seq1 = pF1KE0474.tfa, 501 bp
seq2 = pF1KE0474/gi568815597r_31808855.tfa (gi568815597r:31808855_32019065), 210211 bp

>pF1KE0474 501
>gi568815597r:31808855_32019065 (Chr1)

(complement)

1-96  (100001-100096)   100% ->
97-189  (103079-103171)   100% ->
190-320  (107240-107370)   100% ->
321-395  (108954-109028)   100% ->
396-501  (110106-110211)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAACCGTCCAGCCCCTGTGGAGATCTCCTATGAGAACATGCGTTTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAACCGTCCAGCCCCTGTGGAGATCTCCTATGAGAACATGCGTTTTCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GATAACTCACAACCCTACCAATGCTACTCTCAACAAGTTCACAGAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 100051 GATAACTCACAACCCTACCAATGCTACTCTCAACAAGTTCACAGAGGTA.

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     97      GAACTTAAGAAGTATGGAGTGACGACTTTGGTTCGAGTTTGTGAT
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ..AAGGAACTTAAGAAGTATGGAGTGACGACTTTGGTTCGAGTTTGTGAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCTACATATGATAAAGCTCCAGTTGAAAAAGAAGGAATCCACGTTCTA  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 103124 GCTACATATGATAAAGCTCCAGTTGAAAAAGAAGGAATCCACGTTCTAGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    190        GATTGGCCATTTGATGATGGAGCTCCACCCCCTAATCAGATAG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103174 G...CAGGATTGGCCATTTGATGATGGAGCTCCACCCCCTAATCAGATAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TAGATGATTGGTTAAACCTGTTAAAAACCAAATTTCGTGAAGAGCCAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107283 TAGATGATTGGTTAAACCTGTTAAAAACCAAATTTCGTGAAGAGCCAGGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TGCTGTGTTGCAGTGCATTGTGTTGCAGGATTGGGAAG         GGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 107333 TGCTGTGTTGCAGTGCATTGTGTTGCAGGATTGGGAAGGTA...CAGGGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 ACCTGTGCTGGTTGCACTTGCTTTGATTGAATGTGGAATGAAGTACGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108957 ACCTGTGCTGGTTGCACTTGCTTTGATTGAATGTGGAATGAAGTACGAAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ATGCAGTTCAGTTTATAAGACA         AAAAAGAAGGGGAGCGTTC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 109007 ATGCAGTTCAGTTTATAAGACAGTG...CAGAAAAAGAAGGGGAGCGTTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 AATTCCAAACAGCTGCTTTATTTGGAGAAATACCGACCTAAGATGCGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110125 AATTCCAAACAGCTGCTTTATTTGGAGAAATACCGACCTAAGATGCGATT

    500     .    :    .    :    .    :    .
    465 ACGCTTCAGAGATACCAATGGGCATTGCTGTGTTCAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110175 ACGCTTCAGAGATACCAATGGGCATTGCTGTGTTCAG