seq1 = pF1KE0465.tfa, 657 bp
seq2 = pF1KE0465/gi568815594f_70054376.tfa (gi568815594f:70054376_70258901), 204526 bp

>pF1KE0465 657
>gi568815594f:70054376_70258901 (Chr4)

1-51  (100001-100051)   100% ->
52-75  (101679-101702)   100% ->
76-649  (103953-104526)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGCTTCTCCTTTGGGCCTGCATTGTATGTGTTGCTTTTGCAAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAGCTTCTCCTTTGGGCCTGCATTGTATGTGTTGCTTTTGCAAGGAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 G         AGACGGTTCCCCTTCATTGGTGAG         GATGACA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 100051 GGTA...TAGAGACGGTTCCCCTTCATTGGTGAGGTA...TAGGATGACA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     83 ATGACGATGGTCACCCACTTCATCCATCTCTGAATATTCCTTATGGCATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103960 ATGACGATGGTCACCCACTTCATCCATCTCTGAATATTCCTTATGGCATA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 CGGAATTTACCACCTCCTCTTTATTATCGCCCAGTGAATACAGTCCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104010 CGGAATTTACCACCTCCTCTTTATTATCGCCCAGTGAATACAGTCCCCAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TTACCCTGGGAATACTTACACTGACACAGGGTTACCTTCGTATCCCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104060 TTACCCTGGGAATACTTACACTGACACAGGGTTACCTTCGTATCCCTGGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TTCTAACTTCTCCTGGATTCCCCTATGTCTATCACATCCGTGGTTTTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104110 TTCTAACTTCTCCTGGATTCCCCTATGTCTATCACATCCGTGGTTTTCCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TTAGCTACTCAGTTGAATGTTCCTCCTCTCCCTCCTAGGGGTTTCCCGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104160 TTAGCTACTCAGTTGAATGTTCCTCCTCTCCCTCCTAGGGGTTTCCCGTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGTCCCTCCTTCAAGGTTTTTTTCAGCAGCTGCAGCACCCGCTGCCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104210 TGTCCCTCCTTCAAGGTTTTTTTCAGCAGCTGCAGCACCCGCTGCCCCAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CTATTGCAGCTGAGCCTGCTGCAGCTGCACCTCTTACAGCCACACCTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104260 CTATTGCAGCTGAGCCTGCTGCAGCTGCACCTCTTACAGCCACACCTGTA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GCAGCTGAGCCTGCTGCAGGGGCCCCTGTTGCAGCTGAGCCTGCTGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104310 GCAGCTGAGCCTGCTGCAGGGGCCCCTGTTGCAGCTGAGCCTGCTGCAGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GGCACCTGTTGGAGCTGAGCCTGCTGCAGAGGCACCTGTTGCAGCTGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104360 GGCACCTGTTGGAGCTGAGCCTGCTGCAGAGGCACCTGTTGCAGCTGAGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 CTGCTGCAGAGGCACCTGTTGGAGTGGAGCCAGCTGCAGAGGAACCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104410 CTGCTGCAGAGGCACCTGTTGGAGTGGAGCCAGCTGCAGAGGAACCTTCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 CCAGCTGAGCCTGCTACAGCCAAGCCTGCTGCCCCAGAACCTCACCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104460 CCAGCTGAGCCTGCTACAGCCAAGCCTGCTGCCCCAGAACCTCACCCTTC

    650     .    :    .
    633 TCCCTCTCTTGAACAGG
        |||||||||||||||||
 104510 TCCCTCTCTTGAACAGG