seq1 = pF1KE0485.tfa, 597 bp
seq2 = pF1KE0485/gi568815576f_38859539.tfa (gi568815576f:38859539_39187126), 327588 bp

>pF1KE0485 597
>gi568815576f:38859539_39187126 (Chr22)

1-29  (98154-98182)   100% ->
30-174  (100004-100148)   100% ->
175-469  (101849-102143)   100% ->
470-593  (102560-102682)   97%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAAGCCAGCCCAGCATCCGGGCCCAG         ACACTTGATGGA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
  98154 ATGGAAGCCAGCCCAGCATCCGGGCCCAGGTA...CAGACACTTGATGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 TCCACACATATTCACTTCCAACTTTAACAATGGCATTGGAAGGCATAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100016 TCCACACATATTCACTTCCAACTTTAACAATGGCATTGGAAGGCATAAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CCTACCTGTGCTACGAAGTGGAGCGCCTGGACAATGGCACCTCGGTCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100066 CCTACCTGTGCTACGAAGTGGAGCGCCTGGACAATGGCACCTCGGTCAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATGGACCAGCACAGGGGCTTTCTACACAACCAG         GCTAAGAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 100116 ATGGACCAGCACAGGGGCTTTCTACACAACCAGGTG...TAGGCTAAGAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TCTTCTCTGTGGCTTTTACGGCCGCCATGCGGAGCTGCGCTTCTTGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101857 TCTTCTCTGTGGCTTTTACGGCCGCCATGCGGAGCTGCGCTTCTTGGACC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TGGTTCCTTCTTTGCAGTTGGACCCGGCCCAGATCTACAGGGTCACTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101907 TGGTTCCTTCTTTGCAGTTGGACCCGGCCCAGATCTACAGGGTCACTTGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TTCATCTCCTGGAGCCCCTGCTTCTCCTGGGGCTGTGCCGGGGAAGTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101957 TTCATCTCCTGGAGCCCCTGCTTCTCCTGGGGCTGTGCCGGGGAAGTGCG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGCGTTCCTTCAGGAGAACACACACGTGAGACTGCGTATCTTCGCTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102007 TGCGTTCCTTCAGGAGAACACACACGTGAGACTGCGTATCTTCGCTGCCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GCATCTATGATTACGACCCCCTATATAAGGAGGCACTGCAAATGCTGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102057 GCATCTATGATTACGACCCCCTATATAAGGAGGCACTGCAAATGCTGCGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GATGCTGGGGCCCAAGTCTCCATCATGACCTACGATG         AATT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 102107 GATGCTGGGGCCCAAGTCTCCATCATGACCTACGATGGTA...CAGAATT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TAAGCACTGCTGGGACACCTTTGTGGACCACCAGGGATGTCCCTTCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102564 TAAGCACTGCTGGGACACCTTTGTGGACCACCAGGGATGTCCCTTCCAGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CCTGGGATGGACTAGATGAGCACAGCCAAGCCCTGAGTGGGAGGCTGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102614 CCTGGGATGGACTAGATGAGCACAGCCAAGCCCTGAGTGGGAGGCTGCGG

    600     .    :    .    :
    574 GCCATTCTCCAGAATCAGGG
        |||||||||||| -| ||||
 102664 GCCATTCTCCAGG TGAGGG