seq1 = pF1KE0496.tfa, 756 bp
seq2 = pF1KE0496/gi568815576r_26499493.tfa (gi568815576r:26499493_26716319), 216827 bp

>pF1KE0496 756
>gi568815576r:26499493_26716319 (Chr22)

(complement)

1-180  (100001-100180)   100% ->
181-299  (104130-104248)   100% ->
300-432  (108299-108431)   100% ->
433-575  (114299-114441)   100% ->
576-756  (116647-116827)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCTCAGGCTGCAAAGGCCTCGGCCTCGGCCACAGTGGCGGTGAACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCTCAGGCTGCAAAGGCCTCGGCCTCGGCCACAGTGGCGGTGAACCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGGGCCTGACACCAAGGGGAAGGGGGCCCCACCTGCAGGAACATCCCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGGGCCTGACACCAAGGGGAAGGGGGCCCCACCTGCAGGAACATCCCCTA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GTCCCGGCACTACCCTGGCCCCAACAACCGTGCCTATTACCAGCGCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GTCCCGGCACTACCCTGGCCCCAACAACCGTGCCTATTACCAGCGCCAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCGGCGGAACTGCCTCCTGGGAACTACAGG         CTGGTGGTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 100151 GCGGCGGAACTGCCTCCTGGGAACTACAGGGTA...CAGCTGGTGGTCTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CGAACTGGAAAACTTCCAGGGCCGTCGAGCAGAATTCTCGGGGGAGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104141 CGAACTGGAAAACTTCCAGGGCCGTCGAGCAGAATTCTCGGGGGAGTGCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CAAATCTGGCAGACCGTGGCTTCGACCGTGTGCGCAGCATCATTGTCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104191 CAAATCTGGCAGACCGTGGCTTCGACCGTGTGCGCAGCATCATTGTCTCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GCGGGACC         CTGGGTCGCCTTTGAGCAGTCCAACTTCCGCGG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 104241 GCGGGACCGTG...CAGCTGGGTCGCCTTTGAGCAGTCCAACTTCCGCGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GGAGATGTTCATCCTGGAGAAGGGCGAGTACCCTCGCTGGAACACATGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108332 GGAGATGTTCATCCTGGAGAAGGGCGAGTACCCTCGCTGGAACACATGGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CGAGCAGCTACCGCAGTGATCGGCTCATGTCCTTCCGGCCCATCAAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108382 CGAGCAGCTACCGCAGTGATCGGCTCATGTCCTTCCGGCCCATCAAAATG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433          GATGCCCAGGAGCACAAAATCTCCCTGTTTGAAGGGGCCAA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108432 GTG...CAGGATGCCCAGGAGCACAAAATCTCCCTGTTTGAAGGGGCCAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CTTCAAGGGCAACACCATAGAGATCCAGGGGGACGACGCACCCAGTCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114340 CTTCAAGGGCAACACCATAGAGATCCAGGGGGACGACGCACCCAGTCTCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GGGTCTACGGCTTCAGTGACCGCGTGGGCAGCGTGAAGGTCTCCAGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114390 GGGTCTACGGCTTCAGTGACCGCGTGGGCAGCGTGAAGGTCTCCAGTGGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 AC         ATGGGTTGGCTATCAGTATCCTGGCTACCGCGGGTACCA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114440 ACGTA...CAGATGGGTTGGCTATCAGTATCCTGGCTACCGCGGGTACCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GTACCTCCTAGAGCCTGGTGACTTCCGGCACTGGAATGAGTGGGGAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116686 GTACCTCCTAGAGCCTGGTGACTTCCGGCACTGGAATGAGTGGGGAGCCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 TCCAGCCACAGATGCAGTCCCTGCGTCGCCTGCGTGACAAGCAGTGGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116736 TCCAGCCACAGATGCAGTCCCTGCGTCGCCTGCGTGACAAGCAGTGGCAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :
    715 CTCGAGGGGTCCTTCCCTGTCCTGGCCACAGAGCCCCCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116786 CTCGAGGGGTCCTTCCCTGTCCTGGCCACAGAGCCCCCCAAG