTCGGCCTCTACTGCTTTGTCAGCAAGACTTTCCGGGCCACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104930 AGCCAACTTCGGCCTCTACTGCTTTGTCAGCAAGACTTTCCGGGCCACTG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1274 TCCGACAGGTCATCCACGATGCCTACCTGCCCTGCACTTTGGCATCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104980 TCCGACAGGTCATCCACGATGCCTACCTGCCCTGCACTTTGGCATCACAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1324 CCAGAGGGCATGGCGGCGAAGCCTGTGATGGAGCCTCCGGGACTCCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105030 CCAGAGGGCATGGCGGCGAAGCCTGTGATGGAGCCTCCGGGACTCCCCAC

   1400     .    :
   1374 AGGGGCAGAAGTG
        |||||||||||||
 105080 AGGGGCAGAAGTG