seq1 = pF1KE0569.tfa, 582 bp
seq2 = pF1KE0569/gi568815597r_186343982.tfa (gi568815597r:186343982_186546482), 202501 bp

>pF1KE0569 582
>gi568815597r:186343982_186546482 (Chr1)

(complement)

1-57  (100001-100057)   100% ->
58-582  (101977-102501)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCTTCTCCTCAGAGTAGGAATGGCAAAGATTCAAAGGAACGAGTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCTTCTCCTCAGAGTAGGAATGGCAAAGATTCAAAGGAACGAGTCAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAGAAAG         ATGAGCATTCAAGAATATGAACTAATCCATAAAG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAGAAAGGTA...CAGATGAGCATTCAAGAATATGAACTAATCCATAAAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGAAAGAGGATGAAAACTGCCTTCGTAAATACCGTAGACAGTGTATGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102011 AGAAAGAGGATGAAAACTGCCTTCGTAAATACCGTAGACAGTGTATGCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GATATGCACCAGAAGCTGAGTTTTGGGCCTAGATATGGGTTTGTGTATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102061 GATATGCACCAGAAGCTGAGTTTTGGGCCTAGATATGGGTTTGTGTATGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCTGGAAACTGGAAAGCAATTCCTAGAAACAATTGAAAAGGAACTGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102111 GCTGGAAACTGGAAAGCAATTCCTAGAAACAATTGAAAAGGAACTGAAGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TCACCACAATTGTTGTTCACATTTATGAAGATGGTATTAAGGGTTGTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102161 TCACCACAATTGTTGTTCACATTTATGAAGATGGTATTAAGGGTTGTGAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GCTCTAAACAGTAGTTTAACATGCCTTGCAGCAGAATACCCTATAGTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102211 GCTCTAAACAGTAGTTTAACATGCCTTGCAGCAGAATACCCTATAGTTAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GTTTTGTAAAATAAAAGCTTCGAATACAGGTGCTGGGGACCGCTTTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102261 GTTTTGTAAAATAAAAGCTTCGAATACAGGTGCTGGGGACCGCTTTTCCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TAGATGTACTTCCTACACTGCTCATCTATAAAGGTGGGGAACTCATAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102311 TAGATGTACTTCCTACACTGCTCATCTATAAAGGTGGGGAACTCATAAGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 AATTTTATTAGTGTTGCTGAACAGTTTGCTGAAGAATTTTTTGCTGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102361 AATTTTATTAGTGTTGCTGAACAGTTTGCTGAAGAATTTTTTGCTGGGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 TGTGGAGTCTTTCCTAAATGAATATGGGTTACTACCTGAAAGAGAGGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102411 TGTGGAGTCTTTCCTAAATGAATATGGGTTACTACCTGAAAGAGAGGTAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :
    542 ATGTCCTAGAGCATACCAAAATAGAAGAAGAAGATGTTGAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102461 ATGTCCTAGAGCATACCAAAATAGAAGAAGAAGATGTTGAA