seq1 = pF1KE0506.tfa, 987 bp
seq2 = pF1KE0506/gi568815576r_30185623.tfa (gi568815576r:30185623_30389497), 203875 bp

>pF1KE0506 987
>gi568815576r:30185623_30389497 (Chr22)

(complement)

1-113  (100001-100113)   100% ->
114-184  (100722-100792)   100% ->
185-372  (101938-102125)   100% ->
373-505  (102211-102343)   100% ->
506-629  (102550-102673)   100% ->
630-743  (103122-103235)   100% ->
744-826  (103400-103482)   100% ->
827-921  (103572-103666)   100% ->
922-987  (103810-103875)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGCTGCACATCCTAGAACACCGGGTGCGGGTGCTGAGCGTCGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGCTGCACATCCTAGAACACCGGGTGCGGGTGCTGAGCGTCGCCCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCCCGGTCTCTGGCTCTACACCCACCCGCTCATCAAGCTGCTCTTCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TCCCGGTCTCTGGCTCTACACCCACCCGCTCATCAAGCTGCTCTTCCTGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCCGCCGCAGCCG         GTGCAAGTTCTTCAGCCTGACGGAGACC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCCGCCGCAGCCGGTG...CAGGTGCAAGTTCTTCAGCCTGACGGAGACC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CCTGAGGATTACACGCTTATGGTGGACGAGGAGGGCTTTAAAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 100750 CCTGAGGATTACACGCTTATGGTGGACGAGGAGGGCTTTAAAGGTG...C

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    185   AGCTGCCCCCATCTGAGTTCCTGCAAGTAGCTGAGGCCACATGGCTGG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101936 AGAGCTGCCCCCATCTGAGTTCCTGCAAGTAGCTGAGGCCACATGGCTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TGCTGAACGTGTCGTCTCACAGCGGTGCGGCAGTGCAGGCTGCTGGGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101986 TGCTGAACGTGTCGTCTCACAGCGGTGCGGCAGTGCAGGCTGCTGGGGTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ACCAAGATCGCCCGTTCGGTCATCGCGCCACTGGCCGAGCACCACGTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102036 ACCAAGATCGCCCGTTCGGTCATCGCGCCACTGGCCGAGCACCACGTGTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGTGCTGATGCTGTCCACTTACCAGACGGACTTCATCCTG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 102086 TGTGCTGATGCTGTCCACTTACCAGACGGACTTCATCCTGGTG...CAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TGCGGGAGCAGGACCTGTCCGTGGTGATCCACACGCTGGCCCAGGAGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102212 TGCGGGAGCAGGACCTGTCCGTGGTGATCCACACGCTGGCCCAGGAGTTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GACATTTACCGCGAGGTGGGCGGAGAGCCTGTGCCTGTGACGAGGGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102262 GACATTTACCGCGAGGTGGGCGGAGAGCCTGTGCCTGTGACGAGGGATGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TTCCAGCAATGGCTTTCCCCGCACTCAGCATG         GGCCCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 102312 TTCCAGCAATGGCTTTCCCCGCACTCAGCATGGTG...CAGGGCCCAGCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 CCACGGTGCATCCCATCCAGAGCCCACAGAACCGCTTCTGTGTCCTCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102559 CCACGGTGCATCCCATCCAGAGCCCACAGAACCGCTTCTGTGTCCTCACA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CTGGACCCTGAGACGCTTCCAGCCATCGCCACCACCCTCATAGATGTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102609 CTGGACCCTGAGACGCTTCCAGCCATCGCCACCACCCTCATAGATGTCCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CTTCTACTCGCACAG         CACCCCCAAGGAGGCAGCCTCTAGCA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 102659 CTTCTACTCGCACAGGTG...CAGCACCCCCAAGGAGGCAGCCTCTAGCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 GTCCTGAACCCAGCTCCATCACGTTCTTTGCCTTCTCCCTCATCGAGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103148 GTCCTGAACCCAGCTCCATCACGTTCTTTGCCTTCTCCCTCATCGAGGGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 TATATCTCCATTGTCATGGATGCTGAAACACAGAAAAA         GTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 103198 TATATCTCCATTGTCATGGATGCTGAAACACAGAAAAAGTA...CAGGTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 CCCCAGTGACCTCCTGCTGACCAGCTCCTCGGGGGAGCTGTGGAGGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103403 CCCCAGTGACCTCCTGCTGACCAGCTCCTCGGGGGAGCTGTGGAGGATGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 TGCGCATCGGTGGACAGCCCCTGGGCTTTG         ATGAATGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 103453 TGCGCATCGGTGGACAGCCCCTGGGCTTTGGTG...CAGATGAATGTGGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 ATCGTGGCACAGATTGCAGGTCCCCTGGCTGCCGCTGACATCTCTGCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103583 ATCGTGGCACAGATTGCAGGTCCCCTGGCTGCCGCTGACATCTCTGCCTA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 CTACATCAGCACCTTCAACTTCGACCACGCCCTG         GTGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 103633 CTACATCAGCACCTTCAACTTCGACCACGCCCTGGTG...CAGGTGCCCG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 AGGACGGTATCGGCAGCGTCATCGAGGTCCTCCAGCGGCGGCAGGAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103817 AGGACGGTATCGGCAGCGTCATCGAGGTCCTCCAGCGGCGGCAGGAAGGC

   1050     .
    979 CTGGCTTCC
        |||||||||
 103867 CTGGCTTCC