seq1 = pF1KE0471.tfa, 1317 bp
seq2 = pF1KE0471/gi568815579r_46369733.tfa (gi568815579r:46369733_46571035), 201303 bp

>pF1KE0471 1317
>gi568815579r:46369733_46571035 (Chr19)

(complement)

1-1303  (100001-101303)   99% ->
1304-1317  (102459-102472)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCAAGACCATGGCGATGAACCTTCTGGAGGATTGGTGCAGGGGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCCAAGACCATGGCGATGAACCTTCTGGAGGATTGGTGCAGGGGAAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGAAGTGGACATCCACAGGTCCTTGTTGGTCACAGGCATCCCAGAGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGAAGTGGACATCCACAGGTCCTTGTTGGTCACAGGCATCCCAGAGGACT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GTGGGCAGGCAGAAATTGAGGAGACCTTGAATGGGGTCCTCTCCCCACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GTGGGCAGGCAGAAATTGAGGAGACCTTGAATGGGGTCCTCTCCCCACTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGCCCGTACCGCGCGCTCAACAAGATTTTTGTGAGGGAAGAGAATGTTAA
        ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGCCCGTACCGCGTGCTCAACAAGATTTTTGTGAGGGAAGAGAATGTTAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AGCTGCCCTCATTGAGGTTGGTGAAGGTGTGAATCTGAGCACCATCCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AGCTGCCCTCATTGAGGTTGGTGAAGGTGTGAATCTGAGCACCATCCCCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GTGAATTCCCAGGAAGGGGTGGTGTCTGGAGAGTGGTCTGTAGAGACCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GTGAATTCCCAGGAAGGGGTGGTGTCTGGAGAGTGGTCTGTAGAGACCCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ACCCAGGATGCCGAGTTTTTAAAAAATCTGAATGAATTCCTGGATGCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ACCCAGGATGCCGAGTTTTTAAAAAATCTGAATGAATTCCTGGATGCCGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGGGCGCACCTGGGAGGATGTGGTCCGCCTGCTCCAGCTCAACCACCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGGGCGCACCTGGGAGGATGTGGTCCGCCTGCTCCAGCTCAACCACCCCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CCCTGTCCCAGAACCAGCATCAGCCCCCAGAGAACTGGGCAGAAGCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CCCTGTCCCAGAACCAGCATCAGCCCCCAGAGAACTGGGCAGAAGCTCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GGGGTGCTTCTGGGAGCAGTGGTGCAGATCATCTTCTGCATGGATGCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GGGGTGCTTCTGGGAGCAGTGGTGCAGATCATCTTCTGCATGGATGCCGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GATCCGCAGCCGGGAGGAAGCCAGGGCCCAGGAGGCCGCTGAATTCGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GATCCGCAGCCGGGAGGAAGCCAGGGCCCAGGAGGCCGCTGAATTCGAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AGATGGCAGCCTGGGCTTTAGCAGCAGGGAGGAAGGTGAAGAAAGAACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 AGATGGCAGCCTGGGCTTTAGCAGCAGGGAGGAAGGTGAAGAAAGAACCG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GGGCTTGCAGCAGAGGTGGGTTCTGCCTTAAAGGCAGAGACCCCCAACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GGGCTTGCAGCAGAGGTGGGTTCTGCCTTAAAGGCAGAGACCCCCAACAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CTGGAATGCCACGGAAGACCAGCATGAGCCTACCAAACCTTTGGTTCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CTGGAATGCCACGGAAGACCAGCATGAGCCTACCAAACCTTTGGTTCGCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GGGCTGGAGCTAAGTCTCGCTCCAGGAGAAAGAAGCAGAAGAAGAACTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GGGCTGGAGCTAAGTCTCGCTCCAGGAGAAAGAAGCAGAAGAAGAACTCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 AGGCAGGAAGCAGTGCCCTGGAAAAAACCCAAAGGCATCAATTCCAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 AGGCAGGAAGCAGTGCCCTGGAAAAAACCCAAAGGCATCAATTCCAACAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CACAGCTAACTTGGAGGATCCTGAGGTGGGTGATGCTGAAAGCATGGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CACAGCTAACTTGGAGGATCCTGAGGTGGGTGATGCTGAAAGCATGGCGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TCTCAGAGCCGATCAAGGGCAGCAGAAAGCCCTGTGTGAATAAGGAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TCTCAGAGCCGATCAAGGGCAGCAGAAAGCCCTGTGTGAATAAGGAGGAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 TTGGCTTTGAAGAAGCCCATGGCGAAATGTGCCTGGAAGGGTCCCAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 TTGGCTTTGAAGAAGCCCATGGCGAAATGTGCCTGGAAGGGTCCCAGAGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GCCACCTCAGGATGCCCGGGCAGAAGCCGAGAGCCCAGGAGGCGCCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GCCACCTCAGGATGCCCGGGCAGAAGCCGAGAGCCCAGGAGGCGCCTCTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 AGTCAGACCAAGATGGTGGCCATGAAAGCCCACCAAAGAAGAAGGCCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 AGTCAGACCAAGATGGTGGCCATGAAAGCCCACCAAAGAAGAAGGCCGTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GCCTGGGTGTCTGCCAAGAACCCCGCTCCCATGAGGAAGAAGAAGAAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GCCTGGGTGTCTGCCAAGAACCCCGCTCCCATGAGGAAGAAGAAGAAGGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 GAGCTTGGGCCCTGTCTCCTACGTCTTGGTTGACTCAGAAGATGGCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 GAGCTTGGGCCCTGTCTCCTACGTCTTGGTTGACTCAGAAGATGGCAGGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 AGAAGCCGGTGATGCCAAAGAAAGGGCCAGGCTCAAGAAGGGAGGCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 AGAAGCCGGTGATGCCAAAGAAAGGGCCAGGCTCAAGAAGGGAGGCATCA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 GATCAGAAGGCCCCTCGGGGCCAGCAGCCTGCCGAGGCAACAGCCTCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 GATCAGAAGGCCCCTCGGGGCCAGCAGCCTGCCGAGGCAACAGCCTCAAC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 CTCTAGGGGTCCGAAGGCCAAGCCAGAAGGCTCTCCTCGGCGTGCCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 CTCTAGGGGTCCGAAGGCCAAGCCAGAAGGCTCTCCTCGGCGTGCCACCA

   1300     .    :    .    :    .
   1301 ATG         AATCCAGAAAGGTT
        |||>>>...>>>||||||||||||||
 101301 ATGGTG...CAGAATCCAGAAAGGTT