seq1 = pF1KE0462.tfa, 681 bp
seq2 = pF1KE0462/gi568815591r_44479482.tfa (gi568815591r:44479482_44682206), 202725 bp

>pF1KE0462 681
>gi568815591r:44479482_44682206 (Chr7)

(complement)

1-160  (100001-100160)   100% ->
161-261  (100384-100484)   100% ->
262-387  (100633-100758)   100% ->
388-534  (100968-101114)   99% ->
535-681  (102579-102725)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAGGTGTCGGGGCTGGGCCTCTGCGGGCGATGGGGCGGCAGGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCAGGTGTCGGGGCTGGGCCTCTGCGGGCGATGGGGCGGCAGGCCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTGCTTCTCGCGCTGTGCGCCACAGGCGCCCAGGGGCTCTACTTCCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTGCTTCTCGCGCTGTGCGCCACAGGCGCCCAGGGGCTCTACTTCCACA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCGGCGAGACCGAGAAGCGCTGTTTCATCGAGGAAATCCCCGACGAGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCGGCGAGACCGAGAAGCGCTGTTTCATCGAGGAAATCCCCGACGAGACC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATGGTCATCG         GCAACTATCGTACCCAGATGTGGGATAAGCA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ATGGTCATCGGTC...CAGGCAACTATCGTACCCAGATGTGGGATAAGCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GAAGGAGGTCTTCCTGCCCTCGACCCCTGGCCTGGGCATGCACGTGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100415 GAAGGAGGTCTTCCTGCCCTCGACCCCTGGCCTGGGCATGCACGTGGAAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGAAGGACCCCGACGGCAAG         GTGGTGCTGTCCCGGCAGTAC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100465 TGAAGGACCCCGACGGCAAGGTA...CAGGTGGTGCTGTCCCGGCAGTAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GGCTCGGAGGGCCGCTTCACGTTCACCTCCCACACGCCCGGTGACCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100654 GGCTCGGAGGGCCGCTTCACGTTCACCTCCCACACGCCCGGTGACCATCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AATCTGTCTGCACTCCAATTCTACCAGGATGGCTCTCTTCGCTGGTGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100704 AATCTGTCTGCACTCCAATTCTACCAGGATGGCTCTCTTCGCTGGTGGCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AACTG         CGTGTGCATCTCGACATCCAGGTTGGGGAGCATGCC
        |||||>>>...>>>|| |||||||||||||||||||||||||||||||||
 100754 AACTGGTA...TAGCGGGTGCATCTCGACATCCAGGTTGGGGAGCATGCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AACAACTACCCTGAGATTGCTGCAAAAGATAAGCTGACGGAGCTACAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101004 AACAACTACCCTGAGATTGCTGCAAAAGATAAGCTGACGGAGCTACAGCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CCGCGCCCGCCAGTTGCTTGATCAGGTGGAACAGATTCAGAAGGAGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101054 CCGCGCCCGCCAGTTGCTTGATCAGGTGGAACAGATTCAGAAGGAGCAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 ATTACCAAAGG         TATCGTGAAGAGCGCTTCCGACTGACGAGC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 101104 ATTACCAAAGGGCA...CAGTATCGTGAAGAGCGCTTCCGACTGACGAGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GAGAGCACCAACCAGAGGGTCCTATGGTGGTCCATTGCTCAGACTGTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102609 GAGAGCACCAACCAGAGGGTCCTATGGTGGTCCATTGCTCAGACTGTCAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CCTCATCCTCACTGGCATCTGGCAGATGCGTCACCTCAAGAGCTTCTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102659 CCTCATCCTCACTGGCATCTGGCAGATGCGTCACCTCAAGAGCTTCTTTG

    700     .    :    .
    665 AGGCCAAGAAGCTGGTG
        |||||||||||||||||
 102709 AGGCCAAGAAGCTGGTG