seq1 = pF1KE0519.tfa, 576 bp
seq2 = pF1KE0519/gi568815576f_31087095.tfa (gi568815576f:31087095_31304583), 217489 bp

>pF1KE0519 576
>gi568815576f:31087095_31304583 (Chr22)

1-176  (100001-100176)   100% ->
177-195  (105590-105608)   100% ->
196-308  (108375-108487)   100% ->
309-363  (109842-109896)   100% ->
364-481  (114404-114521)   100% ->
482-576  (117395-117489)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAAGCAAGGGGCCCTCGGCCTCTGCATCTCCTGAGAACTCCAGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCAAGCAAGGGGCCCTCGGCCTCTGCATCTCCTGAGAACTCCAGTGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGGGGGGCCCAGTGGGAGCAGCAATGGCGCTGGCGAGAGCGGAGGGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGGGGGGCCCAGTGGGAGCAGCAATGGCGCTGGCGAGAGCGGAGGGCAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACAGCACTTTCGAGTGCAACATCTGCTTGGACACAGCCAAGGATGCCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACAGCACTTTCGAGTGCAACATCTGCTTGGACACAGCCAAGGATGCCGTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATCAGCCTGTGTGGCCACCTCTTCTG         TTGGCCGTGTTTACA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 100151 ATCAGCCTGTGTGGCCACCTCTTCTGGTC...CAGTTGGCCGTGTTTACA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TCAG         TGGTTGGAGACCAGACCTAACAGACAGGTGTGTCCTG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105605 TCAGGTA...CAGTGGTTGGAGACCAGACCTAACAGACAGGTGTGTCCTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TTTGCAAAGCTGGCATCAGCCGAGACAAGGTCATCCCCCTCTATGGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108412 TTTGCAAAGCTGGCATCAGCCGAGACAAGGTCATCCCCCTCTATGGAAGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GGCAGCACTGGGCAACAGGACCCCAG         AGAGAAGACCCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 108462 GGCAGCACTGGGCAACAGGACCCCAGGTG...CAGAGAGAAGACCCCTCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TCGTCCTCAAGGACAGAGGCCAGAGCCGGAGAATAGAGGG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 109857 TCGTCCTCAAGGACAGAGGCCAGAGCCGGAGAATAGAGGGGTG...CAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 GATTTCAAGGATTTGGATTTGGAGATGGTGGCTTCCAGATGTCTTTTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114405 GATTTCAAGGATTTGGATTTGGAGATGGTGGCTTCCAGATGTCTTTTGGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 ATTGGGGCATTTCCCTTTGGGATATTTGCCACAGCATTTAATATAAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114455 ATTGGGGCATTTCCCTTTGGGATATTTGCCACAGCATTTAATATAAATGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TGGGCGGCCTCCTCCAG         CTGTCCCTGGGACACCCCAGTATG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 114505 TGGGCGGCCTCCTCCAGGTA...CAGCTGTCCCTGGGACACCCCAGTATG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 TGGACGAGCAGTTCCTGTCACGCCTCTTCCTATTTGTGGCCCTGGTGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117419 TGGACGAGCAGTTCCTGTCACGCCTCTTCCTATTTGTGGCCCTGGTGATC

    600     .    :    .    :
    556 ATGTTCTGGCTCCTGATTGCC
        |||||||||||||||||||||
 117469 ATGTTCTGGCTCCTGATTGCC