seq1 = pF1KE0546.tfa, 891 bp
seq2 = pF1KE0546/gi568815576r_36911030.tfa (gi568815576r:36911030_37118732), 207703 bp

>pF1KE0546 891
>gi568815576r:36911030_37118732 (Chr22)

(complement)

1-595  (100001-100595)   100% ->
596-891  (107408-107703)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTTCATCAGGTGCTCTACCGGGCGCTGGTCTCCACCAAGTGGCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGTTCATCAGGTGCTCTACCGGGCGCTGGTCTCCACCAAGTGGCTGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGAGTCCATCAGGACTGGCAAGCTGGGGCCCGGCCTGCGGGTGCTGGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGAGTCCATCAGGACTGGCAAGCTGGGGCCCGGCCTGCGGGTGCTGGACG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGTCCTGGTACTCACCAGGCACCCGAGAGGCCCGCAAGGAGTACCTCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGTCCTGGTACTCACCAGGCACCCGAGAGGCCCGCAAGGAGTACCTCGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CGCCACGTACCCGGCGCCTCTTTCTTTGACATAGAAGAGTGCCGGGACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CGCCACGTACCCGGCGCCTCTTTCTTTGACATAGAAGAGTGCCGGGACAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGCGTCGCCCTACGAGATGATGCTGCCCAGCGAGGCTGGCTTCGCCGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGCGTCGCCCTACGAGATGATGCTGCCCAGCGAGGCTGGCTTCGCCGAGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ATGTGGGCCGCCTGGGCATCAGCAACCACACGCACGTGGTGGTGTATGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ATGTGGGCCGCCTGGGCATCAGCAACCACACGCACGTGGTGGTGTATGAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GGTGAACACCTGGGCAGCTTCTATGCTCCCCGGGTCTGGTGGATGTTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GGTGAACACCTGGGCAGCTTCTATGCTCCCCGGGTCTGGTGGATGTTCCG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TGTGTTTGGCCACCGCACCGTATCAGTGCTCAATGGTGGCTTCCGGAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TGTGTTTGGCCACCGCACCGTATCAGTGCTCAATGGTGGCTTCCGGAACT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GGCTGAAGGAGGGCCACCCGGTGACATCCGAGCCCTCACGCCCAGAACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GGCTGAAGGAGGGCCACCCGGTGACATCCGAGCCCTCACGCCCAGAACCG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GCCGTCTTCAAAGCCACACTGGACCGCTCCCTGCTCAAGACCTACGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GCCGTCTTCAAAGCCACACTGGACCGCTCCCTGCTCAAGACCTACGAGCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GGTGCTGGAGAACCTTGAATCTAAGAGGTTCCAGCTGGTGGATTCAAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GGTGCTGGAGAACCTTGAATCTAAGAGGTTCCAGCTGGTGGATTCAAGGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CTCAAGGGCGGTTCCTGGGCACCGAGCCGGAGCCGGATGCAGTAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 100551 CTCAAGGGCGGTTCCTGGGCACCGAGCCGGAGCCGGATGCAGTAGGTA..

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    596     GACTGGACTCGGGCCATATCCGTGGTGCCGTCAACATGCCTTTCAT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 .CAGGACTGGACTCGGGCCATATCCGTGGTGCCGTCAACATGCCTTTCAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 GGACTTCCTGACTGAGGATGGCTTCGAGAAGGGCCCAGAAGAGCTCCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107454 GGACTTCCTGACTGAGGATGGCTTCGAGAAGGGCCCAGAAGAGCTCCGTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 CTCTGTTCCAGACCAAGAAGGTGGATCTCTCGCAGCCTCTCATTGCCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107504 CTCTGTTCCAGACCAAGAAGGTGGATCTCTCGCAGCCTCTCATTGCCACG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 TGCCGCAAGGGAGTCACCGCCTGCCACGTGGCCTTGGCTGCCTACCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107554 TGCCGCAAGGGAGTCACCGCCTGCCACGTGGCCTTGGCTGCCTACCTCTG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 CGGCAAGCCTGATGTGGCCGTGTACGATGGCTCCTGGTCCGAGTGGTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107604 CGGCAAGCCTGATGTGGCCGTGTACGATGGCTCCTGGTCCGAGTGGTTTC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 GCCGGGCCCCCCCAGAGAGCCGTGTGTCCCAGGGAAAGTCTGAGAAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107654 GCCGGGCCCCCCCAGAGAGCCGTGTGTCCCAGGGAAAGTCTGAGAAGGCC