seq1 = pF1KE0549.tfa, 462 bp
seq2 = pF1KE0549/gi568815584f_55129217.tfa (gi568815584f:55129217_55329678), 200462 bp

>pF1KE0549 462
>gi568815584f:55129217_55329678 (Chr14)

1-462  (100001-100462)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCCAGCAGGAGGCTGATGAAGGAGCTTGAAGAAATCCGCAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGCCAGCAGGAGGCTGATGAAGGAGCTTGAAGAAATCCGCAAATG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGGGATGAAAAACTTCCGTAACATCCAGGTTGATGAAGCTAATTTATTGA
        |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGGGATGAAAAACTTCTGTAACATCCAGGTTGATGAAGCTAATTTATTGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTTGGCAAGGGCTTATTGTTCCTGACAACCCTCCATATGATAAGGGAGCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
 100101 CTTGGCAAGGGCTTATTGTTCCTGACAACCCTCCATATGATAAGGGGGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTCAGAATCGAAATCAACTTTCCAGCAGAGTACCCATTCAAACCACCGAA
        |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTCAGAATAGAAATCAACTTTCCAGCAGAGTACCCATTCAAACCACCGAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GATCACATTTAAAACAAAGATCTATCACCCAAACATCGACGAAAAGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GATCACATTTAAAACAAAGATCTATCACCCAAACATCGACGAAAAGGGGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGGTCTGTCTGCCAGTAATTAGTGCCGAAAACTGGAAGCCAGCAACCAAA
        ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
 100251 AGGTCTGTCTGCCAGTAATTAGTGCTGAAAACTGGAAGCCAGCAACCAAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ACCGACCAAGTAATCCAGTCCCTCATAGCACTGGTGAATGACCCCCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ACCGACCAAGTAATCCAGTCCCTCATAGCACTGGTGAATGACCCCCAGCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TGAGCACCCGCTTCGGGCTGACCTAGCTGAAGAATACTCTAAGGACCGTA
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CAAGCACCCGCTTCGGGCTGACCTAGCTGAAGAATACTCTAAGGACCGTA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AAAAATTCTGTAAGAATGCTGAAGAGTTTACAAAGAAATATGGGGAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AAAAATTCTGTAAGAATGCTGAAGAGTTTACAAAGAAATATGGGGAAAAG

    450     .    :
    451 CGACCTGTGGAC
        ||||||||||||
 100451 CGACCTGTGGAC