seq1 = pF1KE0468.tfa, 1155 bp
seq2 = pF1KE0468/gi568815579r_40221885.tfa (gi568815579r:40221885_40436408), 214524 bp

>pF1KE0468 1155
>gi568815579r:40221885_40436408 (Chr19)

(complement)

1-19  (94552-94570)   100% ->
20-107  (100002-100089)   100% ->
108-222  (100185-100299)   100% ->
223-301  (102480-102558)   100% ->
302-439  (107859-107996)   100% ->
440-592  (109923-110075)   100% ->
593-663  (112333-112403)   100% ->
664-1155  (114033-114524)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTCTCCGTGACTATGG         CCACTTCCGAGTGGATCCAGTT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
  94552 ATGGTCTCCGTGACTATGGGTG...CAGCCACTTCCGAGTGGATCCAGTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 CTTTAAGGAAGCCGGCATTCCTCCAGGACCTGCCGTCAATTATGCCGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100024 CTTTAAGGAAGCCGGCATTCCTCCAGGACCTGCCGTCAATTATGCCGTGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGTTTGTGGATAATAG         GATTCAGAAGAGCATGCTGCTGGAT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 100074 TGTTTGTGGATAATAGGTG...CAGGATTCAGAAGAGCATGCTGCTGGAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 CTCAATAAGGAGATAATGAATGAGCTGGGCGTGACCGTGGTGGGTGACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100210 CTCAATAAGGAGATAATGAATGAGCTGGGCGTGACCGTGGTGGGTGACAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CATCGCCATTCTCAAGCATGCCAAAGTGGTGCACCGTCAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 100260 CATCGCCATTCTCAAGCATGCCAAAGTGGTGCACCGTCAGGTG...CAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 ACATGTGCAAAGCTGCCACTGAGTCAGTACCCTGCAGCCCTAGCCCCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102481 ACATGTGCAAAGCTGCCACTGAGTCAGTACCCTGCAGCCCTAGCCCCCTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GCAGGCGAAATTCGCCGTGGCACCAGTG         CTGCCTCCCGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 102531 GCAGGCGAAATTCGCCGTGGCACCAGTGGTG...CAGCTGCCTCCCGAAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 GATCACCAACAGCCTGAACCATGACTCTCCACCCAGCACACCCCCCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107872 GATCACCAACAGCCTGAACCATGACTCTCCACCCAGCACACCCCCCAGGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 GCCCGGACACCAGCACCTCCAAGATCTCGGTCACTGTGTCCAACAAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107922 GCCCGGACACCAGCACCTCCAAGATCTCGGTCACTGTGTCCAACAAGATG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GCAGCAAAGAGTGCCAAGGCCACTG         CAGCCCTGGCCCGCCG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 107972 GCAGCAAAGAGTGCCAAGGCCACTGGTG...CAGCAGCCCTGGCCCGCCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 GGAGGAGGAGAGCCTGGCTGTTCCTGCCAAGCGGCGCCGGGTCACTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109939 GGAGGAGGAGAGCCTGGCTGTTCCTGCCAAGCGGCGCCGGGTCACTGCTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 AGATGGAGGGGAAGTACGTCATCAACATGCCCAAAGGCACCACACCCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109989 AGATGGAGGGGAAGTACGTCATCAACATGCCCAAAGGCACCACACCCCGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 ACCCGCAAGATCCTGGAGCAGCAGCAGGCTGCAAAAG         GTCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 110039 ACCCGCAAGATCCTGGAGCAGCAGCAGGCTGCAAAAGGTA...CAGGTCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 CCATAGGACGTCTGTGTTTGACCGCCTCGGCGCCGAGACCAAGGCAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112337 CCATAGGACGTCTGTGTTTGACCGCCTCGGCGCCGAGACCAAGGCAGACA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 CCACGACAGGGAGTAAA         CCCACAGGAGTCTTCAGCCGCCTG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 112387 CCACGACAGGGAGTAAAGTG...CAGCCCACAGGAGTCTTCAGCCGCCTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 GGGGCCACCCCAGAAACGGACGAGGATCTGGCTTGGGACAGCGACAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114057 GGGGCCACCCCAGAAACGGACGAGGATCTGGCTTGGGACAGCGACAATGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 CAGCAGCAGCTCTGTCTTGCAGTATGCCGGGGTCCTGAAGAAGCTAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114107 CAGCAGCAGCTCTGTCTTGCAGTATGCCGGGGTCCTGAAGAAGCTAGGAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 GGGGCCCAGCCAAGGCCAGTCCCCAGCCAGCACTGACTGTCAAAGCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114157 GGGGCCCAGCCAAGGCCAGTCCCCAGCCAGCACTGACTGTCAAAGCCAAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 GCCACAAGCTCAGCGACAACGGCTGCTGCCCCGACACTGCGGCGCCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114207 GCCACAAGCTCAGCGACAACGGCTGCTGCCCCGACACTGCGGCGCCTGGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 GCTTTCCTCACGGTCTGGGCTTGAGAGGAAGCCGGAGTCCTTGTCTAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114257 GCTTTCCTCACGGTCTGGGCTTGAGAGGAAGCCGGAGTCCTTGTCTAAAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 TCAGCATCATCAAGAGACTGGGCGCAGCTGCCCTTGTGCCCGAGGCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114307 TCAGCATCATCAAGAGACTGGGCGCAGCTGCCCTTGTGCCCGAGGCCCAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 GACAGCCAGGTCACCAGCACCAAGAGTAAGTCCTCAGCCGAGGTCAAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114357 GACAGCCAGGTCACCAGCACCAAGAGTAAGTCCTCAGCCGAGGTCAAGGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 CACCATTAAGAGGACTCTGGTGGGGCCCCGGGGGAGCAGCTCCAGCGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114407 CACCATTAAGAGGACTCTGGTGGGGCCCCGGGGGAGCAGCTCCAGCGAGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 GCCTTGGTGCCCAGATGGACCACGCGGGCACTGTGAGCGTGTTCAAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114457 GCCTTGGTGCCCAGATGGACCACGCGGGCACTGTGAGCGTGTTCAAAAGA

   1200     .    :    .
   1138 CTGGGCCGCAGGACCTTC
        ||||||||||||||||||
 114507 CTGGGCCGCAGGACCTTC