seq1 = pF1KE0419.tfa, 483 bp
seq2 = pF1KE0419/gi568815587r_119319411.tfa (gi568815587r:119319411_119520905), 201495 bp

>pF1KE0419 483
>gi568815587r:119319411_119520905 (Chr11)

(complement)

1-37  (100001-100037)   100% ->
38-373  (100520-100855)   100% ->
374-483  (101386-101495)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAACCTGGCCATCAGCATCGCTCTCCTGCTAACAG         TCTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 100001 ATGAACCTGGCCATCAGCATCGCTCTCCTGCTAACAGGTA...CAGTCTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 GCAGGTCTCCCGAGGGCAGAAGGTGACCAGCCTAACGGCCTGCCTAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100524 GCAGGTCTCCCGAGGGCAGAAGGTGACCAGCCTAACGGCCTGCCTAGTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ACCAGAGCCTTCGTCTGGACTGCCGCCATGAGAATACCAGCAGTTCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100574 ACCAGAGCCTTCGTCTGGACTGCCGCCATGAGAATACCAGCAGTTCACCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATCCAGTACGAGTTCAGCCTGACCCGTGAGACAAAGAAGCACGTGCTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100624 ATCCAGTACGAGTTCAGCCTGACCCGTGAGACAAAGAAGCACGTGCTCTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGGCACTGTGGGGGTGCCTGAGCACACATACCGCTCCCGAACCAACTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100674 TGGCACTGTGGGGGTGCCTGAGCACACATACCGCTCCCGAACCAACTTCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CCAGCAAATACAACATGAAGGTCCTCTACTTATCCGCCTTCACTAGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100724 CCAGCAAATACAACATGAAGGTCCTCTACTTATCCGCCTTCACTAGCAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GACGAGGGCACCTACACGTGTGCACTCCACCACTCTGGCCATTCCCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100774 GACGAGGGCACCTACACGTGTGCACTCCACCACTCTGGCCATTCCCCACC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CATCTCCTCCCAGAACGTCACAGTGCTCAGAG         ACAAACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 100824 CATCTCCTCCCAGAACGTCACAGTGCTCAGAGGTG...CAGACAAACTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TCAAGTGTGAGGGCATCAGCCTGCTGGCTCAGAACACCTCGTGGCTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101395 TCAAGTGTGAGGGCATCAGCCTGCTGGCTCAGAACACCTCGTGGCTGCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CTGCTCCTGCTCTCCCTCTCCCTCCTCCAGGCCACGGATTTCATGTCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101445 CTGCTCCTGCTCTCCCTCTCCCTCCTCCAGGCCACGGATTTCATGTCCCT

    500 
    483 G
        |
 101495 G