seq1 = pF1KE0475.tfa, 756 bp
seq2 = pF1KE0475/gi568815582f_46589706.tfa (gi568815582f:46589706_46797582), 207877 bp

>pF1KE0475 756
>gi568815582f:46589706_46797582 (Chr16)

1-65  (100001-100065)   100% ->
66-195  (101286-101415)   100% ->
196-359  (102677-102840)   100% ->
360-449  (103388-103477)   100% ->
450-562  (105857-105969)   100% ->
563-631  (106312-106380)   100% ->
632-756  (107753-107877)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGTCGGAGCTGATCGGGCGCCTAGCCCCGCGCCTGGGCCTCGCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGGTCGGAGCTGATCGGGCGCCTAGCCCCGCGCCTGGGCCTCGCCGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCCCGACATGCTGAG         GAAAGCAGAGGAGTACTTGCGCCTGT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCCCGACATGCTGAGGTG...CAGGAAAGCAGAGGAGTACTTGCGCCTGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CCCGGGTGAAGTGTGTCGGCCTCTCCGCACGCACCACGGAGACCAGCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101312 CCCGGGTGAAGTGTGTCGGCCTCTCCGCACGCACCACGGAGACCAGCAGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCAGTCATGTGCCTGGACCTTGCAGCTTCCTGGATGAAGTGCCCCTTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101362 GCAGTCATGTGCCTGGACCTTGCAGCTTCCTGGATGAAGTGCCCCTTGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CAGG         GCTTATTTAATTAAACTTTCTGGTTTGAACAAGGAGA
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101412 CAGGGTA...CAGGCTTATTTAATTAAACTTTCTGGTTTGAACAAGGAGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CATATCAGAGCTGTCTTAAATCTTTTGAGTGTTTACTGGGCCTGAATTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102714 CATATCAGAGCTGTCTTAAATCTTTTGAGTGTTTACTGGGCCTGAATTCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AATATTGGAATAAGAGACCTAGCTGTACAGTTTAGCTGTATAGAAGCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102764 AATATTGGAATAAGAGACCTAGCTGTACAGTTTAGCTGTATAGAAGCAGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GAACATGGCTTCAAAGATACTAAAAAG         CTATGAGTCCAGTC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 102814 GAACATGGCTTCAAAGATACTAAAAAGGTA...TAGCTATGAGTCCAGTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TTCCCCAGACACAGCAAGTGGATCTTGACTTATCCAGGCCACTTTTCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103402 TTCCCCAGACACAGCAAGTGGATCTTGACTTATCCAGGCCACTTTTCACT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TCTGCTGCACTGCTTTCAGCATGCAA         GATTCTAAAGCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 103452 TCTGCTGCACTGCTTTCAGCATGCAAGTA...TAGGATTCTAAAGCTGAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 AGTGGATAAAAACAAAATGGTAGCCACATCCGGTGTAAAAAAAGCTATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105872 AGTGGATAAAAACAAAATGGTAGCCACATCCGGTGTAAAAAAAGCTATAT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TTGATCGACTGTGTAAACAACTAGAGAAGATTGGACAGCAGGTCGACA  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 105922 TTGATCGACTGTGTAAACAACTAGAGAAGATTGGACAGCAGGTCGACAGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    563        GAGAACCTGGAGATGTAGCTACTCCACCACGGAAGAGAAAGAA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105972 A...AAGGAGAACCTGGAGATGTAGCTACTCCACCACGGAAGAGAAAGAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GATAGTGGTTGAAGCCCCAGCAAAGG         AAATGGAGAAGGTAG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 106355 GATAGTGGTTGAAGCCCCAGCAAAGGGTA...CAGAAATGGAGAAGGTAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 AGGAGATGCCACATAAACCACAGAAAGATGAAGATCTGACACAGGATTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107768 AGGAGATGCCACATAAACCACAGAAAGATGAAGATCTGACACAGGATTAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 GAAGAATGGAAAAGAAAAATTTTGGAAAATGCTGCCAGTGCTCAAAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107818 GAAGAATGGAAAAGAAAAATTTTGGAAAATGCTGCCAGTGCTCAAAAGGC

    800     .    :
    747 TACAGCAGAG
        ||||||||||
 107868 TACAGCAGAG