seq1 = pF1KE0508.tfa, 504 bp
seq2 = pF1KE0508/gi568815576r_41501100.tfa (gi568815576r:41501100_41720839), 219740 bp

>pF1KE0508 504
>gi568815576r:41501100_41720839 (Chr22)

(complement)

1-88  (100001-100088)   100% ->
89-110  (112979-113000)   100% ->
111-180  (113509-113578)   100% ->
181-290  (116687-116796)   100% ->
291-413  (117459-117581)   100% ->
414-504  (119650-119740)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGCCGCCGAATCTCTATCCGGTGAAGCTCTACGTGTACGACCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGCCGCCGAATCTCTATCCGGTGAAGCTCTACGTGTACGACCTGTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAAAGGCCTGGCCCGGCGGCTCAGCCCCATCATGCTGG         GGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 100051 CAAAGGCCTGGCCCGGCGGCTCAGCCCCATCATGCTGGGTG...CAGGGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AACAACTGGAAGGCATCTG         GCACACATCCATAGTTGTGCAC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 112982 AACAACTGGAAGGCATCTGGTA...CAGGCACACATCCATAGTTGTGCAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 AAGGATGAGTTCTTCTTCGGCAGTGGTGGTATCTCCAGCTGCCCCCCG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 113531 AAGGATGAGTTCTTCTTCGGCAGTGGTGGTATCTCCAGCTGCCCCCCGGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    181        GGAGGGACATTGCTTGGGCCTCCAGACTCTGTGGTTGATGTGG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113581 G...TAGGGAGGGACATTGCTTGGGCCTCCAGACTCTGTGGTTGATGTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 GGAGTACAGAAGTCACAGAAGAAATCTTTCTGGAGTACCTCTCCTCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116730 GGAGTACAGAAGTCACAGAAGAAATCTTTCTGGAGTACCTCTCCTCCCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GGGGAGTCCCTGTTCCG         AGGTGAGGCCTACAACCTCTTTGA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 116780 GGGGAGTCCCTGTTCCGGTG...CAGAGGTGAGGCCTACAACCTCTTTGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 ACACAATTGTAACACCTTCAGCAACGAAGTGGCACAGTTCCTGACTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117483 ACACAATTGTAACACCTTCAGCAACGAAGTGGCACAGTTCCTGACTGGGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 GGAAGATTCCTTCTTACATCACAGACCTGCCCTCTGAAGTTCTCTCCAC 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 117533 GGAAGATTCCTTCTTACATCACAGACCTGCCCTCTGAAGTTCTCTCCACG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    414         GCCCTTTGGACAGGCACTTCGGCCCCTCCTGGACTCCATTCA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117583 TA...CAGGCCCTTTGGACAGGCACTTCGGCCCCTCCTGGACTCCATTCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    456 GATCCAGCCTCCAGGAGGGAGCTCCGTGGGCAGACCCAACGGCCAGAGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119692 GATCCAGCCTCCAGGAGGGAGCTCCGTGGGCAGACCCAACGGCCAGAGC