seq1 = pF1KE0575.tfa, 1056 bp
seq2 = pF1KE0575/gi568815579f_54433042.tfa (gi568815579f:54433042_54642580), 209539 bp

>pF1KE0575 1056
>gi568815579f:54433042_54642580 (Chr19)

1-34  (99757-99790)   100% ->
35-70  (100002-100037)   100% ->
71-349  (100691-100969)   99% ->
350-655  (102545-102850)   100% ->
656-948  (103829-104121)   100% ->
949-999  (104934-104984)   100% ->
1000-1056  (109483-109539)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCCCCAAACTCATCACCGTCCTGTGTCTGG         GATTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
  99757 ATGGCCCCCAAACTCATCACCGTCCTGTGTCTGGGTA...TAGGATTCTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 CCTGAACCAGAAGATCTGCCCACATGCGG         GTGCTCAGGACA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 100009 CCTGAACCAGAAGATCTGCCCACATGCGGGTG...CAGGTGCTCAGGACA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     83 AGTTCTCCCTGTCAGCCTGGCCGAGCCCTGTGGTTCCCCTAGGAGGACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100703 AGTTCTCCCTGTCAGCCTGGCCGAGCCCTGTGGTTCCCCTAGGAGGACGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 GTGACTCTCTCCTGTCATTCCCATCTTCGGTTTGTCATATGGACAATATT
        ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
 100753 GTGACTCTCTCCTGTCATTCCCATCTTCGATTTGTCATATGGACAATATT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CCAAACAACTGGGACCCGAAGCCATGAGTTGCACACTGGCCTTTCCAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100803 CCAAACAACTGGGACCCGAAGCCATGAGTTGCACACTGGCCTTTCCAACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ACATCACCATCAGCCCTGTGACCCCAGAACACGCAGGGACCTACAGATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100853 ACATCACCATCAGCCCTGTGACCCCAGAACACGCAGGGACCTACAGATGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GTTGGAATTTACAAGCACGCCTCAAAGTGGTCAGCTGAGAGCAACTCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100903 GTTGGAATTTACAAGCACGCCTCAAAGTGGTCAGCTGAGAGCAACTCCCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GAAGATCATCGTCACAG         GCTTGTTCACAAAACCCTCCATCT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 100953 GAAGATCATCGTCACAGGTA...CAGGCTTGTTCACAAAACCCTCCATCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CAGCGCACCCAAGCTCCCTGGTGCATGCAGGAGCCAGGGTGAGCCTGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102569 CAGCGCACCCAAGCTCCCTGGTGCATGCAGGAGCCAGGGTGAGCCTGCGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TGTCACTCAGAACTGGCCTTTGATGAATTTATCTTATACAAAGAGGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102619 TGTCACTCAGAACTGGCCTTTGATGAATTTATCTTATACAAAGAGGGGCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CATACAGCATTCCCAGCAGCTTGACCAGGGGATGGAGGCTGGGATCCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102669 CATACAGCATTCCCAGCAGCTTGACCAGGGGATGGAGGCTGGGATCCATT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 ACGTCGAGGCTGTCTTTTCCATGGGTCCTGTAACGCCTGCCCATGCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102719 ACGTCGAGGCTGTCTTTTCCATGGGTCCTGTAACGCCTGCCCATGCAGGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GCCTACAGATGCTGTGGTTGTTTCAGTCACTCCCGCTATGAGTGGTCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102769 GCCTACAGATGCTGTGGTTGTTTCAGTCACTCCCGCTATGAGTGGTCGGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 TCCCAGTGACCCCCTGGACATTGTGATCACAG         GAAAATACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 102819 TCCCAGTGACCCCCTGGACATTGTGATCACAGGTG...TAGGAAAATACA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 AAAAGCCTTCTCTCTCCACCCAGGTGGACCCCATGATGAGGCTGGGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103838 AAAAGCCTTCTCTCTCCACCCAGGTGGACCCCATGATGAGGCTGGGAGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 AAGTTGACCCTCTTCTGCAGCTCTGAAATCTCATTTGACCAGTACCATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103888 AAGTTGACCCTCTTCTGCAGCTCTGAAATCTCATTTGACCAGTACCATCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 GTTCAGACACGGGGTTGCTCATGGACAGTGGCTCAGTGGAGGGCAGAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103938 GTTCAGACACGGGGTTGCTCATGGACAGTGGCTCAGTGGAGGGCAGAGAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 ACAGGGAAGCATTCCAGGCCAACTTTTCTGTGGGCCGTGCAACGCCAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103988 ACAGGGAAGCATTCCAGGCCAACTTTTCTGTGGGCCGTGCAACGCCAGTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 CCTGGCGGGACCTATAGATGCTATGGTTCCTTCAATGACTCTCCCTATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104038 CCTGGCGGGACCTATAGATGCTATGGTTCCTTCAATGACTCTCCCTATAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 GCCCCCAGTGACCCGCTGCAACTTTACACCACAG         GAAACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 104088 GCCCCCAGTGACCCGCTGCAACTTTACACCACAGGTG...TAGGAAACAC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 TAAGAGTACTCCTCTGTCATTCACAGAATCCACCCCTGAATCTG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 104941 TAAGAGTACTCCTCTGTCATTCACAGAATCCACCCCTGAATCTGGTA...

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1000    ACACACCTCGCCCTCAAGGACAGTCCAGCAACCTGCATATGCTCACT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109480 CAGACACACCTCGCCCTCAAGGACAGTCCAGCAACCTGCATATGCTCACT

   1100     .    :
   1047 GGACTCTCAG
        ||||||||||
 109530 GGACTCTCAG