seq1 = pF1KE0501.tfa, 615 bp
seq2 = pF1KE0501/gi568815576f_25121430.tfa (gi568815576f:25121430_25331769), 210340 bp

>pF1KE0501 615
>gi568815576f:25121430_25331769 (Chr22)

1-54  (100001-100054)   100% ->
55-173  (103489-103607)   100% ->
174-306  (106424-106556)   100% ->
307-449  (108007-108149)   100% ->
450-615  (110175-110340)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCTCAGATCACCAGACCCAGGCGGGCAAGCCACAGTCCCTCAACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCTCAGATCACCAGACCCAGGCGGGCAAGCCACAGTCCCTCAACCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAAG         ATCATCATCTTTGAGCAGGAAAACTTTCAAGGCCACT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAAGGTG...CAGATCATCATCTTTGAGCAGGAAAACTTTCAAGGCCACT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CGCATGAGCTCAATGGGCCCTGCCCCAACCTGAAGGAAACTGGCGTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103526 CGCATGAGCTCAATGGGCCCTGCCCCAACCTGAAGGAAACTGGCGTGGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AAGGCAGGTTCTGTCCTAGTGCAGGCTGGACC         CTGGGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 103576 AAGGCAGGTTCTGTCCTAGTGCAGGCTGGACCGTA...CAGCTGGGTGGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CTATGAACAGGCCAACTGCAAGGGCGAGCAGTTTGTGTTTGAGAAGGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106433 CTATGAACAGGCCAACTGCAAGGGCGAGCAGTTTGTGTTTGAGAAGGGTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGTACCCCCGCTGGGACTCATGGACCAGCAGCCGAAGGACGGACTCCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106483 AGTACCCCCGCTGGGACTCATGGACCAGCAGCCGAAGGACGGACTCCCTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AGCTCCCTGAGGCCCATCAAAGTG         GACAGCCAAGAGCACAA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 106533 AGCTCCCTGAGGCCCATCAAAGTGGTG...TAGGACAGCCAAGAGCACAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GATCATCCTCTATGAAAACCCCAACTTCACCGGGAAGAAGATGGAAATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108024 GATCATCCTCTATGAAAACCCCAACTTCACCGGGAAGAAGATGGAAATCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TAGATGACGATGTACCCAGCTTCCACGCCCATGGCTACCAGGAGAAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108074 TAGATGACGATGTACCCAGCTTCCACGCCCATGGCTACCAGGAGAAGGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TCATCTGTGCGGGTGCAGAGTGGCAC         GTGGGTTGGCTACCA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 108124 TCATCTGTGCGGGTGCAGAGTGGCACGTA...CAGGTGGGTTGGCTACCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GTACCCCGGCTACCGTGGACTGCAGTACCTGCTGGAGAAGGGAGACTACA
        |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
 110190 GTACCCCGGCTACCGTGGGCTGCAGTACCTGCTGGAGAAGGGAGACTACA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 AGGACAGCAGCGACTTTGGGGCCCCTCACCCCCAGGTGCAGTCCGTGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110240 AGGACAGCAGCGACTTTGGGGCCCCTCACCCCCAGGTGCAGTCCGTGCGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CGTATCCGCGACATGCAGTGGCACCAACGTGGTGCCTTCCACCCCTCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110290 CGTATCCGCGACATGCAGTGGCACCAACGTGGTGCCTTCCACCCCTCCAA

    650 
    615 C
        |
 110340 C