seq1 = pF1KE0479.tfa, 945 bp
seq2 = pF1KE0479/gi568815591f_128648584.tfa (gi568815591f:128648584_128869164), 220581 bp

>pF1KE0479 945
>gi568815591f:128648584_128869164 (Chr7)

1-221  (100001-100221)   99% ->
222-415  (105679-105872)   100% ->
416-582  (110288-110454)   100% ->
583-643  (111209-111269)   100% ->
644-843  (118873-119072)   100% ->
844-945  (120480-120581)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACCTGCGACAGTTTCTTATGTGCCTGTCCCTGTGCACAGCCTTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGACCTGCGACAGTTTCTTATGTGCCTGTCCCTGTGCACAGCCTTTGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTTGAGCAAACCCACAGAAAAGAAGGACCGTGTACATCATGAGCCTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTTGAGCAAACCCACAGAAAAGAAGGACCGTGTACATCATGAGCCTCAGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCAGTGACAAGGTTCACAATGATGCTCAGAGTTTTGATTATGGCCATGAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
 100101 TCAGTGACAAGGTTCACAATGATGCTCAGAGTTTTGATTATGACCATGAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCCTTCTTGGGTGCTGAAGAAGCAAAGACCTTTGATCAGCTGACACCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCCTTCTTGGGTGCTGAAGAAGCAAAGACCTTTGATCAGCTGACACCAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AGAGAGCAAGGAAAGGCTTGG         AAAGATTGTAAGTAAAATAG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 100201 AGAGAGCAAGGAAAGGCTTGGGTA...CAGAAAGATTGTAAGTAAAATAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ATGGCGACAAGGACGGGTTTGTCACTGTGGATGAGCTCAAAGACTGGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105699 ATGGCGACAAGGACGGGTTTGTCACTGTGGATGAGCTCAAAGACTGGATT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AAATTTGCACAAAAGCGCTGGATTTACGAGGATGTAGAGCGACAGTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105749 AAATTTGCACAAAAGCGCTGGATTTACGAGGATGTAGAGCGACAGTGGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GGGGCATGACCTCAATGAGGACGGCCTCGTTTCCTGGGAGGAGTATAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105799 GGGGCATGACCTCAATGAGGACGGCCTCGTTTCCTGGGAGGAGTATAAAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 ATGCCACCTACGGCTACGTTTTAG         ATGATCCAGATCCTGAT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 105849 ATGCCACCTACGGCTACGTTTTAGGTA...TAGATGATCCAGATCCTGAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GATGGATTTAACTATAAACAGATGATGGTTAGAGATGAGCGGAGGTTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110305 GATGGATTTAACTATAAACAGATGATGGTTAGAGATGAGCGGAGGTTTAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 AATGGCAGACAAGGATGGAGACCTCATTGCCACCAAGGAGGAGTTCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110355 AATGGCAGACAAGGATGGAGACCTCATTGCCACCAAGGAGGAGTTCACAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 CTTTCCTGCACCCTGAGGAGTATGACTACATGAAAGATATAGTAGTACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110405 CTTTCCTGCACCCTGAGGAGTATGACTACATGAAAGATATAGTAGTACAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583          GAAACAATGGAAGATATAGATAAGAATGCTGATGGTTTCAT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110455 GTG...TAGGAAACAATGGAAGATATAGATAAGAATGCTGATGGTTTCAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 TGATCTAGAAGAGTATATTG         GTGACATGTACAGCCATGATG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 111250 TGATCTAGAAGAGTATATTGGTA...CAGGTGACATGTACAGCCATGATG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 GGAATACTGATGAGCCAGAATGGGTAAAGACAGAGCGAGAGCAGTTTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118894 GGAATACTGATGAGCCAGAATGGGTAAAGACAGAGCGAGAGCAGTTTGTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GAGTTTCGGGATAAGAACCGTGATGGGAAGATGGACAAGGAAGAGACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118944 GAGTTTCGGGATAAGAACCGTGATGGGAAGATGGACAAGGAAGAGACCAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 AGACTGGATCCTTCCCTCAGACTATGATCATGCAGAGGCAGAAGCCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118994 AGACTGGATCCTTCCCTCAGACTATGATCATGCAGAGGCAGAAGCCAGGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 ACCTGGTCTATGAATCAGACCAAAACAAG         GATGGCAAGCTT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 119044 ACCTGGTCTATGAATCAGACCAAAACAAGGTA...CAGGATGGCAAGCTT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 ACCAAGGAGGAGATCGTTGACAAGTATGACTTATTCGTTGGCAGCCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
 120492 ACCAAGGAGGAGATCGTTGACAAGTATGACTTATTTGTTGGCAGCCAGGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :
    906 CACAGATTTTGGGGAGGCCTTAGTACGGCATGATGAGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120542 CACAGATTTTGGGGAGGCCTTAGTACGGCATGATGAGTTC