seq1 = pF1KE0505.tfa, 753 bp
seq2 = pF1KE0505/gi568815576r_32049543.tfa (gi568815576r:32049543_32259215), 209673 bp

>pF1KE0505 753
>gi568815576r:32049543_32259215 (Chr22)

(complement)

1-232  (100001-100232)   100% ->
233-307  (104898-104972)   100% ->
308-372  (106590-106654)   100% ->
373-400  (107122-107149)   100% ->
401-465  (107665-107729)   100% ->
466-493  (108197-108224)   100% ->
494-654  (108737-108897)   100% ->
655-682  (109436-109463)   100% ->
683-753  (109603-109673)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGAGCAAACTGACTTGCTGCCTGGGCCCCAGCGGGGGCCTCAACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGGAGCAAACTGACTTGCTGCCTGGGCCCCAGCGGGGGCCTCAACTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGACTGCTGCAGGCCAGATGTGGGACCCTGCCATGAGTGTGAGATTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGACTGCTGCAGGCCAGATGTGGGACCCTGCCATGAGTGTGAGATTCCTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGACTGTGGCAGCCACAGCACCAGCATCCACCACTGCAAAGCCTGCCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGACTGTGGCAGCCACAGCACCAGCATCCACCACTGCAAAGCCTGCCAAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTGGATTTGAAAGCTAAGAAGGCCCAACTCATGCAGTACCTCAGCCTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTGGATTTGAAAGCTAAGAAGGCCCAACTCATGCAGTACCTCAGCCTCCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GAAGACGCCGAAGATGCTGAAGATGTCCAAAG         GTTTGGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 100201 GAAGACGCCGAAGATGCTGAAGATGTCCAAAGGTA...CAGGTTTGGACG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CCCGCTCCAAGCGCTGGTTAAAAATAATATGGAGACGGCACGGGATTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104907 CCCGCTCCAAGCGCTGGTTAAAAATAATATGGAGACGGCACGGGATTTGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CCTCTAGAAAATATAG         GTCCCACTGAAGATGTGCAGGCGTC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 104957 CCTCTAGAAAATATAGGTA...TAGGTCCCACTGAAGATGTGCAGGCGTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGCACACGGCGGTGTGGAGGAGAATATGACATCAGATATT         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 106615 TGCACACGGCGGTGTGGAGGAGAATATGACATCAGATATTGTA...CAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AAATACCTGAGGCCAAGCACGACCACC         GTCCCACTGAAGAT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 107123 AAATACCTGAGGCCAAGCACGACCACCGTA...TAGGTCCCACTGAAGAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GTGCAGGTGTCTGCACACGGCGGTGTGGAGGAGAATATAACGTCAGATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107679 GTGCAGGTGTCTGCACACGGCGGTGTGGAGGAGAATATAACGTCAGATAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 T         GAAATATCTGAGGCCAAGCACGACCACC         ATT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 107729 TGTA...CAGGAAATATCTGAGGCCAAGCACGACCACCGTA...TAGATT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    497 TGGTCGAAGATCTCAGTGAAAGCCTATCTGTCTGTCTTGAAGACTTCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108740 TGGTCGAAGATCTCAGTGAAAGCCTATCTGTCTGTCTTGAAGACTTCATG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 ACATCGGATCTCAGTGAAAGCCTATCTGTCTCTCTTGAAGACTTCATGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108790 ACATCGGATCTCAGTGAAAGCCTATCTGTCTCTCTTGAAGACTTCATGAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 ATCAGGTCTCAGTGAAAGCCTATCTGTCTCTCTTGAAGACCTCATGACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108840 ATCAGGTCTCAGTGAAAGCCTATCTGTCTCTCTTGAAGACCTCATGACAC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 CGGAGATG         GCAAAGGAGAGATATGAAGATTACCTCT     
        ||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 108890 CGGAGATGGTA...CAGGCAAAGGAGAGATATGAAGATTACCTCTGTA..

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683     GCTGGGTTAAGATGGCACGGTCTCGGCTCAATGAACCCATCAGCAG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109469 .TAGGCTGGGTTAAGATGGCACGGTCTCGGCTCAATGAACCCATCAGCAG

    800     .    :    .    :    .
    729 CCAGGTTCTAGGACTTCTCCGGCTT
        |||||||||||||||||||||||||
 109649 CCAGGTTCTAGGACTTCTCCGGCTT