seq1 = pF1KE0423.tfa, 705 bp
seq2 = pF1KE0423/gi568815575r_153829990.tfa (gi568815575r:153829990_154034476), 204487 bp

>pF1KE0423 705
>gi568815575r:153829990_154034476 (ChrX)

(complement)

1-21  (99573-99593)   100% ->
22-120  (100002-100100)   100% ->
121-179  (100476-100534)   100% ->
180-225  (101893-101938)   100% ->
226-341  (102046-102161)   100% ->
342-386  (102362-102406)   100% ->
387-471  (103630-103714)   100% ->
472-705  (104254-104487)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAACATCCGCAATGCGAGG         CCAGAGGACCTAATGAACAT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
  99573 ATGAACATCCGCAATGCGAGGGTG...CAGCCAGAGGACCTAATGAACAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 GCAGCACTGCAACCTCCTCTGCCTGCCCGAGAACTACCAGATGAAATACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100022 GCAGCACTGCAACCTCCTCTGCCTGCCCGAGAACTACCAGATGAAATACT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ACTTCTACCATGGCCTTTCCTGGCCCCAG         CTCTCTTACATT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 100072 ACTTCTACCATGGCCTTTCCTGGCCCCAGGTG...CAGCTCTCTTACATT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 GCTGAGGACGAGAATGGGAAGATTGTGGGGTATGTCCTGGCCAAAAT   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 100488 GCTGAGGACGAGAATGGGAAGATTGTGGGGTATGTCCTGGCCAAAATGTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    180       GGAAGAGGACCCAGATGATGTGCCCCATGGACATATCACCTCAT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100538 ...CAGGGAAGAGGACCCAGATGATGTGCCCCATGGACATATCACCTCAT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 TG         GCTGTGAAGCGTTCCCACCGGCGCCTCGGTCTGGCTCAG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101937 TGGTA...CAGGCTGTGAAGCGTTCCCACCGGCGCCTCGGTCTGGCTCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    265 AAACTGATGGACCAGGCCTCTCGAGCCATGATAGAGAACTTCAATGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102085 AAACTGATGGACCAGGCCTCTCGAGCCATGATAGAGAACTTCAATGCCAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 ATATGTCTCCCTGCATGTCAGGAAGAG         TAACCGGGCCGCCC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 102135 ATATGTCTCCCTGCATGTCAGGAAGAGGTG...CAGTAACCGGGCCGCCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    356 TGCACCTCTATTCCAACACCCTCAACTTTCA         GATCAGTGAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 102376 TGCACCTCTATTCCAACACCCTCAACTTTCAGTA...CAGGATCAGTGAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    397 GTGGAGCCCAAATACTATGCAGATGGGGAGGACGCCTATGCCATGAAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103640 GTGGAGCCCAAATACTATGCAGATGGGGAGGACGCCTATGCCATGAAGCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    447 GGACCTCACTCAGATGGCCGACGAG         CTGAGGCGGCACCTGG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 103690 GGACCTCACTCAGATGGCCGACGAGGTA...CAGCTGAGGCGGCACCTGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    488 AGCTGAAAGAGAAGGGCAGGCACGTGGTGCTGGGTGCCATCGAGAACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104270 AGCTGAAAGAGAAGGGCAGGCACGTGGTGCTGGGTGCCATCGAGAACAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    538 GTGGAGAGCAAAGGCAATTCACCTCCGAGCTCAGGAGAGGCCTGTCGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104320 GTGGAGAGCAAAGGCAATTCACCTCCGAGCTCAGGAGAGGCCTGTCGCGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    588 GGAGAAGGGCCTGGCTGCCGAGGATAGTGGTGGGGACAGCAAGGACCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104370 GGAGAAGGGCCTGGCTGCCGAGGATAGTGGTGGGGACAGCAAGGACCTCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    638 GCGAGGTCAGCGAGACCACAGAGAGCACAGATGTCAAGGACAGCTCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104420 GCGAGGTCAGCGAGACCACAGAGAGCACAGATGTCAAGGACAGCTCAGAG

    750     .    :    .
    688 GCCTCCGACTCAGCCTCC
        ||||||||||||||||||
 104470 GCCTCCGACTCAGCCTCC