seq1 = pF1KE0481.tfa, 1257 bp
seq2 = pF1KE0481/gi568815579r_42768101.tfa (gi568815579r:42768101_42979581), 211481 bp

>pF1KE0481 1257
>gi568815579r:42768101_42979581 (Chr19)

(complement)

1-64  (100001-100064)   100% ->
65-430  (101304-101669)   100% ->
431-709  (107537-107815)   100% ->
710-988  (110548-110826)   99% ->
989-1243  (111227-111481)   100% ->
1244-1257  (112432-112445)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGAACCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCGCATCAAATGGAAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGAACCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCGCATCAAATGGAAGGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTCCTGCTCACAG         CATCACTTTTAAACTTCTGGAACCTGC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTCCTGCTCACAGGTG...TAGCATCACTTTTAAACTTCTGGAACCTGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CCACCACTGCCCAAGTCACGATTGAAGCCGAGCCAACCAAAGTTTCCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101331 CCACCACTGCCCAAGTCACGATTGAAGCCGAGCCAACCAAAGTTTCCGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGGAAGGATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTACCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101381 GGGAAGGATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTACCGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CTACATCTGGTACAAAGGGCAAATGAGGGACCTCTACCATTACATTACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101431 CTACATCTGGTACAAAGGGCAAATGAGGGACCTCTACCATTACATTACAT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CATATGTAGTAGACGGTGAAATAATTATATATGGGCCTGCATATAGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101481 CATATGTAGTAGACGGTGAAATAATTATATATGGGCCTGCATATAGTGGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CGAGAAACAGCATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101531 CGAGAAACAGCATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACCCG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GGAGGACGCAGGATCCTACACCTTACACATCATAAAGGGAGATGATGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101581 GGAGGACGCAGGATCCTACACCTTACACATCATAAAGGGAGATGATGGGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CTAGAGGAGTAACTGGACGTTTCACCTTCACCTTACACC         TG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 101631 CTAGAGGAGTAACTGGACGTTTCACCTTCACCTTACACCGTA...CAGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GAGACTCCTAAGCCCTCCATCTCCAGCAGCAACTTAAATCCCAGGGAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107539 GAGACTCCTAAGCCCTCCATCTCCAGCAGCAACTTAAATCCCAGGGAGAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CATGGAGGCTGTGAGCTTAACCTGTGACCCTGAGACTCCAGACGCAAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107589 CATGGAGGCTGTGAGCTTAACCTGTGACCCTGAGACTCCAGACGCAAGCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 ACCTGTGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTATGACTCACAGCTTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107639 ACCTGTGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTATGACTCACAGCTTGAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 CTGTCCGAAACCAACAGGACCCTCTTTCTATTGGGTGTCACAAAGTATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107689 CTGTCCGAAACCAACAGGACCCTCTTTCTATTGGGTGTCACAAAGTATAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 TGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCCAGTGAGTGCCAGCCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107739 TGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCCAGTGAGTGCCAGCCGCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 GTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCC         CGAAGCTGCCCAAG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 107789 GTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCCGTG...CAGCGAAGCTGCCCAAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 CCCTACATCACCATCAACAACTTAAACCCCAGGGAGAATAAGGATGTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110562 CCCTACATCACCATCAACAACTTAAACCCCAGGGAGAATAAGGATGTCTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 AAACTTCACCTGTGAACCCAAGAGTGAGAACTACACCTACATTTGGTGGC
        |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
 110612 AAACTTCACCTGTGAACCTAAGAGTGAGAACTACACCTACATTTGGTGGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 TAAATGGTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCCAGGGTAAAGCGACCCATTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110662 TAAATGGTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCCAGGGTAAAGCGACCCATTGAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 AACAGGATCCTCATTCTACCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110712 AACAGGATCCTCATTCTACCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 TCAATGTGAAATACGGGACCGATATGGTGGCATCCGCAGTGACCCAGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110762 TCAATGTGAAATACGGGACCGATATGGTGGCATCCGCAGTGACCCAGTCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 CCCTGAATGTCCTCT         ATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTAC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 110812 CCCTGAATGTCCTCTGTG...CAGATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 CCTTCATTCACCTATTACCGTTCAGGAGAAGTCCTCTACTTGTCCTGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111253 CCTTCATTCACCTATTACCGTTCAGGAGAAGTCCTCTACTTGTCCTGTTC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1065 TGCGGACTCTAACCCACCGGCACAGTATTCTTGGACAATTAATGAAAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111303 TGCGGACTCTAACCCACCGGCACAGTATTCTTGGACAATTAATGAAAAGT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1115 TTCAGCTACCAGGACAAAAGCTCTTTATCCGCCATATTACTACAAAGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111353 TTCAGCTACCAGGACAAAAGCTCTTTATCCGCCATATTACTACAAAGCAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1165 AGCGGGCTCTATGTTTGCTCTGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111403 AGCGGGCTCTATGTTTGCTCTGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAAG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1215 CTCCAAATCCATGACAGTCGAAGTCTCTG         ACTGGACAGTTC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 111453 CTCCAAATCCATGACAGTCGAAGTCTCTGGTA...TAGACTGGACAGTTC

   1300 
   1256 CC
        ||
 112444 CC