seq1 = pF1KE0459.tfa, 474 bp
seq2 = pF1KE0459/gi568815582r_87205762.tfa (gi568815582r:87205762_87417242), 211481 bp

>pF1KE0459 474
>gi568815582r:87205762_87417242 (Chr16)

(complement)

1-158  (100001-100156)   98% ->
159-204  (101426-101471)   100% ->
205-330  (102147-102272)   99% ->
331-474  (111338-111481)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCGTGCGAGCCGGTCCCCACCGTCCCCGCGGCGTTGTCACCATCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCGTGCGAGCCGGTCCCCACCGTCCCCGCGGCGTTGTCACCATCATCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGAGGCCACTGGAGCAGCCTCAGGCGCTGCTGCCGGGGGGCCGGGCGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGAGGCCACTGGAGCAGCCTCAGGCGCTGCTGCCGGGGGGCCGGGCGCGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGTGCGTCGGGCTCTGCAGGTTGGCACTCACACCCAGCGCGCAGGATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGTGCGTCGGGCTCTGCAGGTTGGCACTCACACCCAGCGCGCAGGATGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AGGAATAG         CACATTTCAAACCTACAAGAAAGAAGTGTGCCT
        ||| |-|->>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AGGCA A GTG...TAGCACATTTCAAACCTACAAGAAAGAAGTGTGCCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCCCCGTCATTCG         ATGCACCCTGGTCCCTGGGCCATCTGCT
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||| ||||||||||||||||
 101459 CCCCCGTCATTCGGTA...CAGATGCACCCTGGCCCCTGGGCCATCTGCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GTGAATGCCAGACCAGATTCGGGGGCCGCCTGCCTGTGTCCAGGGTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102175 GTGAATGCCAGACCAGATTCGGGGGCCGCCTGCCTGTGTCCAGGGTGGAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GCAGCACTGCCTTACTGGGTCCCTCTGTCCCTGAGACCCCGAAAGCAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 102225 GCAGCACTGCCTTACTGGGTCCCTCTGTCCCTGAGACCCCGAAAGCAGGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    331        CACCCCTGCTGGATGCATGCTGCTGGCACAACTGCTGGCGGAT
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102275 A...TAGCACCCCTGCTGGATGCATGCTGCTGGCACAACTGCTGGCGGAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CTGCGGTGATGAGTGCCTGTTGTCCAAGTTCCAGCAGCTCCAGGCCCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111381 CTGCGGTGATGAGTGCCTGTTGTCCAAGTTCCAGCAGCTCCAGGCCCCCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 ACCAGGACCAGCTACCGGCTCCTGCAGCGCGTCTGCTGCCCCTCGGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111431 ACCAGGACCAGCTACCGGCTCCTGCAGCGCGTCTGCTGCCCCTCGGCCTC

    500 
    474 C
        |
 111481 C