seq1 = pF1KE0494.tfa, 654 bp
seq2 = pF1KE0494/gi568815576r_19423602.tfa (gi568815576r:19423602_19624255), 200654 bp

>pF1KE0494 654
>gi568815576r:19423602_19624255 (Chr22)

(complement)

1-654  (100001-100654)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGTCCGCAGCGTTGGAGATCCTGGGCCTGGTGCTGTGCCTGGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGGTCCGCAGCGTTGGAGATCCTGGGCCTGGTGCTGTGCCTGGTGGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTGGGGGGGTCTGATCCTGGCGTGCGGGCTGCCCATGTGGCAGGTGACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTGGGGGGGTCTGATCCTGGCGTGCGGGCTGCCCATGTGGCAGGTGACCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCTTCCTGGACCACAACATCGTGACGGCGCAGACCACCTGGAAGGGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCTTCCTGGACCACAACATCGTGACGGCGCAGACCACCTGGAAGGGGCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TGGATGTCGTGCGTGGTGCAGAGCACCGGGCACATGCAGTGCAAAGTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TGGATGTCGTGCGTGGTGCAGAGCACCGGGCACATGCAGTGCAAAGTGTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGACTCGGTGCTGGCTCTGAGCACCGAGGTGCAGGCGGCGCGGGCGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CGACTCGGTGCTGGCTCTGAGCACCGAGGTGCAGGCGGCGCGGGCGCTCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCGTGAGCGCCGTGCTGCTGGCGTTCGTTGCGCTCTTCGTGACCCTGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CCGTGAGCGCCGTGCTGCTGGCGTTCGTTGCGCTCTTCGTGACCCTGGCG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GGCGCGCAGTGCACCACCTGCGTGGCCCCGGGCCCGGCCAAGGCGCGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GGCGCGCAGTGCACCACCTGCGTGGCCCCGGGCCCGGCCAAGGCGCGTGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGCCCTCACGGGAGGCGTGCTCTACCTGTTTTGCGGGCTGCTGGCGCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGCCCTCACGGGAGGCGTGCTCTACCTGTTTTGCGGGCTGCTGGCGCTCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGCCACTCTGCTGGTTCGCCAACATTGTCGTCCGCGAGTTTTACGACCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGCCACTCTGCTGGTTCGCCAACATTGTCGTCCGCGAGTTTTACGACCCG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TCTGTGCCCGTGTCGCAGAAGTACGAGCTGGGCGCAGCGCTGTACATCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TCTGTGCCCGTGTCGCAGAAGTACGAGCTGGGCGCAGCGCTGTACATCGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTGGGCGGCCACCGCGCTGCTCATGGTAGGCGGCTGCCTCTTGTGCTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CTGGGCGGCCACCGCGCTGCTCATGGTAGGCGGCTGCCTCTTGTGCTGCG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GCGCCTGGGTCTGCACCGGCCGTCCCGACCTCAGCTTCCCCGTGAAGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GCGCCTGGGTCTGCACCGGCCGTCCCGACCTCAGCTTCCCCGTGAAGTAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TCAGCGCCGCGGCGGCCCACGGCCACCGGCGACTACGACAAGAAGAACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TCAGCGCCGCGGCGGCCCACGGCCACCGGCGACTACGACAAGAAGAACTA

    650 
    651 CGTC
        ||||
 100651 CGTC