seq1 = pF1KE0533.tfa, 618 bp
seq2 = pF1KE0533/gi568815576f_19332555.tfa (gi568815576f:19332555_19535959), 203405 bp

>pF1KE0533 618
>gi568815576f:19332555_19535959 (Chr22)

1-53  (100001-100053)   100% ->
54-137  (100711-100794)   100% ->
138-296  (102182-102340)   100% ->
297-618  (103084-103405)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACGGCCTCCGTGCTGCGAAGTATCTCGCTAGCCCTGCGCCCGACTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACGGCCTCCGTGCTGCGAAGTATCTCGCTAGCCCTGCGCCCGACTAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGG         GCTTCTGGGAACTTGGCAGACGCAGCTTAGAGAGACTC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGGGTG...CAGGCTTCTGGGAACTTGGCAGACGCAGCTTAGAGAGACTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ACCAGCGAGCGTCATTGTTGTCTTTCTGGGAACTCATTCCCATGAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 100749 ACCAGCGAGCGTCATTGTTGTCTTTCTGGGAACTCATTCCCATGAGGTA.

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    138      ATCAGAACCTCTTCGAAAAAAGAAGAAGGTAGATCCTAAAAAAGA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100799 ..TAGATCAGAACCTCTTCGAAAAAAGAAGAAGGTAGATCCTAAAAAAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CCAAGAAGCAAAGGAGCGCTTGAAAAGGAAGATCCGAAAACTGGAAAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102227 CCAAGAAGCAAAGGAGCGCTTGAAAAGGAAGATCCGAAAACTGGAAAAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CTACTCAAGAGCTAATTCCTATTGAAGATTTTATTACCCCTCTAAAGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102277 CTACTCAAGAGCTAATTCCTATTGAAGATTTTATTACCCCTCTAAAGTTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TTGGATAAAGCAAG         AGAGCGGCCTCAGGTGGAGCTCACCTT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 102327 TTGGATAAAGCAAGGTA...CAGAGAGCGGCCTCAGGTGGAGCTCACCTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TGAGGAGACTGAGAGGAGAGCTCTGCTTCTGAAGAAGTGGTCCTTGTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103111 TGAGGAGACTGAGAGGAGAGCTCTGCTTCTGAAGAAGTGGTCCTTGTACA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AGCAGCAAGAGCGTAAGATGGAGAGGGACACCATCAGGGCTATGCTAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103161 AGCAGCAAGAGCGTAAGATGGAGAGGGACACCATCAGGGCTATGCTAGAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GCCCAGCAGGAAGCTCTGGAGGAACTGCAACTGGAATCCCCGAAGCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103211 GCCCAGCAGGAAGCTCTGGAGGAACTGCAACTGGAATCCCCGAAGCTCCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TGCTGAGGCCATCAAGCGGGATCCTAACCTGTTCCCCTTTGAGAAGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103261 TGCTGAGGCCATCAAGCGGGATCCTAACCTGTTCCCCTTTGAGAAGGAAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GGCCACATTACACACCACCGATCCCTAACTACCAACCCCCTGAAGGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103311 GGCCACATTACACACCACCGATCCCTAACTACCAACCCCCTGAAGGCAGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    574 TACAATGACATCACCAAGGTGTACACACAAGTGGAGTTTAAGAGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103361 TACAATGACATCACCAAGGTGTACACACAAGTGGAGTTTAAGAGA