seq1 = pF1KE0421.tfa, 567 bp
seq2 = pF1KE0421/gi568815593f_73408685.tfa (gi568815593f:73408685_73609251), 200567 bp

>pF1KE0421 567
>gi568815593f:73408685_73609251 (Chr5)

1-567  (100001-100567)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAAACATCTGCCCCACGTGCCGGAAGCCAAGTGGTGGCGACAACTGC
        ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAAACATCTGCCACACGTGCCGGAAGCCAAGTGGTGGCGACAACTGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCGCCACTCCGCGGCCTACCGCGCAGATCCTCTACGTGTGTCCTCGCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCGCCACTCCGCGGCCTACCGCGCAGATCCTCTACGTGTGTCCTCGCGAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACAAGCTCACCGAAATGGCCGCGTCCAGTCAAGGAAACTTTGAGGGAAAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
 100101 ACAAGCTCACCGAAATGGCCGCGTCCAGTCAAGGAAACATTGAGGGAAAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTTGAGTCACTGGACCTTGCGGAATTTGCTAAGAAGCAGCCATGGTGGCG
        |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTTGAGTCACTGGACCTTACGGAATTTGCTAAGAAGCAGCCATGGTGGCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TAAGCTGTTCGGGCAGGAATCTGGACCTTCAGCAGAAAAGTATAGCGTGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
 100201 TAAGCTGTTCGGGCAGGAATCTGGACCTTCAGCAGAAAAGTATAGCATGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CAACCCAGCTGTTCATTGGAGGTGTCACTGGATGGTGCACAGGTTTCATA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||
 100251 CAACCCAGCTGTTCATTGGAGGTGTCACTGGATGGTGCATGGGTTTCATA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TTCCAGAAGGTTGGAAAGTTGGCTGCAACAGCTGTGGGAGGTGGATTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
 100301 TTCCAGAAGGTTGGAAAGTTGGCTGCAACAGCTGTGGGAGGTGGATTTTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TCTCCTTCAGCTTGCAAACCATACTGGGTACATCAAAGTTGACTGGCAAC
        |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
 100351 TCTCCTTCAGCTTGCAAACCATACTGGGTATATCAAAGTTGACTGGCAAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GAGTGGAGAAGGACATGAAGAAAGCCAAAGAGCAGCTGAAGATCCGTAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GAGTGGAGAAGGACATGAAGAAAGCCAAAGAGCAGCTGAAGATCCGTAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AGCAATCAGATACCTACTGAGGTCAGGAGCAAAGCTGAGGAGGTGGTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AGCAATCAGATACCTACTGAGGTCAGGAGCAAAGCTGAGGAGGTGGTGTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 ATTTGTGAAGAAGAATGTTCTAGTAACTGGGGGATTTTTCGGAGGCTTTC
        |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
 100501 ATTTGTGAAGAAGAATGTTCTAGTGACTGGGGGATTTTTCGGAGGCTTTC

    550     .    :    .
    551 TGCTTGGCATGGCATCC
        |||||||||||||||||
 100551 TGCTTGGCATGGCATCC