seq1 = pF1KE0572.tfa, 759 bp
seq2 = pF1KE0572/gi568815579r_54211331.tfa (gi568815579r:54211331_54412622), 201292 bp

>pF1KE0572 759
>gi568815579r:54211331_54412622 (Chr19)

(complement)

1-88  (100000-100086)   98% ->
89-373  (100475-100759)   100% ->
374-759  (100907-101292)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCACCATGGTCTCATCCATCTGCACAGCTGCAGCCAGTGGGAGGAGA
        |-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100000 A GGCACCATGGTCTCATCCATCTGCACAGCTGCAGCCAGTGGGAGGAGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGCCGTGAGCCCTGCCCTCATGGTTCTGCTCTGCCTCG         GGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 100049 CGCCGTGAGCCCTGCCCTCATGGTTCTGCTCTGCCTCGGTG...CAGGGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ACCTCTCCAAAGCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGGCTCTGTGATCAGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100478 ACCTCTCCAAAGCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGGCTCTGTGATCAGCCGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGGAACTCTGTGACCATCCGGTGTCAGGGGACCCTGGAGGCCCAGGAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100528 GGGAACTCTGTGACCATCCGGTGTCAGGGGACCCTGGAGGCCCAGGAATA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCGTCTGGTTAAAGAGGGAAGCCCAGAACCCTGGGACACACAGAACCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100578 CCGTCTGGTTAAAGAGGGAAGCCCAGAACCCTGGGACACACAGAACCCAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGGAGCCCAAGAACAAGGCCAGATTCTCCATCCCATCCATGACAGAGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100628 TGGAGCCCAAGAACAAGGCCAGATTCTCCATCCCATCCATGACAGAGCAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CATGCAGGGAGATACCGCTGTTACTACTACAGCCCTGCAGGCTGGTCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100678 CATGCAGGGAGATACCGCTGTTACTACTACAGCCCTGCAGGCTGGTCAGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GCCCAGCGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAG         GATTCTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 100728 GCCCAGCGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGTG...TAGGATTCTACA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ACAAACCCACCCTCTCAGCCCTGCCCAGTCCTGTGGTGACCTCAGGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100916 ACAAACCCACCCTCTCAGCCCTGCCCAGTCCTGTGGTGACCTCAGGAGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 AACGTGACCCTCCAGTGTGGCTCACGGCTGAGATTCGACAGGTTCATTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100966 AACGTGACCCTCCAGTGTGGCTCACGGCTGAGATTCGACAGGTTCATTCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GACTGAGGAAGGAGACCACAAGCTCTCCTGGACCTTGGACTCACAGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101016 GACTGAGGAAGGAGACCACAAGCTCTCCTGGACCTTGGACTCACAGCTGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 CCCCCAGTGGGCAGTTCCAGGCCCTGTTCCCTGTGGGCCCTGTGACCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101066 CCCCCAGTGGGCAGTTCCAGGCCCTGTTCCCTGTGGGCCCTGTGACCCCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 AGCCACAGGTGGATGCTCAGATGCTATGGCTCTCGCAGGCATATCCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101116 AGCCACAGGTGGATGCTCAGATGCTATGGCTCTCGCAGGCATATCCTGCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 GGTATGGTCAGAACCCAGTGACCTCCTGGAGATTCCGGTCTCAGGTGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101166 GGTATGGTCAGAACCCAGTGACCTCCTGGAGATTCCGGTCTCAGGTGAGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 AAGCCACAGTCTTCTCTAGTACAATTCAGGGAAGCCAGACAGGTTGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101216 AAGCCACAGTCTTCTCTAGTACAATTCAGGGAAGCCAGACAGGTTGTGGA

    750     .    :    .    :    .
    733 GAGCTTTACAGGCAGGGCAGCCCCTGC
        |||||||||||||||||||||||||||
 101266 GAGCTTTACAGGCAGGGCAGCCCCTGC