seq1 = pF1KE0502.tfa, 633 bp
seq2 = pF1KE0502/gi568815576f_25101397.tfa (gi568815576f:25101397_25307209), 205813 bp

>pF1KE0502 633
>gi568815576f:25101397_25307209 (Chr22)

1-75  (100001-100075)   100% ->
76-194  (101278-101396)   100% ->
195-327  (102367-102499)   100% ->
328-470  (103824-103966)   99% ->
471-633  (105651-105813)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGAACAGCACGGAGCACCCGAACAGGCTGCAGCTGGCAAGAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGAACAGCACGGAGCACCCGAACAGGCTGCAGCTGGCAAGAGCCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGGAGACCTTGGGGGCAGCTACAAG         GTGATCTTGTACGAAC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 100051 TGGAGACCTTGGGGGCAGCTACAAGGTA...TAGGTGATCTTGTACGAAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TAGAGAACTTCCAAGGCAAACGCTGCGAGCTCTCGGCCGAGTGCCCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101294 TAGAGAACTTCCAAGGCAAACGCTGCGAGCTCTCGGCCGAGTGCCCCAGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTGACCGACAGCCTGCTGGAGAAGGTGGGCTCCATCCAAGTGGAGTCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101344 CTGACCGACAGCCTGCTGGAGAAGGTGGGCTCCATCCAAGTGGAGTCCGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCC         GTGGCTGGCATTTGAGTCCAGGGCCTTCCGCGGGGAGC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101394 GCCGTG...CAGGTGGCTGGCATTTGAGTCCAGGGCCTTCCGCGGGGAGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGTTTGTTCTGGAGAAGGGGGATTATCCTCGCTGGGATGCCTGGTCCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102405 AGTTTGTTCTGGAGAAGGGGGATTATCCTCGCTGGGATGCCTGGTCCAAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AGCCGTGATAGTGACAGCCTTCTGTCCCTCCGGCCTCTGAATATT     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 102455 AGCCGTGATAGTGACAGCCTTCTGTCCCTCCGGCCTCTGAATATTGTG..

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    328     GATAGTCCAGATCACAAGCTGCATCTGTTTGAGAACCCAGCTTTCA
        .>>>||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102505 .CAGGATAGTCCACATCACAAGCTGCATCTGTTTGAGAACCCAGCTTTCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GTGGCCGCAAGATGGAGATAGTGGATGATGACGTGCCCAGCCTGTGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103870 GTGGCCGCAAGATGGAGATAGTGGATGATGACGTGCCCAGCCTGTGGGCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CATGGCTTCCAGGACCGTGTGGCGAGTGTCCGTGCCATCAACGGGAC   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 103920 CATGGCTTCCAGGACCGTGTGGCGAGTGTCCGTGCCATCAACGGGACGTA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    471       GTGGGTTGGCTATGAGTTCCCCGGCTACCGTGGGCGCCAGTACG
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103970 ...CAGGTGGGTTGGCTATGAGTTCCCCGGCTACCGTGGGCGCCAGTACG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TGTTTGAGCGGGGCGAGTACCGCCACTGGAATGAGTGGGACGCCAGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105695 TGTTTGAGCGGGGCGAGTACCGCCACTGGAATGAGTGGGACGCCAGCCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CCGCAGCTGCAGTCTGTGCGCCGCATCCGTGACCAGAAGTGGCACAAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105745 CCGCAGCTGCAGTCTGTGCGCCGCATCCGTGACCAGAAGTGGCACAAGCG

    650     .    :    .
    615 GGGCCGCTTCCCCAGCAGC
        |||||||||||||||||||
 105795 GGGCCGCTTCCCCAGCAGC