seq1 = pF1KE0418.tfa, 1269 bp
seq2 = pF1KE0418/gi568815591r_98748059.tfa (gi568815591r:98748059_98969861), 221803 bp

>pF1KE0418 1269
>gi568815591r:98748059_98969861 (Chr7)

(complement)

1-85  (100001-100085)   100% ->
86-391  (106462-106767)   99% ->
392-551  (109524-109683)   100% ->
552-718  (113679-113845)   100% ->
719-803  (114538-114622)   100% ->
804-1006  (118239-118441)   100% ->
1007-1119  (121167-121279)   100% ->
1120-1269  (121654-121803)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCCAGGCAGTGTGGTCGCGCCTCGGCCGCATCCTCTGGCTTGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCCAGGCAGTGTGGTCGCGCCTCGGCCGCATCCTCTGGCTTGCCTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTCCTGCCCTGGGCCCCGGCAGGGGTGGCCGCAG         GCCTGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 100051 CCTCCTGCCCTGGGCCCCGGCAGGGGTGGCCGCAGGTA...TAGGCCTGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ATGAACTCAATCTCACCACCGATAGCCCTGCCACCACGGGAGCGGTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106468 ATGAACTCAATCTCACCACCGATAGCCCTGCCACCACGGGAGCGGTGGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ACCATCTCGGCCAGCCTGGTGGCCAAGGACAACGGCAGCCTGGCCCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106518 ACCATCTCGGCCAGCCTGGTGGCCAAGGACAACGGCAGCCTGGCCCTGCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CGCTGACGCCCACCTCTACCGCTTCCACTGGATCCACACCCCGCTGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106568 CGCTGACGCCCACCTCTACCGCTTCCACTGGATCCACACCCCGCTGGTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TTACTGGCAAGATGGAGAAGGGTCTCAGCTCCACCATCCGTGTTGTCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
 106618 TTACTGGCAAGATGGAGAAGGGTCTCAGCTCCACCATCCGTGTGGTCGGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CACGTGCCCGGGGAATTCCCGGTCTCTGTCTGGGTCACTGCCGCTGACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106668 CACGTGCCCGGGGAATTCCCGGTCTCTGTCTGGGTCACTGCCGCTGACTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CTGGATGTGCCAGCCTGTGGCCAGGGGCTTTGTGGTCCTCCCCATCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106718 CTGGATGTGCCAGCCTGTGGCCAGGGGCTTTGTGGTCCTCCCCATCACAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392          AGTTCCTCGTGGGGGACCTTGTTGTCACCCAGAACACTTCC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106768 GTG...CAGAGTTCCTCGTGGGGGACCTTGTTGTCACCCAGAACACTTCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CTACCCTGGCCCAGCTCCTATCTCACTAAGACCGTCCTGAAAGTCTCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109565 CTACCCTGGCCCAGCTCCTATCTCACTAAGACCGTCCTGAAAGTCTCCTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CCTCCTCCACGACCCGAGCAACTTCCTCAAGACCGCCTTGTTTCTCTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109615 CCTCCTCCACGACCCGAGCAACTTCCTCAAGACCGCCTTGTTTCTCTACA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 GCTGGGACTTCGGGGACGG         GACCCAGATGGTGACTGAAGAC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 109665 GCTGGGACTTCGGGGACGGGTA...CAGGACCCAGATGGTGACTGAAGAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 TCCGTGGTCTATTATAACTATTCCATCATCGGGACCTTCACCGTGAAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113701 TCCGTGGTCTATTATAACTATTCCATCATCGGGACCTTCACCGTGAAGCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CAAAGTGGTGGCGGAGTGGGAAGAGGTGGAGCCGGATGCCACGAGGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113751 CAAAGTGGTGGCGGAGTGGGAAGAGGTGGAGCCGGATGCCACGAGGGCTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 TGAAGCAGAAGACCGGGGACTTCTCCGCCTCGCTGAAGCTGCAGG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 113801 TGAAGCAGAAGACCGGGGACTTCTCCGCCTCGCTGAAGCTGCAGGGTG..

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    719     AAACCCTTCGAGGCATCCAAGTGTTGGGGCCCACCCTAATTCAGAC
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113851 .CAGAAACCCTTCGAGGCATCCAAGTGTTGGGGCCCACCCTAATTCAGAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 CTTCCAAAAGATGACCGTGACCTTGAACTTCCTGGGGAG         CC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 114584 CTTCCAAAAGATGACCGTGACCTTGAACTTCCTGGGGAGGTA...CAGCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 CTCCTCTGACTGTGTGCTGGCGTCTCAAGCCTGAGTGCCTCCCGCTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118241 CTCCTCTGACTGTGTGCTGGCGTCTCAAGCCTGAGTGCCTCCCGCTGGAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 GAAGGGGAGTGCCACCCTGTGTCCGTGGCCAGCACAGCGTACAACCTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118291 GAAGGGGAGTGCCACCCTGTGTCCGTGGCCAGCACAGCGTACAACCTGAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 CCACACCTTCAGGGACCCTGGGGACTACTGCTTCAGCATCCGGGCCGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118341 CCACACCTTCAGGGACCCTGGGGACTACTGCTTCAGCATCCGGGCCGAGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 ATATCATCAGCAAGACACATCAGTACCACAAGATCCAGGTGTGGCCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118391 ATATCATCAGCAAGACACATCAGTACCACAAGATCCAGGTGTGGCCCTCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 A         GAATCCAGCCGGCTGTCTTTGCTTTCCCATGTGCTACACT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118441 AGTA...CAGGAATCCAGCCGGCTGTCTTTGCTTTCCCATGTGCTACACT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 TATCACTGTGATGTTGGCCTTCATCATGTACATGACCCTGCGGAATGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121207 TATCACTGTGATGTTGGCCTTCATCATGTACATGACCCTGCGGAATGCCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 CTCAGCAAAAGGACATGGTGGAG         AACCCGGAGCCACCCTCT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 121257 CTCAGCAAAAGGACATGGTGGAGGTG...AAGAACCCGGAGCCACCCTCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 GGGGTCAGGTGCTGCTGCCAGATGTGCTGTGGGCCTTTCTTGCTGGAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121672 GGGGTCAGGTGCTGCTGCCAGATGTGCTGTGGGCCTTTCTTGCTGGAGAC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 TCCATCTGAGTACCTGGAAATTGTTCGTGAGAACCACGGGCTGCTCCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121722 TCCATCTGAGTACCTGGAAATTGTTCGTGAGAACCACGGGCTGCTCCCGC

   1300     .    :    .    :    .    :
   1238 CCCTCTATAAGTCTGTCAAAACTTACACCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||
 121772 CCCTCTATAAGTCTGTCAAAACTTACACCGTG