seq1 = pF1KE0420.tfa, 618 bp
seq2 = pF1KE0420/gi568815581r_74671727.tfa (gi568815581r:74671727_74875698), 203972 bp

>pF1KE0420 618
>gi568815581r:74671727_74875698 (Chr17)

(complement)

1-77  (100001-100077)   100% ->
78-187  (102014-102123)   100% ->
188-331  (102660-102803)   100% ->
332-391  (103422-103481)   98% ->
392-486  (103645-103739)   98% ->
487-618  (103841-103972)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGGTTGAATCAGAACACCTTGCTGCTGGGGAAGAAGGTGGTCCTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGGTTGAATCAGAACACCTTGCTGCTGGGGAAGAAGGTGGTCCTTGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ACCCTACACCTCGGAGCATGTGCCCAG         GTACCACGAGTGGA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 100051 ACCCTACACCTCGGAGCATGTGCCCAGGTA...CAGGTACCACGAGTGGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGAAATCAGAGGAGCTGCAGCGTTTGACAGCCTCGGAGCCGCTGACCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102028 TGAAATCAGAGGAGCTGCAGCGTTTGACAGCCTCGGAGCCGCTGACCCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAGCAGGAGTATGCCATGCAGTGCAGCTGGCAGGAAGATGCAGACA    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 102078 GAGCAGGAGTATGCCATGCAGTGCAGCTGGCAGGAAGATGCAGACAGTG.

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    188      AGTGTACCTTCATTGTGCTGGATGCCGAGAAGTGGCAGGCCCAGC
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102128 ..CAGAGTGTACCTTCATTGTGCTGGATGCCGAGAAGTGGCAGGCCCAGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CAGGCGCCACCGAAGAGAGCTGCATGGTGGGAGATGTGAACCTCTTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102705 CAGGCGCCACCGAAGAGAGCTGCATGGTGGGAGATGTGAACCTCTTCCTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ACAGATCTAGAAGACCTCACCTTGGGGGAGATCGAGGTCATGATTGCAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 102755 ACAGATCTAGAAGACCTCACCTTGGGGGAGATCGAGGTCATGATTGCAGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    332         AGCCCAGCTGCAGGGGTAAGGGCCTTGGCACTGAGGCCGTTC
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102805 TT...TAGAGCCCAGCTGCAGGGGTAAGGGCCTTGGCACTGAGGCCGTTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CCGCGATGCTGTCTTACG         GAGTGACCACGCTAGGTCTGACC
         |||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 103464 TCGCGATGCTGTCTTACGGTA...GAGGAGTGACCACGCTAGGTCTGACC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 AAGTTTGAGGCTAAAATTGGGCAAGGAAATGGACCAAGCATCCGGATGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
 103668 AAGTTTGAGGCTAAAATTGGGCAAGGAAATGAACCAAGCATCCGGATGTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CCAGAAACTTCACTTTGAGCAG         GTGGCTACGAGCAGTGTTT
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 103718 CCAGAAACTTCACTTTGAGCAGGTA...TAGGTGGCTACGAGCAGTGTTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 TTCAGGAGGTGACCCTCAGACTGACAGTGAGTGAGTCCGAGCATCAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103860 TTCAGGAGGTGACCCTCAGACTGACAGTGAGTGAGTCCGAGCATCAGTGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 CTTCTGGAGCAGACCAGCCACGTGGAAGAGAAGCCTTACAGAGATGGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103910 CTTCTGGAGCAGACCAGCCACGTGGAAGAGAAGCCTTACAGAGATGGGTC

    650     .    :
    606 GGCAGAGCCCTGC
        |||||||||||||
 103960 GGCAGAGCCCTGC