seq1 = pF1KE0434.tfa, 945 bp
seq2 = pF1KE0434/gi568815583r_67102824.tfa (gi568815583r:67102824_67354631), 251808 bp

>pF1KE0434 945
>gi568815583r:67102824_67354631 (Chr15)

(complement)

1-73  (100001-100073)   100% ->
74-264  (117812-118002)   98% ->
265-361  (118128-118224)   100% ->
362-451  (118564-118653)   97% ->
452-535  (122735-122818)   100% ->
536-618  (145088-145170)   100% ->
619-715  (145974-146070)   100% ->
716-820  (150484-150588)   99% ->
821-870  (151035-151084)   100% ->
871-945  (151734-151808)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTGCTGGCGTACCCTGTGCGTTAGTCACCAGCTGCTCCTCCGTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTGCTGGCGTACCCTGTGCGTTAGTCACCAGCTGCTCCTCCGTCTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTCAGGAGACCAGCTGGTCCAAC         ATACCCTTGGAACAGAAG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||| ||||||||||||||
 100051 CTCAGGAGACCAGCTGGTCCAACGTG...TAGATATCCTTGGAACAGAAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ATCTTATTGCGGAAGTGACTTCCAATGATGCTGTGAGATTTTATCCCTGG
        ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117830 ATCTTATTGTGGAAGTGACTTCCAATGATGCTGTGAGATTTTATCCCTGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ACCATTGATAATAAATACTATTCAGCAGACATCAATCTATGTGTGGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117880 ACCATTGATAATAAATACTATTCAGCAGACATCAATCTATGTGTGGTGCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AAACAAATTTCTTGTTACTGCAGAGATTGCAGAATCTGTCCAAGCATTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117930 AAACAAATTTCTTGTTACTGCAGAGATTGCAGAATCTGTCCAAGCATTTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGGTTTACTTTGACAGCACACGA         AAATCGGGCCTTGATAGT
        ||||||||||||||||||||| |>>>...>>>||||||||||||||||||
 117980 TGGTTTACTTTGACAGCACACAAGTA...TAGAAATCGGGCCTTGATAGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GTCTCCTCATGGCTTCCACTGGCAAAAGCATGGTTACCTGAGGTGATGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118146 GTCTCCTCATGGCTTCCACTGGCAAAAGCATGGTTACCTGAGGTGATGAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CTTGGTCTGCGATAGAGTGTCTGAAGATG         GTATAAACCGAC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 118196 CTTGGTCTGCGATAGAGTGTCTGAAGATGGTA...TAGGTATAAACCGAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AAAAAGCTCAAGAATGGAGCCTCAAACATGGCTTTGAATTGGTAGAACTT
        ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||
 118576 AAAAAGCTCAAGAATGGTGCATCAAACATGGCTTTGAATTGGTAGAACTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AGTCCAGAGGAGTTGCCTGAGGAGGATG         ATGACTTCCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 118626 AGTCCAGAGGAGTTGCCTGAGGAGGATGGTA...TAGATGACTTCCCAGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 ATCTACAGGAGTAAAGCGAATTGTCCAAGCCCTGAATGCCAATGTGTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122748 ATCTACAGGAGTAAAGCGAATTGTCCAAGCCCTGAATGCCAATGTGTGGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 CCAATGTAGTGATGAAGAATG         ATAGGAACCAAGGCTTTAGC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 122798 CCAATGTAGTGATGAAGAATGGTA...CAGATAGGAACCAAGGCTTTAGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 CTTCTCAACTCATTGACTGGAACAAACCATAGCATTGGGTCAGCAGATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145108 CTTCTCAACTCATTGACTGGAACAAACCATAGCATTGGGTCAGCAGATCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 CTGTCACCCAGAG         CAACCCCATTTGCCAGCAGCAGATAGTA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 145158 CTGTCACCCAGAGGTA...CAGCAACCCCATTTGCCAGCAGCAGATAGTA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 CTGAATCCCTCTCTGATCATCGGGGTGGTGCATCTAACACAACAGATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146002 CTGAATCCCTCTCTGATCATCGGGGTGGTGCATCTAACACAACAGATGCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 CAGGTTGATAGCATTGTGG         ATCCCATGTTAGATCTGGATAT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 146052 CAGGTTGATAGCATTGTGGGTA...CAGATCCCATGTTAGATCTGGATAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 TCAAGAATTAGCCAGTCTTACCACTGGAGGAGGAGATGTGGAGAATTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150506 TCAAGAATTAGCCAGTCTTACCACTGGAGGAGGAGATGTGGAGAATTTTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 AAAGACCCTTTTCAAAGTTAAAGGAAATGAAAG         ACAAGGCT
        |||||| ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 150556 AAAGACTCTTTTCAAAGTTAAAGGAAATGAAAGGTA...TAGACAAGGCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 GCGACGCTTCCTCATGAGCAAAGAAAAGTGCATGCAGAAAAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 151043 GCGACGCTTCCTCATGAGCAAAGAAAAGTGCATGCAGAAAAGGTG...CA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    871  GTGGCCAAAGCATTCTGGATGGCAATCGGGGGAGACAGAGATGAAATTG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151733 GGTGGCCAAAGCATTCTGGATGGCAATCGGGGGAGACAGAGATGAAATTG

   1000     .    :    .    :    .
    920 AAGGCCTTTCATCTGATGGAGAGCAC
        |||||||||||||||||| |||||||
 151783 AAGGCCTTTCATCTGATGAAGAGCAC