seq1 = pF1KE0535.tfa, 1227 bp
seq2 = pF1KE0535/gi568815576r_31519615.tfa (gi568815576r:31519615_31762208), 242594 bp

>pF1KE0535 1227
>gi568815576r:31519615_31762208 (Chr22)

(complement)

1-65  (100001-100065)   100% ->
66-145  (111431-111510)   100% ->
146-321  (113933-114108)   100% ->
322-558  (140324-140560)   100% ->
559-697  (140737-140875)   100% ->
698-844  (141067-141213)   100% ->
845-1005  (141496-141656)   100% ->
1006-1227  (142373-142594)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGACGTCCGTGGGGCACCGATGTCTGGGATTACTGCACGGGGTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGACGTCCGTGGGGCACCGATGTCTGGGATTACTGCACGGGGTCGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCCGTGGCGGAGCAG         CCTCCATCCCTGTGAGATCACTGCCC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCCGTGGCGGAGCAGGTA...TAGCCTCCATCCCTGTGAGATCACTGCCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGAGCCAATCCCTACAGCCCTTACGGAAGCTGCCTTTTAGAGCCTTTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111457 TGAGCCAATCCCTACAGCCCTTACGGAAGCTGCCTTTTAGAGCCTTTCGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ACAG         ATGCCAGAAAAATCCACACTGCCCCTGCCCGAACCAT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111507 ACAGGTA...CAGATGCCAGAAAAATCCACACTGCCCCTGCCCGAACCAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GTTCCTGCTGCGTCCCCTGCCCATTCTGTTGGTGACAGGCGGCGGGTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113970 GTTCCTGCTGCGTCCCCTGCCCATTCTGTTGGTGACAGGCGGCGGGTATG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CAGGGTACCGGCAGTATGAGAAGTACAGGGAGCGAGAGCTGGAGAAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114020 CAGGGTACCGGCAGTATGAGAAGTACAGGGAGCGAGAGCTGGAGAAGCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GGATTGGAGATTCCACCCAAACTTGCTGGTCACTGGGAG         GT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 114070 GGATTGGAGATTCCACCCAAACTTGCTGGTCACTGGGAGGTA...CAGGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GGCTTTGTACAAGTCAGTGCCAACGCGCTTGCTGTCACGGGCCTGGGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140326 GGCTTTGTACAAGTCAGTGCCAACGCGCTTGCTGTCACGGGCCTGGGGTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GCCTCAATCAGGTGGAGCTGCCACACTGGCTGCGCAGGCCCGTCTACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140376 GCCTCAATCAGGTGGAGCTGCCACACTGGCTGCGCAGGCCCGTCTACAGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CTGTACATCTGGACGTTTGGGGTGAACATGAAAGAGGCCGCTGTGGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140426 CTGTACATCTGGACGTTTGGGGTGAACATGAAAGAGGCCGCTGTGGAGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CCTGCATCACTACCGCAACCTCAGCGAGTTCTTCCGGCGCAAGCTGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140476 CCTGCATCACTACCGCAACCTCAGCGAGTTCTTCCGGCGCAAGCTGAAGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CGCAGGCCCGGCCTGTCTGTGGCCTGCACAGCGTG         ATTAGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 140526 CGCAGGCCCGGCCTGTCTGTGGCCTGCACAGCGTGGTG...CAGATTAGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CCATCGGATGGAAGGATCCTCAACTTTGGGCAGGTGAAGAACTGTGAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140743 CCATCGGATGGAAGGATCCTCAACTTTGGGCAGGTGAAGAACTGTGAGGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GGAGCAGGTAAAGGGGGTCACCTACTCCCTGGAGTCGTTCCTGGGCCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140793 GGAGCAGGTAAAGGGGGTCACCTACTCCCTGGAGTCGTTCCTGGGCCCGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 GTATGTGCACAGAGGACCTGCCCTTCCCACCAG         CCGCGTCG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 140843 GTATGTGCACAGAGGACCTGCCCTTCCCACCAGGTG...CAGCCGCGTCG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 TGTGACTCCTTCAAGAACCAGCTGGTCACCCGGGAAGGGAATGAGCTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141075 TGTGACTCCTTCAAGAACCAGCTGGTCACCCGGGAAGGGAATGAGCTCTA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 TCACTGTGTCATCTACCTGGCCCCTGGGGACTACCACTGCTTCCACTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141125 TCACTGTGTCATCTACCTGGCCCCTGGGGACTACCACTGCTTCCACTCCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 CCACCGACTGGACTGTGTCCCACCGGCGCCACTTCCCAG         GC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 141175 CCACCGACTGGACTGTGTCCCACCGGCGCCACTTCCCAGGTC...CAGGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 TCCCTGATGTCAGTGAACCCTGGCATGGCTCGCTGGATCAAAGAGCTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141498 TCCCTGATGTCAGTGAACCCTGGCATGGCTCGCTGGATCAAAGAGCTCTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CTGCCATAACGAGCGGGTGGTCCTGACGGGGGACTGGAAACATGGCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141548 CTGCCATAACGAGCGGGTGGTCCTGACGGGGGACTGGAAACATGGCTTCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 TCTCACTGACAGCTGTGGGGGCCACCAACGTGGGCTCCATTCGCATCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141598 TCTCACTGACAGCTGTGGGGGCCACCAACGTGGGCTCCATTCGCATCTAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 TTTGACCGG         GACCTGCACACAAACAGCCCAAGGCACAGCAA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 141648 TTTGACCGGGTA...CAGGACCTGCACACAAACAGCCCAAGGCACAGCAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 GGGCTCCTACAATGACTTCAGCTTCGTGACGCACACCAATAGAGAGGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142405 GGGCTCCTACAATGACTTCAGCTTCGTGACGCACACCAATAGAGAGGGCG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 TCCCCATGCGTAAGGGCGAGCACCTGGGCGAGTTCAACCTGGGCTCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142455 TCCCCATGCGTAAGGGCGAGCACCTGGGCGAGTTCAACCTGGGCTCCACC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 ATCGTGCTCATCTTCGAGGCCCCCAAGGACTTCAATTTCCAGCTGAAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142505 ATCGTGCTCATCTTCGAGGCCCCCAAGGACTTCAATTTCCAGCTGAAAAC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 AGGACAGAAAATCCGCTTTGGGGAAGCCCTGGGCTCGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142555 AGGACAGAAAATCCGCTTTGGGGAAGCCCTGGGCTCGCTC