seq1 = pF1KE0442.tfa, 969 bp
seq2 = pF1KE0442/gi568815596r_16452939.tfa (gi568815596r:16452939_16688119), 235181 bp

>pF1KE0442 969
>gi568815596r:16452939_16688119 (Chr2)

(complement)

1-70  (100001-100070)   100% ->
71-192  (122353-122474)   100% ->
193-298  (124026-124131)   100% ->
299-435  (125979-126115)   100% ->
436-513  (126587-126664)   100% ->
514-630  (126843-126959)   100% ->
631-710  (127051-127130)   100% ->
711-837  (128534-128660)   100% ->
838-908  (132981-133051)   100% ->
909-969  (135121-135181)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGAAACCTGCTCAAAGTCCTTACCAGGGAAATTGAAAACTATCCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGAAACCTGCTCAAAGTCCTTACCAGGGAAATTGAAAACTATCCACA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTTTTTCCTGGATTTTGAAA         ATGCTCAGCCTACAGAAGGAG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100051 CTTTTTCCTGGATTTTGAAAGTA...TAGATGCTCAGCCTACAGAAGGAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGAGAGAAATCTGGAACCAGATCAGCGCCGTCCTTCAGGATTCTGAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122374 AGAGAGAAATCTGGAACCAGATCAGCGCCGTCCTTCAGGATTCTGAGAGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATCCTTGCAGACCTGCAGGCTTACAAAGGCGCAGGCCCAGAGATCCGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122424 ATCCTTGCAGACCTGCAGGCTTACAAAGGCGCAGGCCCAGAGATCCGAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 T         GCAATTCAAAATCCCAATGACATTCAGCTTCAAGAAAAAG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122474 TGTA...CAGGCAATTCAAAATCCCAATGACATTCAGCTTCAAGAAAAAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CTTGGAATGCGGTGTGCCCTCTTGTTGTGAGGCTAAAGAGATTTTACGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124066 CTTGGAATGCGGTGTGCCCTCTTGTTGTGAGGCTAAAGAGATTTTACGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TTTTCCATTAGACTAG         AAAAAGCTCTTCAGAGTTTATTGGA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 124116 TTTTCCATTAGACTAGGTG...CAGAAAAAGCTCTTCAGAGTTTATTGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 ATCTCTGACTTGTCCACCCTACACACCAACCCAACACCTGGAAAGGGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126004 ATCTCTGACTTGTCCACCCTACACACCAACCCAACACCTGGAAAGGGAAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AGGCCCTGGCAAAGGAGTTTGCCGAAATTTTACATTTTACCCTTCGATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126054 AGGCCCTGGCAAAGGAGTTTGCCGAAATTTTACATTTTACCCTTCGATTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GATGAGCTGAAG         ATGAGGAACCCGGCTATTCAGAATGACTT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 126104 GATGAGCTGAAGGTT...CAGATGAGGAACCCGGCTATTCAGAATGACTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CAGCTACTACAGAAGAACAATCAGTCGCAACCGCATCAACAACATGCAC 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 126616 CAGCTACTACAGAAGAACAATCAGTCGCAACCGCATCAACAACATGCACG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    514         CTAGACATTGAGAATGAAGTCAATAATGAGATGGCCAATCGA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126666 TG...CAGCTAGACATTGAGAATGAAGTCAATAATGAGATGGCCAATCGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 ATGTCCCTCTTCTATGCAGAAGCCACGCCAATGCTGAAAACCCTTAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126885 ATGTCCCTCTTCTATGCAGAAGCCACGCCAATGCTGAAAACCCTTAGCAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TGCCACAATGCACTTTGTCTCTGAA         AACAAAACTCTGCCAA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 126935 TGCCACAATGCACTTTGTCTCTGAAGTA...TAGAACAAAACTCTGCCAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 TAGAGAACACCACAGACTGCCTCAGCACAATGACAAGTGTCTGTAAAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127067 TAGAGAACACCACAGACTGCCTCAGCACAATGACAAGTGTCTGTAAAGTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 ATGCTGGAAACTCC         GGAGTACAGAAGTAGGTTTACGAGTGA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 127117 ATGCTGGAAACTCCGTA...CAGGGAGTACAGAAGTAGGTTTACGAGTGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 AGAGACCCTGATGTTCTGCATGAGGGTGATGGTGGGAGTCATCATCCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128561 AGAGACCCTGATGTTCTGCATGAGGGTGATGGTGGGAGTCATCATCCTCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 ATGACCATGTCCACCCTGTGGGAGCTTTCTGCAAGACATCCAAGATCGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128611 ATGACCATGTCCACCCTGTGGGAGCTTTCTGCAAGACATCCAAGATCGAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838          ATGAAAGGCTGCATAAAAGTTTTGAAGGAGCAGGCCCCAGA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128661 GTA...TAGATGAAAGGCTGCATAAAAGTTTTGAAGGAGCAGGCCCCAGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 CAGTGTGGAGGGGCTGCTAAATGCCCTCAG         GTTCACTACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 133022 CAGTGTGGAGGGGCTGCTAAATGCCCTCAGGTG...CAGGTTCACTACAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 AGCACTTGAACGATGAATCAACTTCCAAACAGATTCGAGCAATGCTTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135132 AGCACTTGAACGATGAATCAACTTCCAAACAGATTCGAGCAATGCTTCAG