seq1 = pF1KE0510.tfa, 705 bp
seq2 = pF1KE0510/gi568815576f_28642096.tfa (gi568815576f:28642096_28857166), 215071 bp

>pF1KE0510 705
>gi568815576f:28642096_28857166 (Chr22)

1-236  (100001-100236)   100% ->
237-333  (101787-101883)   100% ->
334-423  (102520-102609)   100% ->
424-568  (103769-103913)   100% ->
569-616  (109146-109193)   100% ->
617-705  (114983-115071)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTGGCGGGGGAGAGCCGGGGCTTTGCTCCGGGTGTGGGGGTTTTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTGGCGGGGGAGAGCCGGGGCTTTGCTCCGGGTGTGGGGGTTTTGGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GACAGGGGTTCCCAGAAGGAGACCGCTAAGCTGCGATGCTGCGTCGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GACAGGGGTTCCCAGAAGGAGACCGCTAAGCTGCGATGCTGCGTCGCAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGGGAAGCAATTATCCCCGCTGTTGGAACTGCGGCGGCCCATGGGGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGGGAAGCAATTATCCCCGCTGTTGGAACTGCGGCGGCCCATGGGGCCCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGGCGGGAGGACAGGTTCTTCTGCCCACAGTGCCGAGCGCTGCAGGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGGCGGGAGGACAGGTTCTTCTGCCCACAGTGCCGAGCGCTGCAGGCACC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGACCCCACTCGAGACTACTTCAGCCTTATGGACTG         CAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 100201 TGACCCCACTCGAGACTACTTCAGCCTTATGGACTGGTA...CAGCAACC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GTTCCTTCAGAGTTGATACAGCGAAGCTCCAGCACAGGTACCAGCAACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101792 GTTCCTTCAGAGTTGATACAGCGAAGCTCCAGCACAGGTACCAGCAACTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CAGCGTCTTGTCCACCCAGATTTCTTCAGCCAGAGGTCTCAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 101842 CAGCGTCTTGTCCACCCAGATTTCTTCAGCCAGAGGTCTCAGGTA...CA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    334  ACTGAAAAGGACTTCTCAGAGAAGCATTCGACCCTGGTGAATGATGCCT
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102519 GACTGAAAAGGACTTCTCAGAGAAGCATTCGACCCTGGTGAATGATGCCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ATAAGACCCTCCTGGCCCCCCTGAGCAGAGGACTGTACCTT         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 102569 ATAAGACCCTCCTGGCCCCCCTGAGCAGAGGACTGTACCTTGTA...TAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CTAAAGCTCCATGGAATAGAGATTCCTGAAAGGACAGATTATGAAATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103769 CTAAAGCTCCATGGAATAGAGATTCCTGAAAGGACAGATTATGAAATGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CAGGCAATTCCTCATAGAAATAATGGAAATCAATGAAAAACTCGCAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103819 CAGGCAATTCCTCATAGAAATAATGGAAATCAATGAAAAACTCGCAGAAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CTGAAAGTGAAGCTGCCATGAAAGAGATTGAATCCATTGTCAAAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 103869 CTGAAAGTGAAGCTGCCATGAAAGAGATTGAATCCATTGTCAAAGGTG..

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    569     CTAAACAGAAAGAATTTACTGACAATGTGAGCAGTGCTTTTGAACA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103919 .CAGCTAAACAGAAAGAATTTACTGACAATGTGAGCAGTGCTTTTGAACA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 AG         ATGACTTTGAAGAAGCCAAGGAAATTTTGACAAAGATGA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109192 AGGTA...CAGATGACTTTGAAGAAGCCAAGGAAATTTTGACAAAGATGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 GATACTTTTCAAATATAGAAGAAAAGATCAAGTTAAAGAAGATTCCCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115022 GATACTTTTCAAATATAGAAGAAAAGATCAAGTTAAAGAAGATTCCCCTT