seq1 = pF1KE0447.tfa, 525 bp
seq2 = pF1KE0447/gi568815587r_111808767.tfa (gi568815587r:111808767_112011724), 202958 bp

>pF1KE0447 525
>gi568815587r:111808767_112011724 (Chr11)

(complement)

1-201  (100001-100201)   100% ->
202-324  (101276-101398)   99% ->
325-525  (102758-102958)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACATCGCCATCCACCACCCCTGGATCCGCCGCCCCTTCTTTCCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGACATCGCCATCCACCACCCCTGGATCCGCCGCCCCTTCTTTCCTTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCACTCCCCCAGCCGCCTCTTTGACCAGTTCTTCGGAGAGCACCTGTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCACTCCCCCAGCCGCCTCTTTGACCAGTTCTTCGGAGAGCACCTGTTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGTCTGATCTTTTCCCGACGTCTACTTCCCTGAGTCCCTTCTACCTTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGTCTGATCTTTTCCCGACGTCTACTTCCCTGAGTCCCTTCTACCTTCGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCACCCTCCTTCCTGCGGGCACCCAGCTGGTTTGACACTGGACTCTCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CCACCCTCCTTCCTGCGGGCACCCAGCTGGTTTGACACTGGACTCTCAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 G         ATGCGCCTGGAAAAGGACAGGTTCTCTGTCAACCTGGATG
        |>>>...>>>||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGTG...TAGATGCGCCTGGAGAAGGACAGGTTCTCTGTCAACCTGGATG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGAAGCACTTCTCCCCAGAGGAACTCAAAGTTAAGGTGTTGGGAGATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101316 TGAAGCACTTCTCCCCAGAGGAACTCAAAGTTAAGGTGTTGGGAGATGTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 ATTGAGGTGCATGGAAAACATGAAGAGCGCCAG         GATGAACA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 101366 ATTGAGGTGCATGGAAAACATGAAGAGCGCCAGGTA...TAGGATGAACA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGGTTTCATCTCCAGGGAGTTCCACAGGAAATACCGGATCCCAGCTGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102766 TGGTTTCATCTCCAGGGAGTTCCACAGGAAATACCGGATCCCAGCTGATG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TAGACCCTCTCACCATTACTTCATCCCTGTCATCTGATGGGGTCCTCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102816 TAGACCCTCTCACCATTACTTCATCCCTGTCATCTGATGGGGTCCTCACT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GTGAATGGACCAAGGAAACAGGTCTCTGGCCCTGAGCGCACCATTCCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102866 GTGAATGGACCAAGGAAACAGGTCTCTGGCCCTGAGCGCACCATTCCCAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CACCCGTGAAGAGAAGCCTGCTGTCACCGCAGCCCCCAAGAAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102916 CACCCGTGAAGAGAAGCCTGCTGTCACCGCAGCCCCCAAGAAA