seq1 = pF1KE0581.tfa, 849 bp
seq2 = pF1KE0581/gi568815589r_131160825.tfa (gi568815589r:131160825_131376179), 215355 bp

>pF1KE0581 849
>gi568815589r:131160825_131376179 (Chr9)

(complement)

1-323  (100001-100323)   100% ->
324-849  (114830-115355)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCTGGTTTTTTCTGTGACTGCTGGCCTTCCCTGGAGATCAGAGCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCTGGTTTTTTCTGTGACTGCTGGCCTTCCCTGGAGATCAGAGCGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTGTATGCCATGGGCTGTATTCAGAGCATCGGAGGCAAAGCCAGAGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTGTATGCCATGGGCTGTATTCAGAGCATCGGAGGCAAAGCCAGAGTCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCCGGGAAGGGATCACGGTGATTGATGTGAAAGCCTCCATCGACCCCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCCGGGAAGGGATCACGGTGATTGATGTGAAAGCCTCCATCGACCCCGTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCCACTAGCATCGATGAGTCCTCCAGCGTGGTGCTCCGCTACCGGACACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CCCACTAGCATCGATGAGTCCTCCAGCGTGGTGCTCCGCTACCGGACACC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCACTTCCGGGCCTCGGCCCAGGTGGTCATGCCGCCCATCCCCAAGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCACTTCCGGGCCTCGGCCCAGGTGGTCATGCCGCCCATCCCCAAGAAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGACTTGGGTAGTTGGCTGGATCCAGGCGTGCAGCCACATGGAGTTCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGACTTGGGTAGTTGGCTGGATCCAGGCGTGCAGCCACATGGAGTTCTAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AACCAGTACGGCGAGCAGGGCAT         GTCCAGCTGGGAGCTCCC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 100301 AACCAGTACGGCGAGCAGGGCATGTG...CAGGTCCAGCTGGGAGCTCCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CGACCTCCAGGAGGGCAAGATCCAAGCCATCAGCGACTCGGATGGGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114848 CGACCTCCAGGAGGGCAAGATCCAAGCCATCAGCGACTCGGATGGGGTGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 ACTACCCCTGGTACGGCAACACCACAGAGACCTGCACCATCGTGGGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114898 ACTACCCCTGGTACGGCAACACCACAGAGACCTGCACCATCGTGGGCCCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 ACCAAGAGGGACTCCAAGTTCATCATCAGCATGAATGACAACTTTTACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114948 ACCAAGAGGGACTCCAAGTTCATCATCAGCATGAATGACAACTTTTACCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CAGCGTCACATGGGCCGTGCCCGTCAGCGAGAGCAACGTGGCCAAGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114998 CAGCGTCACATGGGCCGTGCCCGTCAGCGAGAGCAACGTGGCCAAGCTCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 CCAATATCTACCGGGACCAGAGCTTCACCACCTGGCTGGTGGCCACCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115048 CCAATATCTACCGGGACCAGAGCTTCACCACCTGGCTGGTGGCCACCAAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 ACCTCCACCAACGACATGATCATCCTGCAGACGCTGCACTGGCGCATGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115098 ACCTCCACCAACGACATGATCATCCTGCAGACGCTGCACTGGCGCATGCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 GCTCAGCATCGAGGTGAACCCCAACCGGCCCCTGGGCCAGCGCGCCCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115148 GCTCAGCATCGAGGTGAACCCCAACCGGCCCCTGGGCCAGCGCGCCCGGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 TGCGGGAGCCCATCGCCCAGGACCAGCCCAAAATCCTGAGCAAGAATGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115198 TGCGGGAGCCCATCGCCCAGGACCAGCCCAAAATCCTGAGCAAGAATGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 CCCATCCCGCCCAGCGCCCTGGTCAAGCCCAATGCCAACGATGCCCAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115248 CCCATCCCGCCCAGCGCCCTGGTCAAGCCCAATGCCAACGATGCCCAGGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 CCTCATGTGGCGGCCCAAGTACGGGCAGCCGCTGGTGGTGATCCCGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115298 CCTCATGTGGCGGCCCAAGTACGGGCAGCCGCTGGTGGTGATCCCGCCCA

    850     .
    842 AGCACCGG
        ||||||||
 115348 AGCACCGG