seq1 = pF1KE0571.tfa, 564 bp
seq2 = pF1KE0571/gi568815586r_465238.tfa (gi568815586r:465238_763498), 298261 bp

>pF1KE0571 564
>gi568815586r:465238_763498 (Chr12)

(complement)

1-165  (100001-100165)   100% <-
166-400  (197315-197549)   99% ->
401-564  (198098-198261)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAGGTCTGTCCCGCCAGCTGTGTGCTCTCTCCCACCCGAAGAAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCAGGTCTGTCCCGCCAGCTGTGTGCTCTCTCCCACCCGAAGAAAGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGCAGAGACTCAGACGGCGGAGCCTGGAGGAGCCCACGCAGTCTGTTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGCAGAGACTCAGACGGCGGAGCCTGGAGGAGCCCACGCAGTCTGTTCCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGCACCCGGTGCGTGTGAAGGGACTTGAGGGCAGCGAGATGGAATCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGCACCCGGTGCGTGTGAAGGGACTTGAGGGCAGCGAGATGGAATCAGCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AGAGAAAACATCGAC         CTTCAACCTGGAAGCTCCGACCCCAG
        |||||||||||||||<<<...<<<|| || ||||||||||||||||||||
 100151 AGAGAAAACATCGACCTT...CCCCTACAGCCTGGAAGCTCCGACCCCAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GAGCCAGCCCATCAACCTGAACCATTACGCCACCAAGAAGAGCGTGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 197341 GAGCCAGCCCATCAACCTGAACCATTACGCCACCAAGAAGAGCGTGGCGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGAGCATGCTGGACGTGGCCCTGTTCATGTCCAACGCCATGCGGCTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 197391 AGAGCATGCTGGACGTGGCCCTGTTCATGTCCAACGCCATGCGGCTGAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GCGGTGCTGGAGCAGGGACCATCCTCTCACTACTACACCACCCTGGTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 197441 GCGGTGCTGGAGCAGGGACCATCCTCTCACTACTACACCACCCTGGTCAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CCTCATCAGCCTCTCTCTGCTCCTGCAGGTGGTCATCGGTGTCCTGCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 197491 CCTCATCAGCCTCTCTCTGCTCCTGCAGGTGGTCATCGGTGTCCTGCTCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TGGTCATTG         CACGGCTGAACCTGAATGAGGTAGAAAAGCAG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 197541 TGGTCATTGGTG...CAGCACGGCTGAACCTGAATGAGGTAGAAAAGCAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 TGGCGACTCAACCAGCTCAACAACGCAGCCACCATCTTGGTCTTCTTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 198130 TGGCGACTCAACCAGCTCAACAACGCAGCCACCATCTTGGTCTTCTTCAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 TGTGGTCATCAATGTTTTCATTACAGCCTTCGGGGCACATAAAACAGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 198180 TGTGGTCATCAATGTTTTCATTACAGCCTTCGGGGCACATAAAACAGGGT

    550     .    :    .    :    .    :
    533 TCCTGGCTGCCAGGGCCTCAAGGAATCCTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||
 198230 TCCTGGCTGCCAGGGCCTCAAGGAATCCTCTC