seq1 = pF1KE0577.tfa, 927 bp
seq2 = pF1KE0577/gi568815595f_97987173.tfa (gi568815595f:97987173_98188099), 200927 bp

>pF1KE0577 927
>gi568815595f:97987173_98188099 (Chr3)

1-927  (100001-100927)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATATATCAGAGGGAAATAAGACTCTTGTGACAGAGTTTGTTCTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGATATATCAGAGGGAAATAAGACTCTTGTGACAGAGTTTGTTCTCAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGGACTTACAGATCGACCATGGCTGCACGTCCTCTTCTTTGTTGTGTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGGACTTACAGATCGACCATGGCTGCACGTCCTCTTCTTTGTTGTGTTTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGGTGGTCTATCTCATCACCATGGTGGGCAACCTTGGACTGATAGTTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGGTGGTCTATCTCATCACCATGGTGGGCAACCTTGGACTGATAGTTCTA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATTTGGAACGACCCCCATCTTCATATGCCCATGTACTTATTCCTTGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ATTTGGAACGACCCCCATCTTCATATGCCCATGTACTTATTCCTTGGTGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TTTAGCCTTTTCAGATGCTTGTACTTCAACCTCTATAACCCCTAGGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TTTAGCCTTTTCAGATGCTTGTACTTCAACCTCTATAACCCCTAGGATGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGGTCAATTTCTTAGACAAGACTGCAATGATATCCCTAGCTGAGTGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGGTCAATTTCTTAGACAAGACTGCAATGATATCCCTAGCTGAGTGCATC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ACCCAGTTTTACTTTTTTGCTTCCAGTGCAACTACAGAATGCTTCCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ACCCAGTTTTACTTTTTTGCTTCCAGTGCAACTACAGAATGCTTCCTCCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGTGATGATGGCCTATGACCGCTATGTAGCCATATGTAATCCCTTGCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGTGATGATGGCCTATGACCGCTATGTAGCCATATGTAATCCCTTGCTTT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ATCCAGTGATGATGTCCAACAAACTCAGCGCTCAGTTGCTAAGTATTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ATCCAGTGATGATGTCCAACAAACTCAGCGCTCAGTTGCTAAGTATTTCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TATGTAATTGGTTTCCTGCATCCTCTGGTTCATGTGAGTTTACTATTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TATGTAATTGGTTTCCTGCATCCTCTGGTTCATGTGAGTTTACTATTGCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 ACTAACTTTCTGCAGGTTTAACATAATACATTATTTCTACTGTGAAATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 ACTAACTTTCTGCAGGTTTAACATAATACATTATTTCTACTGTGAAATTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TACAACTGTTCAAAATTTCATGCAATGGTCCATCTATTAACGCACTAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TACAACTGTTCAAAATTTCATGCAATGGTCCATCTATTAACGCACTAATG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ATATTTATTTTTGGTGCTTTTATACAAATACCCACTTTAATGACTATCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ATATTTATTTTTGGTGCTTTTATACAAATACCCACTTTAATGACTATCAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 AATCTCTTATACTCGTGTGCTCTTTGATATTCTGAAAAAAAAGTCTGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 AATCTCTTATACTCGTGTGCTCTTTGATATTCTGAAAAAAAAGTCTGAAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AGGGCAGAAGCAAAGCCTTCTCCACATGCGGCGCCCATCTGCTTTCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AGGGCAGAAGCAAAGCCTTCTCCACATGCGGCGCCCATCTGCTTTCTGTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TCATTGTACTACGGAACTCTGATCTTCATGTATGTGCGTCCTGCATCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TCATTGTACTACGGAACTCTGATCTTCATGTATGTGCGTCCTGCATCTGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CTTAGCTGAAGACCAAGACAAAGTGTATTCTCTGTTTTACACGATTATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CTTAGCTGAAGACCAAGACAAAGTGTATTCTCTGTTTTACACGATTATAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TTCCCCTGCTAAACCCATTTATTTACAGCTTGAGAAATAAAAAAGTCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TTCCCCTGCTAAACCCATTTATTTACAGCTTGAGAAATAAAAAAGTCATG

    900     .    :    .    :    .
    901 CATGCATTGAGAAGAGTTATAAGGAAG
        |||||||||||||||||||||||||||
 100901 CATGCATTGAGAAGAGTTATAAGGAAG