seq1 = pF1KE0564.tfa, 1344 bp
seq2 = pF1KE0564/gi568815581r_41360113.tfa (gi568815581r:41360113_41567325), 207213 bp

>pF1KE0564 1344
>gi568815581r:41360113_41567325 (Chr17)

(complement)

1-468  (100001-100468)   100% ->
469-551  (101150-101232)   100% ->
552-708  (101397-101553)   100% ->
709-870  (102883-103044)   100% ->
871-996  (103123-103248)   100% ->
997-1217  (104276-104496)   100% ->
1218-1344  (107087-107213)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACATCCTCCTGCTGTGTCACCAACAACTTGCAAGCCTCTCTCAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACATCCTCCTGCTGTGTCACCAACAACTTGCAAGCCTCTCTCAAGAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTGCCCCCGGCCTGCCTCGGTCTGTTCCAGCGGCGTGAACTGCCGGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTGCCCCCGGCCTGCCTCGGTCTGTTCCAGCGGCGTGAACTGCCGGCCTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGCTGTGCCTGGGCTATGTCTGCCAGCCCATGGCATGCCTGCCTTCGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGCTGTGCCTGGGCTATGTCTGCCAGCCCATGGCATGCCTGCCTTCGGTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TGCCTGCCCACCACCTTCCGGCCAGCCAGCTGCCTCTCCAAAACCTATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TGCCTGCCCACCACCTTCCGGCCAGCCAGCTGCCTCTCCAAAACCTATCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 ATCCAGTTCCTGCCAGGCAGCCAGTGGCATCTCCGGCTCCATGGGCCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 ATCCAGTTCCTGCCAGGCAGCCAGTGGCATCTCCGGCTCCATGGGCCCCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCAGCTGGTACAGCGAAGGGGCCTTCAATGGCAATGAGAAGGAAACCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCAGCTGGTACAGCGAAGGGGCCTTCAATGGCAATGAGAAGGAAACCATG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CAGTTCCTTAACGACCGCCTGGCCAGCTACCTGACGAGGGTGCGGCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CAGTTCCTTAACGACCGCCTGGCCAGCTACCTGACGAGGGTGCGGCAGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGAGCAGGAGAATGCGGAGCTGGAGAGCAGGATCCAAGAGGCCTCTCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGAGCAGGAGAATGCGGAGCTGGAGAGCAGGATCCAAGAGGCCTCTCACT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CCCAGGTGCTCACCATGACTCCTGACTACCAGTCTCATTTCAGGACCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CCCAGGTGCTCACCATGACTCCTGACTACCAGTCTCATTTCAGGACCATT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GAGGAGCTCCAGCAGAAG         ATTCTGTGTACCAAGGCAGAGAA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 100451 GAGGAGCTCCAGCAGAAGGTG...CAGATTCTGTGTACCAAGGCAGAGAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 TGCCAGGATGGTTGTGAACATTGATAATGCCAAACTGGCTGCCGATGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101173 TGCCAGGATGGTTGTGAACATTGATAATGCCAAACTGGCTGCCGATGACT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 TCAGGGCCAA         GTACGAGGCAGAGCTGGCCATGCGGCAGCTG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 101223 TCAGGGCCAAGTG...CAGGTACGAGGCAGAGCTGGCCATGCGGCAGCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GTGGAGGCCGACATCAATGGCCTGCGCAGGATCCTGGATGATCTCACTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101428 GTGGAGGCCGACATCAATGGCCTGCGCAGGATCCTGGATGATCTCACTCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 GTGCAAGGCTGACCTGGAGGCCCAGGTTGAGTCCCTGAAGGAGGAGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101478 GTGCAAGGCTGACCTGGAGGCCCAGGTTGAGTCCCTGAAGGAGGAGCTGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 TGTGCCTCAAAAAGAACCATGAGGAG         GAAGTCGGTTCCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 101528 TGTGCCTCAAAAAGAACCATGAGGAGGTG...CAGGAAGTCGGTTCCCTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 CGATGCCAGCTTGGGGACCGCCTTAACATCGAGGTGGACGCTGCACCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102898 CGATGCCAGCTTGGGGACCGCCTTAACATCGAGGTGGACGCTGCACCCCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 GGTGGACCTGACCAGGGTGCTGGAGGAGATGCGGTGTCAGTACGAGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102948 GGTGGACCTGACCAGGGTGCTGGAGGAGATGCGGTGTCAGTACGAGGCCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 TGGTGGAGGCCAACCGCAGGGACGTGGAGGAATGGTTCAATATGCAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 102998 TGGTGGAGGCCAACCGCAGGGACGTGGAGGAATGGTTCAATATGCAGGTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    871       ATGGAGGAGCTTAACCAACAGGTGGCCACAAGCTCTGAGCAGCT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103048 ...CAGATGGAGGAGCTTAACCAACAGGTGGCCACAAGCTCTGAGCAGCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 TCAGAACTACCAGTCAGACATCATTGACCTGAGACGCACGGTCAACACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103167 TCAGAACTACCAGTCAGACATCATTGACCTGAGACGCACGGTCAACACGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 TGGAGATCGAGCTGCAGGCCCAGCACAGCCTG         AGGGACTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 103217 TGGAGATCGAGCTGCAGGCCCAGCACAGCCTGGTG...TAGAGGGACTCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 CTGGAAAACACGCTGACGGAGAGTGAGGCCCGCTACAGCTCCCAGCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104285 CTGGAAAACACGCTGACGGAGAGTGAGGCCCGCTACAGCTCCCAGCTGGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 CCAGATGCAGTGCATGATCACCAACGTTGAGGCCCAGCTGGCTGAGATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104335 CCAGATGCAGTGCATGATCACCAACGTTGAGGCCCAGCTGGCTGAGATCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 GGGCTGACCTGGAGCGGCAGAACCAGGAGTACCAGGTGCTGCTGGACGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104385 GGGCTGACCTGGAGCGGCAGAACCAGGAGTACCAGGTGCTGCTGGACGTC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 CGGGCCCGGCTGGAGGGCGAGATCAACACGTACCGGAGCCTGCTGGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104435 CGGGCCCGGCTGGAGGGCGAGATCAACACGTACCGGAGCCTGCTGGAGAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1206 CGAGGACTGCAA         GCTGCCCTGTAACCCATGCTCCACTCCTT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 104485 CGAGGACTGCAAGTA...CAGGCTGCCCTGTAACCCATGCTCCACTCCTT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1247 CCTGCACCACCTGTGTGCCCTCCCCATGCGTGCCCCGCACCGTCTGTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107116 CCTGCACCACCTGTGTGCCCTCCCCATGCGTGCCCCGCACCGTCTGTGTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1297 CCACGCACTGTTGGCATGCCTTGCTCACCCTGCCCCCAGGGCCGCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107166 CCACGCACTGTTGGCATGCCTTGCTCACCCTGCCCCCAGGGCCGCTAC