seq1 = pF1KE0537.tfa, 786 bp
seq2 = pF1KE0537/gi568815576r_41477321.tfa (gi568815576r:41477321_41689805), 212485 bp

>pF1KE0537 786
>gi568815576r:41477321_41689805 (Chr22)

(complement)

1-87  (100001-100087)   100% ->
88-205  (103613-103730)   100% ->
206-282  (105203-105279)   100% ->
283-374  (105434-105525)   100% ->
375-474  (105748-105847)   100% ->
475-550  (110925-111000)   100% ->
551-666  (111883-111998)   100% ->
667-786  (112366-112485)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAGTCACCGCCCAGGCAGCCCGCAGGAAGGAGCGCGTCCTCTGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCAGTCACCGCCCAGGCAGCCCGCAGGAAGGAGCGCGTCCTCTGCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTTTGACGTGGACGGGACCCTCACGCCGGCTCGCCAG         AAAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 100051 GTTTGACGTGGACGGGACCCTCACGCCGGCTCGCCAGGTA...TAGAAAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TTGACCCTGAGGTGGCCGCCTTCCTGCAGAAGCTACGAAGTAGAGTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103617 TTGACCCTGAGGTGGCCGCCTTCCTGCAGAAGCTACGAAGTAGAGTGCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATCGGTGTGGTGGGCGGCTCTGACTACTGTAAGATCGCTGAGCAGCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103667 ATCGGTGTGGTGGGCGGCTCTGACTACTGTAAGATCGCTGAGCAGCTGGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGACGGGGATGAAG         TCATTGAGAAGTTTGATTATGTGTTTG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 103717 TGACGGGGATGAAGGTA...AAGTCATTGAGAAGTTTGATTATGTGTTTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CCGAGAACGGGACGGTGCAGTATAAGCACGGACGACTGCTCTCCAAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105230 CCGAGAACGGGACGGTGCAGTATAAGCACGGACGACTGCTCTCCAAGCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283          ACCATCCAGAACCACCTGGGGGAGGAGCTGCTGCAGGACTT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105280 GTC...CAGACCATCCAGAACCACCTGGGGGAGGAGCTGCTGCAGGACTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GATCAACTTCTGCCTCAGCTACATGGCCCTGCTCAGGCTGCCCAAGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105475 GATCAACTTCTGCCTCAGCTACATGGCCCTGCTCAGGCTGCCCAAGAAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 G         TGGAACCTTCATCGAGTTCCGGAATGGCATGCTGAACATC
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105525 GGTG...CAGTGGAACCTTCATCGAGTTCCGGAATGGCATGCTGAACATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 TCGCCCATCGGCCGGAGCTGCACCCTGGAGGAGAGGATCGAGTTCTCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105788 TCGCCCATCGGCCGGAGCTGCACCCTGGAGGAGAGGATCGAGTTCTCCGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 ACTGGACAAG         AAAGAGAAGATCCGGGAGAAGTTCGTGGAAG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 105838 ACTGGACAAGGTA...CAGAAAGAGAAGATCCGGGAGAAGTTCGTGGAAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 CCCTGAAAACAGAGTTTGCTGGCAAAGGGCTGAGGTTCTCTCGAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 110956 CCCTGAAAACAGAGTTTGCTGGCAAAGGGCTGAGGTTCTCTCGAGGTA..

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551     GAGGCATGATCAGCTTTGACGTCTTCCCCGAGGGCTGGGACAAGCG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111006 .CAGGAGGCATGATCAGCTTTGACGTCTTCCCCGAGGGCTGGGACAAGCG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 CTACTGCCTGGATAGCCTGGACCAGGACAGCTTCGACACCATCCACTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111929 CTACTGCCTGGATAGCCTGGACCAGGACAGCTTCGACACCATCCACTTCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 TTGGGAACGAGACTAGCCCT         GGTGGGAACGACTTTGAGATC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 111979 TTGGGAACGAGACTAGCCCTGTG...CAGGGTGGGAACGACTTTGAGATC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 TTTGCCGACCCCCGGACTGTTGGCCACAGCGTGGTGTCTCCTCAGGACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112387 TTTGCCGACCCCCGGACTGTTGGCCACAGCGTGGTGTCTCCTCAGGACAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    738 GGTGCAGCGATGCCGGGAGATTTTCTTCCCAGAGACAGCTCATGAGGCG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112437 GGTGCAGCGATGCCGGGAGATTTTCTTCCCAGAGACAGCTCATGAGGCG