seq1 = pF1KE0541.tfa, 663 bp
seq2 = pF1KE0541/gi568815576f_21542337.tfa (gi568815576f:21542337_21744172), 201836 bp

>pF1KE0541 663
>gi568815576f:21542337_21744172 (Chr22)

1-187  (100001-100187)   100% ->
188-384  (100526-100722)   100% ->
385-663  (101558-101836)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTGGAGCGCGGGCCGCGGCGGGGCTGCCTGGCCGGTGCTGTTGGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTGGAGCGCGGGCCGCGGCGGGGCTGCCTGGCCGGTGCTGTTGGGGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTGCTGGCGCTGTTAGTGCCGGGCGGTGGTGCCGCCAAGACCGGTGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTGCTGGCGCTGTTAGTGCCGGGCGGTGGTGCCGCCAAGACCGGTGCGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGCTCGTGACCTGCGGGTCGGTGCTGAAGCTGCTCAATACGCACCACCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGCTCGTGACCTGCGGGTCGGTGCTGAAGCTGCTCAATACGCACCACCGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTGCGGCTGCACTCGCACGACATCAAATACGGATCCG         GCAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 100151 GTGCGGCTGCACTCGCACGACATCAAATACGGATCCGGTG...CAGGCAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CGGCCAGCAATCGGTGACCGGCGTAGAGGCGTCGGACGACGCCAATAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100530 CGGCCAGCAATCGGTGACCGGCGTAGAGGCGTCGGACGACGCCAATAGCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ACTGGCGGATCCGCGGCGGCTCGGAGGGCGGGTGCCCGCGCGGGTCCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100580 ACTGGCGGATCCGCGGCGGCTCGGAGGGCGGGTGCCCGCGCGGGTCCCCG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GTGCGCTGCGGGCAGGCGGTGAGGCTCACGCATGTGCTTACGGGCAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100630 GTGCGCTGCGGGCAGGCGGTGAGGCTCACGCATGTGCTTACGGGCAAGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CCTGCACACGCACCACTTCCCGTCGCCGCTGTCCAACAACCAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 100680 CCTGCACACGCACCACTTCCCGTCGCCGCTGTCCAACAACCAGGTG...T

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    385   GAGGTGAGTGCCTTTGGGGAAGACGGCGAGGGCGACGACCTGGACCTA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101556 AGGAGGTGAGTGCCTTTGGGGAAGACGGCGAGGGCGACGACCTGGACCTA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 TGGACAGTGCGCTGCTCTGGACAGCACTGGGAGCGTGAGGCTGCTGTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101606 TGGACAGTGCGCTGCTCTGGACAGCACTGGGAGCGTGAGGCTGCTGTGCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CTTCCAGCATGTGGGCACCTCTGTGTTCCTGTCAGTCACGGGTGAGCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101656 CTTCCAGCATGTGGGCACCTCTGTGTTCCTGTCAGTCACGGGTGAGCAGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 ATGGAAGCCCCATCCGTGGGCAGCATGAGGTCCACGGCATGCCCAGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101706 ATGGAAGCCCCATCCGTGGGCAGCATGAGGTCCACGGCATGCCCAGTGCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 AACACGCACAATACGTGGAAGGCCATGGAAGGCATCTTCATCAAGCCTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101756 AACACGCACAATACGTGGAAGGCCATGGAAGGCATCTTCATCAAGCCTAG

    650     .    :    .    :    .    :
    633 TGTGGAGCCCTCTGCAGGTCACGATGAACTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||
 101806 TGTGGAGCCCTCTGCAGGTCACGATGAACTC