seq1 = pF1KE0456.tfa, 822 bp
seq2 = pF1KE0456/gi568815582r_29925186.tfa (gi568815582r:29925186_30130527), 205342 bp

>pF1KE0456 822
>gi568815582r:29925186_30130527 (Chr16)

(complement)

1-125  (100001-100125)   100% ->
126-209  (101013-101096)   100% ->
210-444  (103685-103919)   99% ->
445-540  (104707-104802)   100% ->
541-822  (105061-105342)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTGACCCCGATGGTGGCCGGGGGGGTGGTGTTCCCCGGACTCTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTGACCCCGATGGTGGCCGGGGGGGTGGTGTTCCCCGGACTCTTCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTCTCCAAGAACACGCTCCAGCGGCTGCCCCAGCTACGCTGGGAGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTCTCCAAGAACACGCTCCAGCGGCTGCCCCAGCTACGCTGGGAGGAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCGACGCAGTCATTGTCTCAGCCAG         GCTGGTGTCCTCTGTC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 100101 CCGACGCAGTCATTGTCTCAGCCAGGTA...CAGGCTGGTGTCCTCTGTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CAGGCCATCATGGCCTCCACTGCCGGCTACATCGTCTCCACCTCCTGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101029 CAGGCCATCATGGCCTCCACTGCCGGCTACATCGTCTCCACCTCCTGCAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCACATCATTGATGACCA         ACACTGGCTGTCCTCTGCCTACA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 101079 GCACATCATTGATGACCAGTA...CAGACACTGGCTGTCCTCTGCCTACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CGCAATTTGCTGTGCCCTACTTCATCTACGACATCTACGCCATGTTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103708 CGCAATTTGCTGTGCCCTACTTCATCTACGACATCTACGCCATGTTCCTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TGTCACCGGCACAAGCACCAGGTCAAAGGGCATGGAGGGGACGACGGAGC
        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103758 TGTCACTGGCACAAGCACCAGGTCAAAGGGCATGGAGGGGACGACGGAGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GGCCAGAGCCCCGGGCAGCACGTGGGCCATAGCGCGTGGCTACCTGCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103808 GGCCAGAGCCCCGGGCAGCACGTGGGCCATAGCGCGTGGCTACCTGCACA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AGGAGTTCCTCATGGTGCTCCACCATGCCGCCATGGTGCTGGTGTGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103858 AGGAGTTCCTCATGGTGCTCCACCATGCCGCCATGGTGCTGGTGTGCTTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CCACTCTCAGTG         GTGTGGCGACAGGGTAAGGGAGACTTCTT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 103908 CCACTCTCAGTGGTG...CAGGTGTGGCGACAGGGTAAGGGAGACTTCTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TCTGGGTTGCATGTTGATGGCAGAGGTCAGCACGCCCTTCGTCTGCCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104736 TCTGGGTTGCATGTTGATGGCAGAGGTCAGCACGCCCTTCGTCTGCCTTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GCAAGATCCTCATCCAG         TACAAGCAGCAGCACACACTGCTG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 104786 GCAAGATCCTCATCCAGGTG...CAGTACAAGCAGCAGCACACACTGCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CACAAGGTGAACGGGGCCCTGATGCTGCTCAGCTTCCTCTGCTGCCGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105085 CACAAGGTGAACGGGGCCCTGATGCTGCTCAGCTTCCTCTGCTGCCGGGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GCTGCTCTTTCCCTACCTGTACTGGGCCTACGGGCGCCATGCCGGCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105135 GCTGCTCTTTCCCTACCTGTACTGGGCCTACGGGCGCCATGCCGGCCTGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CCCTGCTGGCCGTGCCCCTGGCCATCCCTGCCCACGTCAACCTGGGCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105185 CCCTGCTGGCCGTGCCCCTGGCCATCCCTGCCCACGTCAACCTGGGCGCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GCGCTGCTCCTGGCCCCTCAGCTCTACTGGTTCTTCCTCATCTGCCGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105235 GCGCTGCTCCTGGCCCCTCAGCTCTACTGGTTCTTCCTCATCTGCCGTGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 GGCCTGCCGCCTCTTCTGGCCCCGCTCCCGGCCGCCCCCGGCCTGCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105285 GGCCTGCCGCCTCTTCTGGCCCCGCTCCCGGCCGCCCCCGGCCTGCCAGG

    850     .
    815 CCCAGGAC
        ||||||||
 105335 CCCAGGAC