seq1 = pF1KE0509.tfa, 510 bp
seq2 = pF1KE0509/gi568815576f_28681060.tfa (gi568815576f:28681060_28886323), 205264 bp

>pF1KE0509 510
>gi568815576f:28681060_28886323 (Chr22)

1-26  (91791-91818)   92% ->
27-137  (100003-100113)   100% ->
138-275  (102449-102586)   100% ->
276-510  (105030-105264)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTGCGCTCGGCCGGCCCTTCAG           TGGCCTTTCCATA
        ||||||||||||||||||||||||||-->>>...>>>|||||||||||||
  91791 ATGGCTGCGCTCGGCCGGCCCTTCAGCGGCC...TAGTGGCCTTTCCATA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     40 CCTGGGATATTAGATGTTATTTGTGAAGAAATGGATCAGACAACTGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100016 CCTGGGATATTAGATGTTATTTGTGAAGAAATGGATCAGACAACTGGAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     90 ACCACAGTGTGAAGTTGCCCGAAGGAAGCTTCAGGAGATTGAGGACAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 100066 ACCACAGTGTGAAGTTGCCCGAAGGAAGCTTCAGGAGATTGAGGACAGGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    138        GATAATTGATGAAGATGAAGAAGTTGAAGCTGACAGAAATGTT
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100116 A...TAGGATAATTGATGAAGATGAAGAAGTTGAAGCTGACAGAAATGTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    181 AACCATCTCCCCAGTCTTGTCCTTTCTGATACCATGAAAACAGGTTTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102492 AACCATCTCCCCAGTCTTGTCCTTTCTGATACCATGAAAACAGGTTTGAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    231 GAGGGAATTTGATGAAGTTTTTACAAAGAAAATGATTGAGTCTAT     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 102542 GAGGGAATTTGATGAAGTTTTTACAAAGAAAATGATTGAGTCTATGTA..

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    276     GAGCCGTCCTTCCATGGAGCTTGTTCTCTGGAAACCCCTCCCTGAA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102592 .TAGGAGCCGTCCTTCCATGGAGCTTGTTCTCTGGAAACCCCTCCCTGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    322 CTCCTTTCTGATAAGCCAAAGCCATCCTCTAATACTAAGAACTATACAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105076 CTCCTTTCTGATAAGCCAAAGCCATCCTCTAATACTAAGAACTATACAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    372 AGAGAGCCAAGCTAAGCATGTAGCTGCTGGCACTGCCTTCCCTCAGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105126 AGAGAGCCAAGCTAAGCATGTAGCTGCTGGCACTGCCTTCCCTCAGAGAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    422 CTGAACTGTTTTCGGAACCTCGGCCAACAGGGATGTCTCTTTATAATAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105176 CTGAACTGTTTTCGGAACCTCGGCCAACAGGGATGTCTCTTTATAATAGT

    500     .    :    .    :    .    :    .
    472 TTGGAGACAGCTACTAGCACAGAAGAAGAGATGGAACTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105226 TTGGAGACAGCTACTAGCACAGAAGAAGAGATGGAACTC