seq1 = pF1KE0451.tfa, 924 bp
seq2 = pF1KE0451/gi568815597f_161126490.tfa (gi568815597f:161126490_161329092), 202603 bp

>pF1KE0451 924
>gi568815597f:161126490_161329092 (Chr1)

1-115  (100001-100115)   100% ->
116-183  (100399-100466)   100% ->
184-276  (100769-100861)   100% ->
277-378  (101147-101248)   100% ->
379-484  (101395-101500)   100% ->
485-607  (101697-101819)   100% ->
608-684  (101939-102015)   100% ->
685-787  (102226-102328)   100% ->
788-924  (102467-102603)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGAACACATTGGGCCTGGCACCAATGGGGACTTTGCCCCGCCGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGGAACACATTGGGCCTGGCACCAATGGGGACTTTGCCCCGCCGGAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCCCCGCCGAGAGGAACCCCTGCCCAACCCTGGGAGCTTCGATGAGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCCCCGCCGAGAGGAACCCCTGCCCAACCCTGGGAGCTTCGATGAGCTGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACCGTCTATGCAAAG         ATGTATTCCCAGCACAGATGGAGGGA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACCGTCTATGCAAAGGTG...CAGATGTATTCCCAGCACAGATGGAGGGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GTGAAGCTCGTTGTCAACAAGGTTCTGAGCAGCCATTTCCAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 100425 GTGAAGCTCGTTGTCAACAAGGTTCTGAGCAGCCATTTCCAGGTG...CA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    184  GTGGCGCACACTATACACATGAGTGCCCTGGGCTTGCCGGGATATCACC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100768 GGTGGCGCACACTATACACATGAGTGCCCTGGGCTTGCCGGGATATCACC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TCCATGCGGCCTATGCAGGGGATTGGCAGCTCAGTCCCACTGAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 100818 TCCATGCGGCCTATGCAGGGGATTGGCAGCTCAGTCCCACTGAGGTG...

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    277    GTGTTCCCCACTGTGGTAGGGGATATGGACAGCAGTGGCAGCCTGAA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101144 CAGGTGTTCCCCACTGTGGTAGGGGATATGGACAGCAGTGGCAGCCTGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CGCCCAGGTCTTGCTCCTCTTGGCAGAGCGGCTCCGAGCTAAGGCTGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101194 CGCCCAGGTCTTGCTCCTCTTGGCAGAGCGGCTCCGAGCTAAGGCTGTCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TCCAG         ACGCAGCAGGCCAAGTTCCTGACATGGCAGTTTGAT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101244 TCCAGGTG...CAGACGCAGCAGGCCAAGTTCCTGACATGGCAGTTTGAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GGCGAGTATCGGGGAGATGACTACACAGCCACTCTGACCCTAGGAAATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101431 GGCGAGTATCGGGGAGATGACTACACAGCCACTCTGACCCTAGGAAATCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TGACCTGATTGGGGAGTCGG         TGATCATGGTTGCTCACTTCC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 101481 TGACCTGATTGGGGAGTCGGGTG...CAGTGATCATGGTTGCTCACTTCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 TGCAGAGCCTCACTCATCGGCTGGTGCTGGGAGGAGAGCTAGTTTATCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101718 TGCAGAGCCTCACTCATCGGCTGGTGCTGGGAGGAGAGCTAGTTTATCAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 CGGCGGCCAGGCGAAGAGGGGGCCATCTTGACACTGGCTGGGAAGTACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101768 CGGCGGCCAGGCGAAGAGGGGGCCATCTTGACACTGGCTGGGAAGTACTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GG         CTGTACACTGGGTAGCTACATTGAATGTGGGATCAGGCG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101818 GGGTA...CAGCTGTACACTGGGTAGCTACATTGAATGTGGGATCAGGCG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 GGGCCCATGCAAGTTACTACCACAGGGCAAATGAACAG         GTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 101978 GGGCCCATGCAAGTTACTACCACAGGGCAAATGAACAGGTG...CAGGTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 CAGGTTGGAGTGGAGTTTGAGGCAAACACAAGGCTACAAGACACAACATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102229 CAGGTTGGAGTGGAGTTTGAGGCAAACACAAGGCTACAAGACACAACATT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 CTCCTTTGGTTACCACCTGACTCTGCCCCAGGCCAACATGGTATTTAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102279 CTCCTTTGGTTACCACCTGACTCTGCCCCAGGCCAACATGGTATTTAGAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788          GCTTGGTGGATAGTAACTGGTGTGTAGGTGCTGTGCTGGAG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102329 GTG...CAGGCTTGGTGGATAGTAACTGGTGTGTAGGTGCTGTGCTGGAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 AAGAAGATGCCCCCTCTGCCTGTCACCCTAGCCCTTGGAGCCTTCCTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102508 AAGAAGATGCCCCCTCTGCCTGTCACCCTAGCCCTTGGAGCCTTCCTCAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    879 TCACTGGCGCAACAGATTCCATTGTGGCTTCAGCATCACTGTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102558 TCACTGGCGCAACAGATTCCATTGTGGCTTCAGCATCACTGTGGGC