seq1 = pF1KE0429.tfa, 1284 bp
seq2 = pF1KE0429/gi568815576f_21182881.tfa (gi568815576f:21182881_21384164), 201284 bp

>pF1KE0429 1284
>gi568815576f:21182881_21384164 (Chr22)

1-1284  (100001-101284)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACTCTCTGTGGGGCCCAGGAGCCGGGAGTCACCCCTTTGGGGTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGACTCTCTGTGGGGCCCAGGAGCCGGGAGTCACCCCTTTGGGGTCCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAACACCCGGCTGTCCCCAGACTTGTGTCCAGGGAAGATAGTGTTGAGGG
        ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAACAGCCGGCTGTCCCCAGACTTGTGTCCAGGGAAGATAGTGTTGAGGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCCTCAAGGAGAGCGGGGCAGGGATGCCTGAGCAGGACAAGGACCCTAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCCTCAAGGAGAGCGGGGCAGGGATGCCTGAGCAGGACAAGGACCCTAGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTCCAAGAGAATCCTGGTGATCAGAGAAGGGTCCCCGAGGTCACCGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTCCAAGAGAATCCTGGTGATCAGAGAAGGGTCCCCGAGGTCACCGGGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGCACGGCCTGCATTTCGGCCCCTGCGGGACAATGGAGGCCTCTCTCCCT
        ||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
 100201 TGCACCGTCTGCATTTCGGCCCCTGCGGGACAATAGAGGCCTCTCTCCCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TTGTGCCCGGGCCCGGGCCTCTGCAGACAGACCTCCATGCCCAGAGGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TTGTGCCCGGGCCCGGGCCTCTGCAGACAGACCTCCATGCCCAGAGGTCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GAAATCAGATATAACCAGACATCCCAGACCTCCTGGACGAGCTCCTGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GAAATCAGATATAACCAGACATCCCAGACCTCCTGGACGAGCTCCTGCAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CAACCGAAATGCCATCTCCAGCTCCTACAGCTCCACGGGAGGCTTGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CAACCGAAATGCCATCTCCAGCTCCTACAGCTCCACGGGAGGCTTGCCGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GGCTAAAGCGGAGGAGGGGGCCAGCCTCATCCCACTGCCAGCTGACCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GGCTAAAGCGGAGGAGGGGGCCAGCCTCATCCCACTGCCAGCTGACCCTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AGTTCCTCAAAGACAGTGAGTGAGGACAGGCCTCAGGCTGTCTCTTCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AGTTCCTCAAAGACAGTGAGTGAGGACAGGCCTCAGGCTGTCTCTTCAGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TCACACCCAGTGTGAAAAGGCAGCAGATATAGCACCAGGGCAGACACTCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| 
 100501 TCACACCCAGTGTGAAAAGGCAGCAGATATAGCACCAGGGTAGACACTCG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CCCTCAGGAATGACTCCTCCACATCCGAGGCCTCTAGGCCCAGTACACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CCCTCAGGAATGACTCCTCCACATCCGAGGCCTCTAGGCCCAGTACACAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 AAGTTTCCCCTGCTGCCACGCAGGCGAGGGGAGCCTTTGATGCTGCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 AAGTTTCCCCTGCTGCCACGCAGGCGAGGGGAGCCTTTGATGCTGCCACC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TCCCTTAGAGCTGGGGTACCGGGTCACTGTTGAAGACCTGGACCGGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TCCCTTAGAGCTGGGGTACCGGGTCACTGTTGAAGACCTGGACCGGGAGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AGGAGGCGGCCTTCCAGCGCATCAACAGTGCACTGCAGGTTGAGGACAAG
        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AGGAGGCGGCATTCCAGCGCATCAACAGTGCACTGCAGGTTGAGGACAAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GCCATCTCGGACTGCAGACCCTCACGGCCTTCCCACACTTTGTCCTCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GCCATCTCGGACTGCAGACCCTCACGGCCTTCCCACACTTTGTCCTCACT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TGCAACAGGGGCTTCTGGTCTGCCTGCCGTTTCTAAAGCACCCAGTATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TGCAACAGGGGCTTCTGGTCTGCCTGCCGTTTCTAAAGCACCCAGTATGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 ATGCACAGCAGGAGACACACAAGTCCCAAGACTGCCTGGGCCTACTGGAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
 100851 ATGCACAGCAGGAGACACACAAGTCCCAAGACTGCCTGGGCCTACTGGCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CCCTTAGCATCTGCTGCAGGGGTCCCCTCTACAGCTCCCATGTCTGGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CCCTTAGCATCTGCTGCAGGGGTCCCCTCTACAGCTCCCATGTCTGGGAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GAAGCACAGACCACCAGGCCCCCTGTTCTCCTCCTCAGATCCCCTTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GAAGCACAGACCACCAGGCCCCCTGTTCTCCTCCTCAGATCCCCTTCCTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 CCACCTCTTCTGATTCCCAGGACTCAGCCCAGGTCACCTCGCTGATTCCT
        ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 CCACCTCTTCCCATTCCCAGGACTCAGCCCAGGTCACCTCGCTGATTCCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GCCCCCTTCCCAGCTGCAAGCATGGATGCGGGCATGAGAAGAACAAGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
 101051 GCCCCCTTCCCAGCTGCAAGCATGGATGCGGGCATGAGAAGAACAAGGTG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 TGGCACTTCTGCTCCTGCAGCTGCCGCAGCAGCCCCTCCCCGCTCCACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
 101101 TGGCACTTCTGCTCCTGCAGCTGCCGCAGCAGCCCCTCCCCCCTCCACAT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 TGAACCCCACGTTGGGGTCACTACTGGAGTGGATGGAGGCCCTTCACATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 TGAACCCCACGTTGGGGTCACTACTGGAGTGGATGGAGGCCCTTCACATT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 TCTGGGCCTCAGCCACAGCTGCAGCAGGTGCCCAGAGGTCAGAACCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 TCTGGGCCTCAGCCACAGCTGCAGCAGGTGCCCAGAGGTCAGAACCAGAG

   1250     .    :    .    :    .    :
   1251 ATCCCAGACCTCCTGGACCAGCTCGTGCCCCAAA
        ||||||||||||| ||||||||||||||||||||
 101251 ATCCCAGACCTCCCGGACCAGCTCGTGCCCCAAA