seq1 = pF1KE0582.tfa, 918 bp
seq2 = pF1KE0582/gi568815587f_49932874.tfa (gi568815587f:49932874_50133791), 200918 bp

>pF1KE0582 918
>gi568815587f:49932874_50133791 (Chr11)

1-918  (100001-100918)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAACAATGTAACAGAATTCATCCTGCTGGGCCTCACTCACAATCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAACAATGTAACAGAATTCATCCTGCTGGGCCTCACTCACAATCCAGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ACTGCAGAAATTCCTGTTTGTTATGTTTTTAATCACCTACTTGATCACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ACTGCAGAAATTCCTGTTTGTTATGTTTTTAATCACCTACTTGATCACAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGGCAGGTAACCTGCTCATCTCAGTCATCATCTTCATCAGCCCAGCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGGCAGGTAACCTGCTCATCTCAGTCATCATCTTCATCAGCCCAGCCCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGTTCCCCCATGTACCTTTTTCTGTCCTATTTATCCATTATAGATATTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
 100151 GGTTCCCCCATGTACCTTTTTCTGTCCTAGTTATCCATTATAGATATTTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTACTCTTCTTCCATAGCCCCTAAAATGATCTTTGACTTGATCTCTGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTACTCTTCTTCCATAGCCCCTAAAATGATCTTTGACTTGATCTCTGAAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACAACACCATATCCTTCAATGGCTGCATGACTCAGCTCTTCACAGAACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ACAACACCATATCCTTCAATGGCTGCATGACTCAGCTCTTCACAGAACAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TTCTTTGCGGCAGCTGAGACCATCTTATTAAGTGTCATGGCCTACGACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TTCTTTGCGGCAGCTGAGACCATCTTATTAAGTGTCATGGCCTACGACTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CTATGTGGCCATCTGTAAGCCCTTGCACTATGCAACCATCATGACCCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CTATGTGGCCATCTGTAAGCCCTTGCACTATGCAACCATCATGACCCAAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CTATGTGTGGATTCCTGATGGTGGTGGCTGGAATTCTGGGATTTGTGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CTATGTGTGGATTCCTGATGGTGGTGGCTGGAATTCTGGGATTTGTGCAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GGAGGAATCCAGACTTTGTTCATAGCCCAGTTACCATTCTGTGGCCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GGAGGAATCCAGACTTTGTTCATAGCCCAGTTACCATTCTGTGGCCCCAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TGTCATCGACCACTTTATGTGTGATTTAGTACCTCTTCTGGAGCTGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TGTCATCGACCACTTTATGTGTGATTTAGTACCTCTTCTGGAGCTGGCCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GCACAGACACTCACACTTTAGGGCCTCTGATTGCTGCCAACAGTGGGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GCACAGACACTCACACTTTAGGGCCTCTGATTGCTGCCAACAGTGGGTCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CTGTGTTTCCTCATTTTTTCCATACTGGATGCTTCCTATGTCATCATCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CTGTGTTTCCTCATTTTTTCCATACTGGATGCTTCCTATGTCATCATCTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GTGCTCCCTAAGGTCTCATAGCTCTGAAGGGCATCTCAAAGCTCTGTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GTGCTCCCTAAGGTCTCATAGCTCTGAAGGGCATCTCAAAGCTCTGTCTA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GTTGTGCCTCTCATATCTTCACTGTCATCTTATTCTTTGTCCCTTGTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GTTGTGCCTCTCATATCTTCACTGTCATCTTATTCTTTGTCCCTTGTTCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TACCTGTATCTAAGACCTCTAACCTCCTTCCCCACTGACAAAGCTGTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TACCTGTATCTAAGACCTCTAACCTCCTTCCCCACTGACAAAGCTGTGAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TGTGTTTTGCACCCTATTTACACCTATGTTGAACCCTTTAATCTACACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TGTGTTTTGCACCCTATTTACACCTATGTTGAACCCTTTAATCTACACTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TCAAAAATAAAGCAGTGAAAAATGTCATTAAGAAGCTCTGGAAGCAAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TCAAAAATAAAGCAGTGAAAAATGTCATTAAGAAGCTCTGGAAGCAAATA

    900     .    :    .
    901 ATGACAACTGATGATAAA
        ||||||||||||||||||
 100901 ATGACAACTGATGATAAA