seq1 = pF1KE0578.tfa, 621 bp
seq2 = pF1KE0578/gi568815575f_77347675.tfa (gi568815575f:77347675_77556519), 208845 bp

>pF1KE0578 621
>gi568815575f:77347675_77556519 (ChrX)

1-274  (100001-100274)   99% ->
275-378  (106483-106586)   100% ->
379-621  (108603-108845)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAGAGGTGGGGGGCGTCTTCGCCTCCTTGGACTGGGATCTACACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCAGAGGTGGGGGGCGTCTTCGCCTCCTTGGACTGGGATCTACACGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTTCTCCTCGTCTCTGGGGAACGTGCCCTTAGCTGACTCCCCAGGTTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTTCTCCTCGTCTCTGGGGAACGTGCCCTTAGCTGACTCCCCAGGTTTCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGAACGAGCGCCTGGGCCAAATCGAGGGGAAGCTGCAGCGTGGCTCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGAACGAGCGCCTGGGCCAAATCGAGGGGAAGCTGCAGCGTGGCTCACCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ACAGACTTCGCCCACCTGAAGGGGATCCTGCGGCGCCGCCAGCTCTACTG
        ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ACAGACTTCGCCCACCTAAAGGGGATCCTGCGGCGCCGCCAGCTCTACTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCGCACCGGCTTCCACCTGGAGATCTTCCCCAACGGCACGGTGCACGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCGCACCGGCTTCCACCTGGAGATCTTCCCCAACGGCACGGTGCACGGGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCCGCCACGACCACAGCCGCTTCG         GAATCCTGGAGTTTATC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 100251 CCCGCCACGACCACAGCCGCTTCGGTG...TAGGAATCCTGGAGTTTATC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AGCCTGGCTGTGGGGCTGATCAGCATCCGGGGAGTGGACTCTGGCCTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106500 AGCCTGGCTGTGGGGCTGATCAGCATCCGGGGAGTGGACTCTGGCCTGTA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CCTAGGAATGAATGAGCGAGGAGAACTCTATGGGTCG         AAGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 106550 CCTAGGAATGAATGAGCGAGGAGAACTCTATGGGTCGGTA...CAGAAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AACTCACACGTGAATGTGTTTTCCGGGAACAGTTTGAAGAAAACTGGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108607 AACTCACACGTGAATGTGTTTTCCGGGAACAGTTTGAAGAAAACTGGTAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 AACACCTATGCCTCAACCTTGTACAAACATTCGGACTCAGAGAGACAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108657 AACACCTATGCCTCAACCTTGTACAAACATTCGGACTCAGAGAGACAGTA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 TTACGTGGCCCTGAACAAAGATGGCTCACCCCGGGAGGGATACAGGACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108707 TTACGTGGCCCTGAACAAAGATGGCTCACCCCGGGAGGGATACAGGACTA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 AACGACACCAGAAATTCACTCACTTTTTACCCAGGCCTGTAGATCCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108757 AACGACACCAGAAATTCACTCACTTTTTACCCAGGCCTGTAGATCCTTCT

    600     .    :    .    :    .    :    .
    583 AAGTTGCCCTCCATGTCCAGAGACCTCTTTCACTATAGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108807 AAGTTGCCCTCCATGTCCAGAGACCTCTTTCACTATAGG