seq1 = pF1KE0555.tfa, 1131 bp
seq2 = pF1KE0555/gi568815593r_115112405.tfa (gi568815593r:115112405_115362851), 250447 bp

>pF1KE0555 1131
>gi568815593r:115112405_115362851 (Chr5)

(complement)

1-140  (100001-100140)   100% ->
141-259  (109597-109715)   100% ->
260-327  (121246-121313)   100% ->
328-479  (124843-124994)   100% ->
480-612  (126330-126462)   100% ->
613-658  (131831-131876)   100% ->
659-843  (140844-141028)   100% ->
844-952  (145879-145987)   100% ->
953-1131  (150269-150447)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCCACTGAGGATGAGAGGCTAGCAGGGAGCGGTGAGGGAGAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGCCACTGAGGATGAGAGGCTAGCAGGGAGCGGTGAGGGAGAGCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTGGATTTCTTACGGGATCGGCACGTGCGATTTTTCCAGCGCTGCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTGGATTTCTTACGGGATCGGCACGTGCGATTTTTCCAGCGCTGCCTCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGGTTTTGCCGGAGCGCTATTCTTCACTCGAGACAAGCAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 100101 AGGTTTTGCCGGAGCGCTATTCTTCACTCGAGACAAGCAGGTA...TAGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TTGACAATTGCATTTTTTGCACTCTCCGGGCTGGATATGTTGGATTCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109598 TTGACAATTGCATTTTTTGCACTCTCCGGGCTGGATATGTTGGATTCCTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGATGTGGTGAACAAAGATGATATAATAGAGTGGATTTATTCCCTGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109648 AGATGTGGTGAACAAAGATGATATAATAGAGTGGATTTATTCCCTGCAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TCCTTCCCACAGAAGACA         GATCAAATCTAAATCGCTGTGGT
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 109698 TCCTTCCCACAGAAGACAGTG...TAGGATCAAATCTAAATCGCTGTGGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TTCCGAGGCTCTTCATACCTGGGTATTCCGTTCAATCCATCAAAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 121269 TTCCGAGGCTCTTCATACCTGGGTATTCCGTTCAATCCATCAAAGGTT..

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    328     GCTCCTGGAACAGCTCATCCTTATGATAGTGGCCACATTGCAATGA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121319 .TAGGCTCCTGGAACAGCTCATCCTTATGATAGTGGCCACATTGCAATGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CCTACACTGGCCTCTCATGCTTAGTTATTCTTGGAGACGACTTAAGCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124889 CCTACACTGGCCTCTCATGCTTAGTTATTCTTGGAGACGACTTAAGCCGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GTAAATAAAGAAGCTTGCTTAGCGGGCTTGAGAGCCCTTCAGCTGGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124939 GTAAATAAAGAAGCTTGCTTAGCGGGCTTGAGAGCCCTTCAGCTGGAAGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TGGGAG         TTTTTGTGCAGTACCTGAAGGCAGTGAAAATGACA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124989 TGGGAGGTA...CAGTTTTTGTGCAGTACCTGAAGGCAGTGAAAATGACA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TGCGATTTGTGTACTGTGCTTCCTGTATTTGCTATATGCTCAACAACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126365 TGCGATTTGTGTACTGTGCTTCCTGTATTTGCTATATGCTCAACAACTGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 TCAGGCATGGATATGAAAAAAGCCATCACCTATATTAGAAGGAGTATG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 126415 TCAGGCATGGATATGAAAAAAGCCATCACCTATATTAGAAGGAGTATGGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    613        TCCTATGACAATGGACTGGCACAGGGAGCTGGACTTGAATCTC
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126465 G...CAGTCCTATGACAATGGACTGGCACAGGGAGCTGGACTTGAATCTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 ATG         GAGGATCAACTTTTTGTGGCATTGCCTCACTATGTCTG
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131874 ATGGTA...CAGGAGGATCAACTTTTTGTGGCATTGCCTCACTATGTCTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 ATGGGTAAACTAGAAGAAGTTTTTTCAGAAAAAGAATTGAACAGGATAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140882 ATGGGTAAACTAGAAGAAGTTTTTTCAGAAAAAGAATTGAACAGGATAAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 GAGGTGGTGTATAATGAGGCAACAAAATGGTTATCATGGAAGACCTAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140932 GAGGTGGTGTATAATGAGGCAACAAAATGGTTATCATGGAAGACCTAATA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 AGCCTGTAGACACCTGTTATTCTTTTTGGGTGGGAGCAACTCTGAAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 140982 AGCCTGTAGACACCTGTTATTCTTTTTGGGTGGGAGCAACTCTGAAGGTA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    844       CTTCTAAAAATTTTCCAATACACTAACTTTGAGAAAAATAGAAA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141032 ...CAGCTTCTAAAAATTTTCCAATACACTAACTTTGAGAAAAATAGAAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 TTACATCTTATCAACTCAAGATCGCCTTGTAGGGGGATTTGCCAAGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145923 TTACATCTTATCAACTCAAGATCGCCTTGTAGGGGGATTTGCCAAGTGGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 CAGACAGTCATCCAG         ATGCTTTGCATGCATACTTTGGGATC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 145973 CAGACAGTCATCCAGGTA...CAGATGCTTTGCATGCATACTTTGGGATC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 TGTGGCCTGTCACTAATGGAGGAAAGTGGAATTTGTAAAGTTCATCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150295 TGTGGCCTGTCACTAATGGAGGAAAGTGGAATTTGTAAAGTTCATCCTGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 TCTGAATGTAAGCACACGGACTTCTGAACGCCTTCTAGATCTCCATCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150345 TCTGAATGTAAGCACACGGACTTCTGAACGCCTTCTAGATCTCCATCAAA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 GCTGGAAAACCAAGGACTCTAAACAATGCTCAGAGAATGTACATATCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150395 GCTGGAAAACCAAGGACTCTAAACAATGCTCAGAGAATGTACATATCTCC

   1200 
   1129 ACA
        |||
 150445 ACA