seq1 = pF1KE0492.tfa, 840 bp
seq2 = pF1KE0492/gi568815576r_36891182.tfa (gi568815576r:36891182_37102306), 211125 bp

>pF1KE0492 840
>gi568815576r:36891182_37102306 (Chr22)

(complement)

1-22  (98320-98341)   100% ->
23-489  (100004-100470)   100% ->
490-634  (102323-102467)   100% ->
635-745  (110716-110826)   100% ->
746-840  (111031-111125)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGCTGGGCCACGGAGCAG         GTACAACCACTTTCACCAG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
  98320 ATGGAGCTGGGCCACGGAGCAGGTA...CAGGTACAACCACTTTCACCAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 GGCCCATCTGAATGACAAGGAGGGCCAACAGGACTTGGACCCCTGGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100023 GGCCCATCTGAATGACAAGGAGGGCCAACAGGACTTGGACCCCTGGAAAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CGGCCTACAGTTCCTTGGACACCTCCAAGTTCAAGAACCAGGGTCTGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100073 CGGCCTACAGTTCCTTGGACACCTCCAAGTTCAAGAACCAGGGTCTGTCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TCCCCACAGCCCCTGCCCCTGGGAGCCAGCGCTCAAGGCAGCTCCCTAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100123 TCCCCACAGCCCCTGCCCCTGGGAGCCAGCGCTCAAGGCAGCTCCCTAGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCAGTGCCACTTGAAGGAGATTCCCCCTCCACCCCCGACTGCTGCCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100173 GCAGTGCCACTTGAAGGAGATTCCCCCTCCACCCCCGACTGCTGCCAGCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GGGATTCTCTGGGCATGGACCCACAGTCCAGGTCCCTGAAGAATGCGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100223 GGGATTCTCTGGGCATGGACCCACAGTCCAGGTCCCTGAAGAATGCGGGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TCTCGATCCTCCTCGAGAGAGAACAGGGCCACCTCGGGAGAGGGGGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100273 TCTCGATCCTCCTCGAGAGAGAACAGGGCCACCTCGGGAGAGGGGGCTCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GCCATGCCAGGGGACGGATGACGGTCCCAGCTTGGGGGCTCAGGACCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100323 GCCATGCCAGGGGACGGATGACGGTCCCAGCTTGGGGGCTCAGGACCAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 GGAGCACGCCCACGAACCAGAAGGGCAGCATCATTCCTAACAACATTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100373 GGAGCACGCCCACGAACCAGAAGGGCAGCATCATTCCTAACAACATTCGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CACAAGTTTGGGAGCAATGTGGTGGACCAGCTGGTCTCCGAGGAGCAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 100423 CACAAGTTTGGGAGCAATGTGGTGGACCAGCTGGTCTCCGAGGAGCAGGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    490        GCTCAAAAGGCTATTGATGAAGTCTTCGAGGGCCAGAAAAGGG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100473 G...CAGGCTCAAAAGGCTATTGATGAAGTCTTCGAGGGCCAGAAAAGGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 CAAGCTCATGGCCCAGCAGGACCCAGAATCCTGTGGAAATCTCCTCCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102366 CAAGCTCATGGCCCAGCAGGACCCAGAATCCTGTGGAAATCTCCTCCGTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 TTCTCAGACTACTATGACCTCGGCTACAACATGCGGTCAAACTTGTTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102416 TTCTCAGACTACTATGACCTCGGCTACAACATGCGGTCAAACTTGTTTCG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 AG         GGGCTGCTGAGGAGACAAAGAGCCTCATGAAGGCTTCTT
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102466 AGGTC...CAGGGGCTGCTGAGGAGACAAAGAGCCTCATGAAGGCTTCTT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 ACACACCAGAGGTCATTGAGAAATCAGTGAGGGACTTAGAACACTGGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110755 ACACACCAGAGGTCATTGAGAAATCAGTGAGGGACTTAGAACACTGGCAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 GGCAGGAAGACGGATGATCTGG         GGCGGTGGCACCAGAAAAA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 110805 GGCAGGAAGACGGATGATCTGGGTA...TAGGGCGGTGGCACCAGAAAAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 TGCTATGAACCTGAACTTGCAGAAAGCACTGGAAGAGAAATATGGAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111050 TGCTATGAACCTGAACTTGCAGAAAGCACTGGAAGAGAAATATGGAGAAA

    850     .    :    .    :    .
    815 ACAGCAAATCCAAGAGCTCCAAGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||
 111100 ACAGCAAATCCAAGAGCTCCAAGTAC