seq1 = pF1KE0498.tfa, 3162 bp
seq2 = pF1KE0498/gi568815575r_129348312.tfa (gi568815575r:129348312_129623370), 275059 bp

>pF1KE0498 3162
>gi568815575r:129348312_129623370 (ChrX)

(complement)

1-174  (100001-100174)   100% ->
175-261  (104924-105010)   100% ->
262-428  (106874-107040)   100% ->
429-529  (107377-107477)   100% ->
530-630  (107584-107684)   100% ->
631-810  (111388-111567)   100% ->
811-966  (115275-115430)   100% ->
967-1098  (117160-117291)   100% ->
1099-1167  (118569-118637)   100% ->
1168-1277  (123530-123639)   100% ->
1278-1504  (125300-125526)   100% ->
1505-1626  (126500-126621)   100% ->
1627-1662  (130296-130331)   100% ->
1663-1815  (131278-131430)   100% ->
1816-1948  (133179-133311)   100% ->
1949-2097  (134286-134434)   100% ->
2098-2217  (136234-136353)   100% ->
2218-2328  (142186-142296)   100% ->
2329-2442  (142557-142670)   100% ->
2443-2565  (152045-152167)   100% ->
2566-2698  (154466-154598)   100% ->
2699-2817  (157409-157527)   100% ->
2818-3030  (157639-157851)   100% ->
3031-3162  (174928-175059)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGCAGGACACTGCCGCAGTGGCAGCCACCGTGGCAGCCGCGGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGCAGGACACTGCCGCAGTGGCAGCCACCGTGGCAGCCGCGGATGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GACCGCCACTATCGTGGTCATAGAGGACGAGCAGCCCGGGCCGTCCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GACCGCCACTATCGTGGTCATAGAGGACGAGCAGCCCGGGCCGTCCACCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTCAGGAGGAGGGAGCGGCCGCCGCGGCCACCGAAGCCACCGCGGCCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CTCAGGAGGAGGGAGCGGCCGCCGCGGCCACCGAAGCCACCGCGGCCACG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAGAAGGGCGAGAAGAAGAAGGAG         AAAAACGTTTCTTCATT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 100151 GAGAAGGGCGAGAAGAAGAAGGAGGTA...TAGAAAAACGTTTCTTCATT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TCAACTCAAACTTGCTGCTAAAGCGCCTAAATCTGAAAAGGAAATGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104941 TCAACTCAAACTTGCTGCTAAAGCGCCTAAATCTGAAAAGGAAATGGACC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CAGAATATGAAGAGAAAATG         AAAGCCGACCGAGCAAAGAGA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 104991 CAGAATATGAAGAGAAAATGGTA...TAGAAAGCCGACCGAGCAAAGAGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TTTGAATTTTTACTGAAGCAGACAGAACTTTTTGCACATTTCATTCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106895 TTTGAATTTTTACTGAAGCAGACAGAACTTTTTGCACATTTCATTCAGCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TTCAGCACAGAAATCTCCAACATCTCCACTGAACATGAAATTGGGACGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106945 TTCAGCACAGAAATCTCCAACATCTCCACTGAACATGAAATTGGGACGTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CCCGAATAAAGAAAGATGAAAAGCAGAGCTTAATTTCTGCTGGAGA    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 106995 CCCGAATAAAGAAAGATGAAAAGCAGAGCTTAATTTCTGCTGGAGAGTA.

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    429      CTACCGCCATAGGCGCACAGAGCAAGAAGAAGATGAAGAGCTACT
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107045 ..CAGCTACCGCCATAGGCGCACAGAGCAAGAAGAAGATGAAGAGCTACT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GTCTGAGAGTCGGAAAACATCTAATGTGTGTATTAGATTTGAGGTGTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107422 GTCTGAGAGTCGGAAAACATCTAATGTGTGTATTAGATTTGAGGTGTCAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CTTCAT         ATGTGAAAGGGGGGCCACTGAGAGATTATCAGATT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107472 CTTCATGTA...CAGATGTGAAAGGGGGGCCACTGAGAGATTATCAGATT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CGAGGACTGAATTGGTTGATCTCTTTATATGAAAATGGAGTCAATGGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107619 CGAGGACTGAATTGGTTGATCTCTTTATATGAAAATGGAGTCAATGGCAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TTTGGCTGATGAAATG         GGCCTTGGGAAAACTTTACAAACAA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 107669 TTTGGCTGATGAAATGGTA...CAGGGCCTTGGGAAAACTTTACAAACAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TTGCTTTGCTTGGTTACCTGAAACACTACCGAAATATTCCTGGACCTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111413 TTGCTTTGCTTGGTTACCTGAAACACTACCGAAATATTCCTGGACCTCAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 ATGGTTTTAGTTCCAAAGTCTACTTTACACAACTGGATGAATGAATTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111463 ATGGTTTTAGTTCCAAAGTCTACTTTACACAACTGGATGAATGAATTTAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 ACGATGGGTCCCATCTCTCCGTGTCATTTGTTTTGTCGGAGACAAGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111513 ACGATGGGTCCCATCTCTCCGTGTCATTTGTTTTGTCGGAGACAAGGATG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 CCAGA         GCTGCTTTTATTCGTGATGAAATGATGCCAGGAGAG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111563 CCAGAGTA...TAGGCTGCTTTTATTCGTGATGAAATGATGCCAGGAGAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 TGGGATGTTTGCGTTACTTCTTATGAGATGGTAATTAAAGAAAAATCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115311 TGGGATGTTTGCGTTACTTCTTATGAGATGGTAATTAAAGAAAAATCTGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 ATTCAAAAAGTTTCACTGGCGATACCTGGTCATTGATGAAGCTCACAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115361 ATTCAAAAAGTTTCACTGGCGATACCTGGTCATTGATGAAGCTCACAGAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 TAAAGAATGAAAAATCTAAG         CTTTCAGAGATTGTTCGTGAG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 115411 TAAAGAATGAAAAATCTAAGGTA...TAGCTTTCAGAGATTGTTCGTGAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 TTCAAGTCGACTAACCGCTTGCTCCTAACTGGAACACCTTTGCAGAATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117181 TTCAAGTCGACTAACCGCTTGCTCCTAACTGGAACACCTTTGCAGAATAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 CCTGCATGAACTGTGGGCCTTACTCAACTTTTTATTGCCTGATGTCTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117231 CCTGCATGAACTGTGGGCCTTACTCAACTTTTTATTGCCTGATGTCTTTA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 ATTCTGCAGAT         GACTTTGATTCTTGGTTTGACACTAAAAAT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 117281 ATTCTGCAGATGTA...CAGGACTTTGATTCTTGGTTTGACACTAAAAAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 TGTCTTGGTGATCAAAAACTCGTGGAAAGACTTCATGCA         GT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 118599 TGTCTTGGTGATCAAAAACTCGTGGAAAGACTTCATGCAGTA...TAGGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 TTTAAAACCATTTTTGTTACGCCGTATAAAAACTGATGTAGAGAAGAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123532 TTTAAAACCATTTTTGTTACGCCGTATAAAAACTGATGTAGAGAAGAGTC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 TGCCACCTAAAAAGGAAATAAAGATTTACTTGGGGCTGAGTAAGATGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123582 TGCCACCTAAAAAGGAAATAAAGATTTACTTGGGGCTGAGTAAGATGCAA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 CGAGAATG         GTATACAAAAATCCTGATGAAAGATATTGATGT
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 123632 CGAGAATGGTG...TAGGTATACAAAAATCCTGATGAAAGATATTGATGT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 TTTAAACTCTTCTGGCAAGATGGACAAGATGCGACTCTTAAACATTCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125333 TTTAAACTCTTCTGGCAAGATGGACAAGATGCGACTCTTAAACATTCTGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 TGCAGCTTCGAAAGTGTTGTAATCATCCATATCTGTTTGATGGTGCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125383 TGCAGCTTCGAAAGTGTTGTAATCATCCATATCTGTTTGATGGTGCTGAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 CCTGGTCCACCTTATACCACTGATGAGCATATTGTCAGCAACAGTGGTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125433 CCTGGTCCACCTTATACCACTGATGAGCATATTGTCAGCAACAGTGGTAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 AATGGTAGTTCTGGATAAACTATTGGCCAAACTCAAAGAACAGG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 125483 AATGGTAGTTCTGGATAAACTATTGGCCAAACTCAAAGAACAGGGTG...

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1505    GTTCAAGGGTTCTCATTTTCAGCCAGATGACTCGCTTGCTGGATATT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126497 TAGGTTCAAGGGTTCTCATTTTCAGCCAGATGACTCGCTTGCTGGATATT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552 TTGGAAGATTATTGCATGTGGCGTGGTTATGAGTATTGTCGACTGGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126547 TTGGAAGATTATTGCATGTGGCGTGGTTATGAGTATTGTCGACTGGATGG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 ACAAACCCCGCATGAAGAAAGAGAG         GATAAATTCCTAGAAG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 126597 ACAAACCCCGCATGAAGAAAGAGAGGTG...TAGGATAAATTCCTAGAAG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 TGGAATTTCTGGGTCAAAGG         GAAGCAATAGAGGCTTTTAAT
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 130312 TGGAATTTCTGGGTCAAAGGGTA...AAGGAAGCAATAGAGGCTTTTAAT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1684 GCTCCTAATAGTAGCAAATTCATCTTTATGCTAAGTACCAGGGCTGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131299 GCTCCTAATAGTAGCAAATTCATCTTTATGCTAAGTACCAGGGCTGGAGG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1734 TCTCGGAATTAACCTGGCAAGTGCTGATGTGGTTATACTATATGATTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131349 TCTCGGAATTAACCTGGCAAGTGCTGATGTGGTTATACTATATGATTCAG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1784 ACTGGAACCCACAGGTTGATCTACAAGCTATG         GATCGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 131399 ACTGGAACCCACAGGTTGATCTACAAGCTATGGTT...TAGGATCGAGCA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1825 CATCGTATTGGTCAGAAGAAACCAGTACGTGTATTCCGTCTCATCACTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133188 CATCGTATTGGTCAGAAGAAACCAGTACGTGTATTCCGTCTCATCACTGA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1875 CAACACTGTTGAAGAGAGGATTGTAGAAAGAGCTGAGATAAAACTGAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133238 CAACACTGTTGAAGAGAGGATTGTAGAAAGAGCTGAGATAAAACTGAGAC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1925 TCGATTCAATTGTTATACAACAAG         GAAGACTCATTGACCAA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 133288 TCGATTCAATTGTTATACAACAAGGTA...TAGGAAGACTCATTGACCAA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1966 CAGTCTAACAAGCTGGCAAAAGAGGAAATGTTACAAATGATACGGCATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134303 CAGTCTAACAAGCTGGCAAAAGAGGAAATGTTACAAATGATACGGCATGG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2016 AGCCACCCATGTTTTTGCTTCTAAAGAGAGTGAGTTGACAGATGAAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134353 AGCCACCCATGTTTTTGCTTCTAAAGAGAGTGAGTTGACAGATGAAGACA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2066 TTACAACTATTCTGGAAAGAGGGGAAAAGAAG         ACTGCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 134403 TTACAACTATTCTGGAAAGAGGGGAAAAGAAGGTT...TAGACTGCAGAG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2107 ATGAATGAACGCCTGCAAAAAATGGGAGAGTCTTCTCTAAGAAATTTTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136243 ATGAATGAACGCCTGCAAAAAATGGGAGAGTCTTCTCTAAGAAATTTTAG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2157 AATGGACATTGAACAAAGTTTATACAAATTTGAGGGAGAAGATTATAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136293 AATGGACATTGAACAAAGTTTATACAAATTTGAGGGAGAAGATTATAGAG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2207 AAAAACAGAAG         CTTGGCATGGTGGAATGGATTGAACCTCCT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 136343 AAAAACAGAAGGTA...TAGCTTGGCATGGTGGAATGGATTGAACCTCCT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2248 AAACGAGAACGCAAAGCAAACTACGCAGTGGATGCCTACTTTAGAGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142216 AAACGAGAACGCAAAGCAAACTACGCAGTGGATGCCTACTTTAGAGAGGC

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2298 TTTGCGTGTCAGCGAGCCAAAGATTCCAAAG         GCTCCACGGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 142266 TTTGCGTGTCAGCGAGCCAAAGATTCCAAAGGTA...TAGGCTCCACGGC

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2339 CTCCAAAACAGCCAAATGTTCAGGATTTTCAATTTTTCCCACCACGCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142567 CTCCAAAACAGCCAAATGTTCAGGATTTTCAATTTTTCCCACCACGCTTA

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2389 TTTGAGCTCCTGGAAAAGGAAATTCTTTATTATCGGAAGACAATAGGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142617 TTTGAGCTCCTGGAAAAGGAAATTCTTTATTATCGGAAGACAATAGGCTA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2439 TAAG         GTTCCAAGGAATCCTGATATCCCAAATCCAGCTCTGG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142667 TAAGGTA...TAGGTTCCAAGGAATCCTGATATCCCAAATCCAGCTCTGG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2480 CTCAAAGAGAAGAGCAAAAAAAGATTGATGGAGCTGAACCTCTTACACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152082 CTCAAAGAGAAGAGCAAAAAAAGATTGATGGAGCTGAACCTCTTACACCA

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2530 GAAGAGACTGAAGAAAAGGAAAAACTTCTCACACAA         GGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 152132 GAAGAGACTGAAGAAAAGGAAAAACTTCTCACACAAGTA...CAGGGTTT

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2571 CACAAACTGGACTAAACGAGATTTTAACCAGTTTATTAAAGCTAATGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154471 CACAAACTGGACTAAACGAGATTTTAACCAGTTTATTAAAGCTAATGAGA

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2621 AATATGGAAGAGATGACATTGATAACATAGCTCGAGAGGTAGAGGGCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154521 AATATGGAAGAGATGACATTGATAACATAGCTCGAGAGGTAGAGGGCAAA

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2671 TCCCCTGAGGAGGTCATGGAGTATTCAG         CTGTATTTTGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 154571 TCCCCTGAGGAGGTCATGGAGTATTCAGGTT...CAGCTGTATTTTGGGA

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2712 ACGTTGCAATGAATTACAGGACATTGAGAAAATTATGGCTCAAATTGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157422 ACGTTGCAATGAATTACAGGACATTGAGAAAATTATGGCTCAAATTGAAC

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2762 GTGGAGAAGCAAGAATTCAACGAAGGATCAGTATCAAGAAAGCCCTGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157472 GTGGAGAAGCAAGAATTCAACGAAGGATCAGTATCAAGAAAGCCCTGGAT

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2812 GCCAAA         ATTGCAAGATACAAGGCTCCATTTCATCAGTTGCG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157522 GCCAAAGTA...CAGATTGCAAGATACAAGGCTCCATTTCATCAGTTGCG

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2853 CATTCAGTATGGAACCAGCAAAGGAAAGAACTATACTGAGGAAGAAGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157674 CATTCAGTATGGAACCAGCAAAGGAAAGAACTATACTGAGGAAGAAGATA

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2903 GATTCTTGATTTGTATGTTACACAAAATGGGCTTTGATAGAGAAAATGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157724 GATTCTTGATTTGTATGTTACACAAAATGGGCTTTGATAGAGAAAATGTA

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2953 TATGAAGAATTAAGACAGTGTGTACGAAATGCTCCCCAGTTTAGATTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157774 TATGAAGAATTAAGACAGTGTGTACGAAATGCTCCCCAGTTTAGATTTGA

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3003 CTGGTTTATCAAGTCTAGGACTGCCATG         GAATTCCAGAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 157824 CTGGTTTATCAAGTCTAGGACTGCCATGGTA...TAGGAATTCCAGAGAC

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3044 GCTGTAACACTCTGATTTCATTGATTGAGAAAGAAAATATGGAAATTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 174941 GCTGTAACACTCTGATTTCATTGATTGAGAAAGAAAATATGGAAATTGAG

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3094 GAAAGAGAGAGAGCAGAAAAGAAGAAACGGGCAACTAAAACTCCAATGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 174991 GAAAGAGAGAGAGCAGAAAAGAAGAAACGGGCAACTAAAACTCCAATGGT

   3350     .    :    .
   3144 AAAATTTTCAGCATTTTCC
        |||||||||||||||||||
 175041 AAAATTTTCAGCATTTTCC